MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168 chromosome

Total Repeats: 532

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000964	TCGTG	2	10	10889	10898	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_000964	GGACG	2	10	11762	11771	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3	NC_000964	GAAAA	2	10	30110	30119	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_000964	TCGTG	2	10	31357	31366	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_000964	GGACG	2	10	32230	32239	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6	NC_000964	ATAGG	2	10	48554	48563	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_000964	AAAGT	2	10	79052	79061	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_000964	TCGTG	2	10	91614	91623	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_000964	GGACG	2	10	92307	92316	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
10	NC_000964	AATAG	2	10	96041	96050	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_000964	TCGTG	2	10	97470	97479	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_000964	GGACG	2	10	98163	98172	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
13	NC_000964	TATAA	2	10	101283	101292	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_000964	ACATG	2	10	111020	111029	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_000964	TGACA	2	10	119813	119822	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_000964	TTACG	2	10	119934	119943	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_000964	TTGTG	2	10	153775	153784	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_000964	TTGGG	2	10	154720	154729	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_000964	TCGTG	2	10	161970	161979	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_000964	GGACG	2	10	162663	162672	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
21	NC_000964	AATTG	2	10	166055	166064	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_000964	AATAG	2	10	166149	166158	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_000964	TCGTG	2	10	167578	167587	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_000964	GGACG	2	10	168271	168280	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
25	NC_000964	TCGTG	2	10	172575	172584	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_000964	GGACG	2	10	173267	173276	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
27	NC_000964	AATAA	2	10	176611	176620	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_000964	CAATA	2	10	176949	176958	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_000964	TTTTC	2	10	176990	176999	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_000964	TAAAA	2	10	177011	177020	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_000964	CAATA	2	10	177029	177038	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_000964	CCCCT	2	10	191163	191172	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
33	NC_000964	TGCTT	2	10	194043	194052	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_000964	ATAAA	2	10	194062	194071	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_000964	ACAAG	2	10	199867	199876	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_000964	CTTGT	2	10	199964	199973	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_000964	ATTCA	2	10	203682	203691	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_000964	TAAAG	2	10	205171	205180	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_000964	TTTCA	2	10	211335	211344	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_000964	AAAGT	2	10	231278	231287	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_000964	TTATT	2	10	254841	254850	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_000964	AAAGG	2	10	258937	258946	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_000964	TTGCT	2	10	276917	276926	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_000964	AGCTG	2	10	277330	277339	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_000964	ATTTG	2	10	282175	282184	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_000964	ATGCA	2	10	282942	282951	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_000964	AATTC	2	10	320789	320798	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_000964	GCGCA	2	10	340594	340603	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
49	NC_000964	AGCTG	2	10	370165	370174	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_000964	TTTTA	2	10	374550	374559	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_000964	GACAT	2	10	446147	446156	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_000964	TCACC	2	10	455942	455951	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
53	NC_000964	CAATT	2	10	463889	463898	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_000964	AAAGA	2	10	466022	466031	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_000964	ATTTT	2	10	486023	486032	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_000964	GGAAG	2	10	493539	493548	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
57	NC_000964	TGTTT	2	10	494436	494445	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_000964	ATAAA	2	10	508106	508115	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_000964	CACAA	2	10	529314	529323	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
60	NC_000964	ATTTT	2	10	548664	548673	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_000964	ACTTT	2	10	551426	551435	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_000964	AAAAT	2	10	556267	556276	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_000964	ATAAA	2	10	568251	568260	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_000964	TATCA	2	10	574460	574469	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_000964	TCAAA	2	10	581377	581386	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_000964	CAATT	2	10	596094	596103	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_000964	GCAAA	2	10	598626	598635	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_000964	GTACA	2	10	602738	602747	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_000964	AAAAT	2	10	608835	608844	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_000964	GCTAG	2	10	613403	613412	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_000964	GAAGG	2	10	613622	613631	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
72	NC_000964	AAACA	2	10	634951	634960	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_000964	TCGTG	2	10	636512	636521	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_000964	GGACG	2	10	637208	637217	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
75	NC_000964	AAACG	2	10	640489	640498	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_000964	AGTCT	2	10	652166	652175	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_000964	ATTTT	2	10	652277	652286	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_000964	TGTTT	2	10	659288	659297	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_000964	AATAA	2	10	659320	659329	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_000964	CATTT	2	10	663374	663383	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_000964	GTTCT	2	10	664051	664060	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_000964	CTTTC	2	10	664129	664138	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
83	NC_000964	CTAAT	2	10	664281	664290	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_000964	ATTTT	2	10	667435	667444	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_000964	GAAAT	2	10	676266	676275	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_000964	GAAAT	2	10	679042	679051	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_000964	CGCTC	2	10	687927	687936	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
88	NC_000964	TGACT	2	10	696097	696106	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_000964	AGGAA	2	10	721596	721605	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_000964	CAAAA	2	10	728399	728408	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_000964	CGCTC	2	10	736212	736221	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
92	NC_000964	CTTGG	2	10	737350	737359	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
