MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 chromosome

Total Repeats: 217

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001318	AT	3	6	82	87	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_001318	TA	3	6	1798	1803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_001318	AT	3	6	1900	1905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_001318	AT	3	6	2037	2042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_001318	AT	4	8	2379	2386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_001318	AT	3	6	2871	2876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_001318	AT	3	6	8362	8367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_001318	TA	3	6	20051	20056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_001318	GT	3	6	20187	20192	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_001318	AT	3	6	20882	20887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_001318	TA	3	6	20930	20935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_001318	AT	3	6	49299	49304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_001318	TA	3	6	49326	49331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_001318	AT	3	6	59088	59093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_001318	CT	3	6	74948	74953	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_001318	TA	3	6	83940	83945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_001318	TG	3	6	85798	85803	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_001318	AT	3	6	86860	86865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_001318	AC	3	6	101413	101418	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_001318	TA	3	6	105860	105865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_001318	TA	3	6	112826	112831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_001318	AT	3	6	114762	114767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_001318	AT	3	6	117265	117270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_001318	AT	3	6	117382	117387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_001318	AT	3	6	117422	117427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_001318	AC	3	6	120626	120631	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_001318	AT	3	6	131130	131135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_001318	TA	3	6	131155	131160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_001318	TA	3	6	133856	133861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_001318	AT	3	6	138215	138220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_001318	TA	3	6	139881	139886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_001318	TA	3	6	140704	140709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_001318	AT	3	6	141304	141309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_001318	TA	4	8	141715	141722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_001318	CT	3	6	141774	141779	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_001318	AG	3	6	160075	160080	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_001318	AT	3	6	164863	164868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_001318	TA	3	6	171136	171141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_001318	CA	3	6	175011	175016	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_001318	TA	3	6	189861	189866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_001318	CA	3	6	189995	190000	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_001318	AC	3	6	193508	193513	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_001318	TA	4	8	193542	193549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_001318	AT	3	6	202636	202641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_001318	AT	3	6	202837	202842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_001318	AT	4	8	206076	206083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_001318	AC	3	6	206163	206168	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_001318	AT	3	6	206284	206289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_001318	AT	3	6	208648	208653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_001318	AG	3	6	208685	208690	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_001318	AG	3	6	209045	209050	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_001318	TA	3	6	229201	229206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_001318	TA	3	6	231557	231562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_001318	AT	3	6	238255	238260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_001318	AT	3	6	242382	242387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_001318	TA	4	8	253044	253051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_001318	CT	3	6	267314	267319	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_001318	CT	3	6	268065	268070	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_001318	CA	3	6	268207	268212	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_001318	AT	3	6	269166	269171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_001318	CA	3	6	269264	269269	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_001318	TA	3	6	303768	303773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_001318	AT	3	6	318040	318045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_001318	AT	3	6	326674	326679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_001318	CT	3	6	326691	326696	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_001318	AT	3	6	327762	327767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_001318	TA	3	6	334894	334899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_001318	AT	3	6	334928	334933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_001318	AT	3	6	366198	366203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_001318	AC	3	6	374208	374213	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_001318	TA	3	6	379326	379331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_001318	AT	3	6	393004	393009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_001318	AT	3	6	397505	397510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_001318	AT	3	6	405208	405213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_001318	AT	3	6	416488	416493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_001318	AT	6	12	422736	422747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_001318	TA	3	6	427963	427968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_001318	AT	3	6	435354	435359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_001318	TC	3	6	436512	436517	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_001318	GC	3	6	436518	436523	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_001318	CT	3	6	436659	436664	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_001318	TA	3	6	437882	437887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_001318	TA	3	6	438299	438304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_001318	AT	4	8	438325	438332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_001318	AT	3	6	438599	438604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_001318	TC	3	6	439757	439762	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_001318	GC	3	6	439763	439768	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_001318	CT	3	6	439904	439909	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_001318	TA	3	6	441127	441132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_001318	TA	3	6	441544	441549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_001318	AC	3	6	443274	443279	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_001318	AT	3	6	443490	443495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_001318	TC	3	6	444020	444025	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_001318	CT	3	6	444495	444500	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_001318	GT	3	6	444707	444712	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_001318	GT	3	6	444876	444881	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_001318	TA	3	6	445063	445068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_001318	TA	3	6	445106	445111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_001318	TA	3	6	445508	445513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_001318	TC	3	6	446172	446177	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_001318	AT	3	6	450891	450896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_001318	AT	3	6	450900	450905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_001318	TA	3	6	456511	456516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_001318	TA	3	6	458177	458182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_001318	AT	3	6	458241	458246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_001318	AT	3	6	474559	474564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_001318	GA	3	6	481062	481067	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_001318	TC	3	6	481142	481147	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_001318	GA	3	6	482201	482206	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_001318	