MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168 chromosome

Total Repeats: 139

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000964	TTTCCC	2	12	3136	3147	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_000964	ATAAAT	2	12	45538	45549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_000964	AAGTAA	2	12	155006	155017	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_000964	CTGTTT	2	12	238547	238558	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_000964	AGGAAA	2	12	249909	249920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_000964	GTTTTT	2	12	283775	283786	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_000964	AAATGA	2	12	308216	308227	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_000964	TTCATT	2	12	338223	338234	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_000964	TTTTTA	2	12	369702	369713	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_000964	ATTTTT	2	12	376522	376533	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_000964	ATGATA	2	12	432275	432286	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_000964	TTTTTA	2	12	449563	449574	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_000964	TCCTTT	2	12	493451	493462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_000964	GATGTG	2	12	524390	524401	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_000964	GAAACA	2	12	524425	524436	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_000964	ATTTTT	2	12	529060	529071	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_000964	TAGCTG	2	12	553470	553481	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_000964	TGTTTT	2	12	581584	581595	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_000964	ATAAAT	2	12	598648	598659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_000964	CATTTT	2	12	658548	658559	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_000964	TTTTGA	2	12	697370	697381	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_000964	CTTTCT	2	12	706911	706922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_000964	TCTCCT	2	12	728583	728594	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_000964	TATTCA	2	12	786421	786432	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_000964	ACATAT	2	12	787923	787934	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_000964	TACTTT	2	12	854346	854357	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_000964	CAATGG	2	12	905781	905792	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_000964	ATTTAA	2	12	909925	909936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_000964	GAACAA	2	12	943791	943802	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_000964	GTGTTT	2	12	952975	952986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_000964	CTTTTT	2	12	954163	954174	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_000964	GCGGAA	2	12	962167	962178	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_000964	TAAAAA	2	12	989666	989677	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_000964	CTTTTT	2	12	1008555	1008566	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_000964	AATGAA	2	12	1018820	1018831	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_000964	TCTTTT	2	12	1073733	1073744	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_000964	CGGAAG	2	12	1074618	1074629	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_000964	GAAAAA	2	12	1093850	1093861	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_000964	TTTCTT	2	12	1094792	1094803	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_000964	GAATTT	2	12	1103047	1103058	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_000964	CTTTTT	2	12	1113972	1113983	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_000964	CGGACC	2	12	1153164	1153175	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
43	NC_000964	TTTAAG	2	12	1214166	1214177	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000964	GGTTAA	2	12	1228963	1228974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_000964	CTGAAG	2	12	1235859	1235870	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_000964	GAAAAA	2	12	1249350	1249361	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_000964	AAAAAG	2	12	1252707	1252718	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_000964	TTTGCA	2	12	1258360	1258371	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_000964	TATACT	2	12	1270574	1270585	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_000964	GTTAAC	2	12	1300407	1300418	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_000964	AATTCA	2	12	1385946	1385957	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_000964	ATTTGA	2	12	1443733	1443744	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_000964	TACATA	2	12	1444043	1444054	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_000964	ATAATT	2	12	1451220	1451231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_000964	AAAGGA	2	12	1461749	1461760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_000964	ATCATT	2	12	1483540	1483551	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_000964	ATCATT	2	12	1486974	1486985	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_000964	TTTGCT	2	12	1495462	1495473	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_000964	CTTTTT	2	12	1576013	1576024	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_000964	AATATG	2	12	1722818	1722829	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_000964	TCCTTC	2	12	1741578	1741589	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_000964	AACATG	2	12	1783669	1783680	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_000964	TTATGA	2	12	1861312	1861323	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_000964	CATCAC	2	12	1896160	1896171	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_000964	TGAAAT	2	12	1917232	1917243	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_000964	TTTTAA	2	12	1933122	1933133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_000964	AATTTC	2	12	1942474	1942485	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_000964	AAGAGA	2	12	2002605	