93	NC_000964	TCTAT	2	10	746587	746596	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_000964	AACCA	2	10	752334	752343	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_000964	TAAAA	2	10	761621	761630	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_000964	GAAAG	2	10	784326	784335	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_000964	TTTGA	2	10	787609	787618	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_000964	CTTGG	2	10	790218	790227	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_000964	ACAGA	2	10	818989	818998	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_000964	ATTTT	2	10	822418	822427	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_000964	CTTTT	2	10	822632	822641	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_000964	TGTCT	2	10	844648	844657	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_000964	TTTGG	2	10	861533	861542	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_000964	GAAAA	2	10	861919	861928	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_000964	ATCTT	2	10	876113	876122	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_000964	GATTT	2	10	876411	876420	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_000964	AATTC	2	10	887351	887360	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_000964	AGTAA	2	10	893852	893861	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_000964	AAACA	2	10	928726	928735	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_000964	TCGTG	2	10	947775	947784	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
111	NC_000964	GGACG	2	10	948471	948480	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
112	NC_000964	AAGTT	2	10	953059	953068	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_000964	TTTTA	2	10	953113	953122	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_000964	CATCT	2	10	954506	954515	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
115	NC_000964	GTATA	2	10	966912	966921	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_000964	GTTTC	2	10	967160	967169	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_000964	ATCAT	2	10	997092	997101	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_000964	AATTG	2	10	1000331	1000340	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_000964	ATATT	2	10	1021012	1021021	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_000964	AAATA	2	10	1023308	1023317	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_000964	GAAAG	2	10	1027752	1027761	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_000964	AAAGA	2	10	1035234	1035243	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_000964	AGTGG	2	10	1054700	1054709	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
124	NC_000964	GGAAA	2	10	1056363	1056372	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_000964	AAATT	2	10	1071269	1071278	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_000964	ATAAA	2	10	1071895	1071904	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_000964	ATTAC	2	10	1071970	1071979	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_000964	AATAA	2	10	1073758	1073767	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_000964	AAAAT	2	10	1076496	1076505	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_000964	AATAA	2	10	1083199	1083208	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_000964	ATTGA	2	10	1089670	1089679	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_000964	AAGCG	2	10	1102529	1102538	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_000964	TTTAA	2	10	1112556	1112565	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_000964	CATAA	2	10	1115664	1115673	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_000964	TTTAT	2	10	1125106	1125115	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_000964	TTTCA	2	10	1130799	1130808	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_000964	ATTTT	2	10	1151041	1151050	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_000964	TTTTC	2	10	1171674	1171683	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_000964	TGTTT	2	10	1192665	1192674	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_000964	ATTCT	2	10	1204937	1204946	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_000964	CATAC	2	10	1204956	1204965	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
142	NC_000964	TTTCT	2	10	1205106	1205115	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_000964	TGTTT	2	10	1205937	1205946	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_000964	ACAGC	2	10	1214065	1214074	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
145	NC_000964	ATATC	2	10	1217128	1217137	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_000964	CTTTT	2	10	1219376	1219385	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_000964	GAAGG	2	10	1229051	1229060	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
148	NC_000964	TCATA	2	10	1235085	1235094	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_000964	AGTGT	2	10	1246826	1246835	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
150	NC_000964	TATGA	2	10	1247718	1247727	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
151	NC_000964	AAGGA	2	10	1252590	1252599	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
152	NC_000964	CCTTG	2	10	1253289	1253298	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
153	NC_000964	TATCA	2	10	1256037	1256046	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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155	NC_000964	AAGGT	2	10	1262722	1262731	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
156	NC_000964	TCATT	2	10	1263504	1263513	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
157	NC_000964	CGGCG	2	10	1266364	1266373	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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160	NC_000964	TTATT	2	10	1269684	1269693	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_000964	TACAT	2	10	1270457	1270466	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
162	NC_000964	CTTTT	2	10	1276856	1276865	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
163	NC_000964	ACTTG	2	10	1289999	1290008	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
164	NC_000964	GAGCG	2	10	1291069	1291078	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
165	NC_000964	AGAGG	2	10	1294120	1294129	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
166	NC_000964	ATACT	2	10	1297624	1297633	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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170	NC_000964	GAGTA	2	10	1318967	1318976	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_000964	AAATA	2	10	1411687	1411696	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_000964	TAAAA	2	10	1419018	1419027	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_000964	GTAAT	2	10	1419105	1419114	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_000964	CATAT	2	10	1455006	1455015	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
192	NC_000964	GTAAA	2	10	1467521	1467530	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
193	NC_000964	ATGAA	2	10	1483494	1483503	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
194	NC_000964	TAAGA	2	10	1518215	1518224	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_000964	ATTAT	2	10	1535841	1535850	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_000964	TAAAA	2	10	1537403	1537412	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_000964	TTATT	2	10	1559265	1559274	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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234	NC_000964	AAATT	2	10	1923118	1923127	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
235	NC_000964	AGTAT	2	10	1924432	1924441	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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239	NC_000964	CAAAT	2	10	1932591	1932600	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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270	NC_000964	ATTAC	2	10	2135388	2135397	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
271	NC_000964	TTTTC	2	10	2136527	2136536	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
272	NC_000964	TATGG	2	10	2138812	2138821	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
273	NC_000964	GTTTT	2	10	2151459	2151468	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
274	NC_000964	ATTTT	2	10	2153666	2153675	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_000964	CCCTT	2	10	2155255	2155264	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
276	NC_000964	TTATT	2	10	2157250	2157259	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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278	NC_000964	TAAAA	2	10	2167962	2167971	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_000964	CCATA	2	10	2169769	2169778	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
280	NC_000964	AGCCT	2	10	2193207	2193216	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
281	NC_000964	ATTTT	2	10	2193691	2193700	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_000964	TTTAA	2	10	2195085	2195094	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_000964	ACTTA	2	10	2195144	2195153	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
284	NC_000964	TTATT	2	10	2195795	2195804	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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