MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Deinococcus radiodurans R1 chromosome 2

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001264	GCCCT	2	10	6807	6816	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2	NC_001264	AGCGA	2	10	26273	26282	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_001264	GCGCG	2	10	26421	26430	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4	NC_001264	ATATG	2	10	43451	43460	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_001264	GCCGG	2	10	69352	69361	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6	NC_001264	CCGGG	2	10	80350	80359	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7	NC_001264	CAGAC	2	10	94589	94598	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_001264	CCCCA	2	10	113262	113271	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
9	NC_001264	CGGCG	2	10	119521	119530	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10	NC_001264	GAGCG	2	10	134781	134790	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
11	NC_001264	CCTTA	2	10	142233	142242	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_001264	GTGCC	2	10	157667	157676	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_001264	AGCCA	2	10	158979	158988	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_001264	TTTGC	2	10	162652	162661	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_001264	CCGAC	2	10	162682	162691	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
16	NC_001264	GGCCG	2	10	162763	162772	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
17	NC_001264	GGCAG	2	10	164611	164620	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_001264	TTGCC	2	10	192728	192737	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_001264	CCGGC	2	10	204275	204284	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
20	NC_001264	AGCGA	2	10	217329	217338	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_001264	CGGGC	2	10	253507	253516	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
22	NC_001264	AAAGG	2	10	261039	261048	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_001264	ATGAG	2	10	261140	261149	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_001264	CCCCT	2	10	262726	262735	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
25	NC_001264	CATCG	2	10	266212	266221	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_001264	AAAAG	2	10	270032	270041	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_001264	TCGCT	2	10	273262	273271	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_001264	CCTCC	2	10	275883	275892	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
29	NC_001264	TCCCC	2	10	279538	279547	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
30	NC_001264	CTTTT	2	10	282763	282772	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_001264	GTCAG	2	10	282886	282895	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_001264	CTGAC	2	10	282910	282919	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_001264	CGGCG	2	10	288529	288538	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
34	NC_001264	CCGCA	2	10	290623	290632	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
35	NC_001264	GCCGC	2	10	290636	290645	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
36	NC_001264	CCTGT	2	10	294781	294790	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_001264	CGGGC	2	10	305368	305377	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
38	NC_001264	CGGCG	2	10	309401	309410	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
39	NC_001264	CCCCT	2	10	315175	315184	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
40	NC_001264	ATAGA	2	10	350580	350589	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_001264	GAGCG	2	10	370088	370097	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
42	NC_001264	CTGAG	2	10	390212	390221	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_001264	GGCGC	2	10	395915	395924	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
44	NC_001264	GCCAG	2	10	401344	401353	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.