TC	3	6	482279	482284	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_001318	TA	3	6	482527	482532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_001318	AT	4	8	484707	484714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_001318	AG	3	6	489700	489705	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_001318	TA	4	8	490602	490609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_001318	AT	3	6	492000	492005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_001318	AG	3	6	492173	492178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_001318	CT	3	6	496222	496227	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_001318	AT	4	8	509295	509302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_001318	AT	3	6	516015	516020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_001318	AT	3	6	516429	516434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_001318	AT	3	6	516443	516448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_001318	AG	3	6	526281	526286	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_001318	TA	3	6	527322	527327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_001318	TA	3	6	527559	527564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_001318	AT	3	6	528010	528015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_001318	TA	3	6	528071	528076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_001318	GT	3	6	531842	531847	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_001318	AT	3	6	532227	532232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_001318	TC	3	6	539693	539698	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_001318	AT	3	6	540100	540105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_001318	AT	3	6	540233	540238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_001318	TA	3	6	540519	540524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_001318	AT	3	6	540634	540639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_001318	TG	3	6	540932	540937	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_001318	AT	3	6	541017	541022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_001318	AT	3	6	541461	541466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_001318	AT	3	6	541867	541872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_001318	AT	3	6	551886	551891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_001318	TG	3	6	553893	553898	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_001318	AT	3	6	564438	564443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_001318	AT	3	6	569167	569172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_001318	AG	3	6	576562	576567	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_001318	AT	3	6	577294	577299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_001318	TA	3	6	584962	584967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_001318	AT	3	6	586170	586175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_001318	TA	3	6	590220	590225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_001318	TA	3	6	590272	590277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_001318	AT	3	6	599393	599398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_001318	TA	3	6	599452	599457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_001318	TA	3	6	618609	618614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_001318	TA	3	6	618721	618726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_001318	TA	3	6	621986	621991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_001318	AT	3	6	628984	628989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_001318	AT	3	6	629012	629017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_001318	AT	4	8	629022	629029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_001318	TA	3	6	629036	629041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_001318	TA	3	6	630715	630720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_001318	CT	3	6	642473	642478	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
159	NC_001318	TA	3	6	643276	643281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_001318	GA	3	6	645689	645694	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
161	NC_001318	AT	3	6	653822	653827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_001318	AT	3	6	661575	661580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_001318	TA	3	6	662589	662594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_001318	TC	3	6	668624	668629	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
165	NC_001318	TA	4	8	668937	668944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_001318	TA	3	6	669029	669034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_001318	AT	3	6	670177	670182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_001318	AT	3	6	670511	670516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_001318	TA	3	6	670707	670712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_001318	TC	3	6	671108	671113	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
171	NC_001318	AT	3	6	671526	671531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_001318	TA	5	10	671717	671726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_001318	AT	3	6	671728	671733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_001318	TA	3	6	673188	673193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_001318	AT	3	6	673273	673278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_001318	TA	3	6	674798	674803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_001318	AT	3	6	677876	677881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_001318	TA	3	6	688306	688311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_001318	AT	3	6	688468	688473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_001318	AT	3	6	695532	695537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_001318	TA	3	6	695554	695559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_001318	GA	3	6	697579	697584	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
183	NC_001318	TA	3	6	700943	700948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_001318	TA	5	10	705521	705530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_001318	CT	3	6	714784	714789	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
186	NC_001318	TA	3	6	731131	731136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_001318	TA	3	6	731167	731172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_001318	AT	3	6	746369	746374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_001318	TA	3	6	747102	747107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_001318	AG	3	6	747139	747144	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
191	NC_001318	AG	3	6	751080	751085	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
192	NC_001318	AG	3	6	751144	751149	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
193	NC_001318	AT	3	6	751176	751181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_001318	TA	3	6	762169	762174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_001318	AT	3	6	766725	766730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_001318	TA	3	6	768070	768075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_001318	AT	3	6	783269	783274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_001318	AT	3	6	793683	793688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_001318	TA	4	8	793790	793797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
200	NC_001318	AT	3	6	800403	800408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
201	NC_001318	AC	3	6	801829	801834	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
202	NC_001318	AT	3	6	809584	809589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
203	NC_001318	AT	3	6	818562	818567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
204	NC_001318	TA	3	6	829143	829148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
205	NC_001318	AT	3	6	862007	862012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
206	NC_001318	TA	3	6	888201	888206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
207	NC_001318	AT	3	6	899426	899431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
208	NC_001318	AT	3	6	903315	903320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
209	NC_001318	AT	3	6	903878	903883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
210	NC_001318	AT	3	6	904909	904914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
211	NC_001318	TA	3	6	905088	905093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
212	NC_001318	AT	3	6	906066	906071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
213	NC_001318	TA	3	6	906620	906625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
214	NC_001318	TA	3	6	906822	906827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
215	NC_001318	AT	3	6	907145	907150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
216	NC_001318	AT	3	6	909885	909890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
217	NC_001318	AT	4	8	910194	910201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.