2002616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_000964	ATCATT	2	12	2033660	2033671	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_000964	GAAAAA	2	12	2055744	2055755	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_000964	GTATAA	2	12	2057052	2057063	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_000964	TAAAAT	2	12	2058615	2058626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_000964	ATTTTC	2	12	2061582	2061593	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_000964	TAATGC	2	12	2069902	2069913	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_000964	CTTATC	2	12	2148485	2148496	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_000964	AAACGT	2	12	2162091	2162102	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_000964	TTTAGA	2	12	2167538	2167549	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_000964	ATTTAA	2	12	2186951	2186962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_000964	TTTATT	2	12	2190808	2190819	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_000964	TAATTT	2	12	2202767	2202778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_000964	TGGTCT	2	12	2204018	2204029	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_000964	ATTTTC	2	12	2221944	2221955	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_000964	ACAAAT	2	12	2222288	2222299	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_000964	TTTTTA	2	12	2240311	2240322	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_000964	TAATGA	2	12	2273613	2273624	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_000964	GAAAAT	2	12	2279808	2279819	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_000964	TTATGT	2	12	2306437	2306448	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_000964	TTATTT	2	12	2308419	2308430	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_000964	ATCTTC	2	12	2432967	2432978	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_000964	TTTCGA	2	12	2445034	2445045	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_000964	CTTTTC	2	12	2525713	2525724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_000964	TTCTAA	2	12	2599926	2599937	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_000964	TGACTT	2	12	2626025	2626036	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_000964	ACAGAC	2	12	2652919	2652930	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_000964	ATGCTT	2	12	2678826	2678837	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_000964	AAAGAA	2	12	2706949	2706960	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_000964	TTACAT	2	12	2714241	2714252	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_000964	GATTTT	2	12	2814712	2814723	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_000964	GTTCAC	2	12	2817976	2817987	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_000964	CAAAAA	2	12	2857712	2857723	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_000964	GCCGGA	2	12	2865295	2865306	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_000964	CCCTCT	2	12	2908102	2908113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_000964	CTCTTT	2	12	2955659	2955670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_000964	TTTAAG	2	12	2982449	2982460	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_000964	TATTCA	2	12	2983094	2983105	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_000964	CTTATC	2	12	3045198	3045209	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_000964	CATTAT	2	12	3054639	3054650	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_000964	TAAAAA	2	12	3061566	3061577	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_000964	AAAAGA	2	12	3088357	3088368	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_000964	ACAAGA	2	12	3119325	3119336	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_000964	CTTATA	2	12	3171727	3171738	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_000964	ATTATC	2	12	3292387	3292398	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_000964	CGCTGA	2	12	3312815	3312826	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_000964	GCCTCC	2	12	3327152	3327163	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_000964	GAAAAA	2	12	3360925	3360936	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_000964	AAAAAC	2	12	3441091	3441102	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_000964	CAAAAA	2	12	3491280	3491291	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_000964	GAAGTT	2	12	3492740	3492751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_000964	CTCAGT	2	12	3509772	3509783	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_000964	AAACAT	2	12	3562302	3562313	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_000964	TCTTTT	2	12	3568219	3568230	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_000964	CAGTAC	2	12	3615591	3615602	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_000964	ACATCC	2	12	3621682	3621693	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_000964	AAAAAC	2	12	3630959	3630970	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_000964	GTATAT	2	12	3631718	3631729	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_000964	ATATTT	2	12	3671749	3671760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_000964	ATTTAA	2	12	3681233	3681244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_000964	GTATAC	2	12	3712493	3712504	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_000964	TTTTAT	2	12	3717125	3717136	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_000964	TGAGGA	2	12	3788204	3788215	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_000964	TCAAAA	2	12	3802264	3802275	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_000964	TGCACC	2	12	4035747	4035758	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
133	NC_000964	TGATAA	2	12	4067130	4067141	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_000964	TCGCTC	2	12	4109617	4109628	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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137	NC_000964	TATCAA	2	12	4187264	4187275	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.