MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Madrid E chromosome

Total Repeats: 2465

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000963	TGAT	2	8	734	741	25 %	50 %	25 %	0 %	15603882
2	NC_000963	ATAA	2	8	815	822	75 %	25 %	0 %	0 %	15603882
3	NC_000963	ACAG	2	8	1629	1636	50 %	0 %	25 %	25 %	15603884
4	NC_000963	AGTA	2	8	2291	2298	50 %	25 %	25 %	0 %	15603885
5	NC_000963	TTAT	2	8	2602	2609	25 %	75 %	0 %	0 %	15603885
6	NC_000963	TAAT	2	8	2716	2723	50 %	50 %	0 %	0 %	15603885
7	NC_000963	TTAT	2	8	2824	2831	25 %	75 %	0 %	0 %	15603885
8	NC_000963	TATT	2	8	3544	3551	25 %	75 %	0 %	0 %	15603886
9	NC_000963	AGAA	2	8	4131	4138	75 %	0 %	25 %	0 %	15603887
10	NC_000963	AATA	2	8	5190	5197	75 %	25 %	0 %	0 %	15603887
11	NC_000963	TCAC	2	8	5229	5236	25 %	25 %	0 %	50 %	15603887
12	NC_000963	ACCT	2	8	6584	6591	25 %	25 %	0 %	50 %	15603888
13	NC_000963	ACCA	2	8	6668	6675	50 %	0 %	0 %	50 %	15603888
14	NC_000963	TAAA	2	8	6676	6683	75 %	25 %	0 %	0 %	15603888
15	NC_000963	ATAA	2	8	6839	6846	75 %	25 %	0 %	0 %	15603888
16	NC_000963	CCTG	2	8	7897	7904	0 %	25 %	25 %	50 %	15603890
17	NC_000963	CAAT	2	8	9862	9869	50 %	25 %	0 %	25 %	15603891
18	NC_000963	CATG	2	8	9885	9892	25 %	25 %	25 %	25 %	15603891
19	NC_000963	ATGA	2	8	9961	9968	50 %	25 %	25 %	0 %	15603891
20	NC_000963	TTGG	2	8	10133	10140	0 %	50 %	50 %	0 %	15603891
21	NC_000963	AAAT	2	8	10677	10684	75 %	25 %	0 %	0 %	15603891
22	NC_000963	TAAA	2	8	10957	10964	75 %	25 %	0 %	0 %	15603892
23	NC_000963	TAAA	2	8	10984	10991	75 %	25 %	0 %	0 %	15603892
24	NC_000963	AAAG	2	8	11261	11268	75 %	0 %	25 %	0 %	15603892
25	NC_000963	TCAT	2	8	11381	11388	25 %	50 %	0 %	25 %	15603892
26	NC_000963	TAAT	2	8	12431	12438	50 %	50 %	0 %	0 %	15603894
27	NC_000963	GCTT	2	8	12446	12453	0 %	50 %	25 %	25 %	15603894
28	NC_000963	AATA	2	8	13359	13366	75 %	25 %	0 %	0 %	15603895
29	NC_000963	GCTC	2	8	13563	13570	0 %	25 %	25 %	50 %	15603895
30	NC_000963	TAAG	2	8	15215	15222	50 %	25 %	25 %	0 %	15603896
31	NC_000963	AATA	2	8	15645	15652	75 %	25 %	0 %	0 %	15603896
32	NC_000963	GTAA	2	8	15793	15800	50 %	25 %	25 %	0 %	15603896
33	NC_000963	AGCA	2	8	16075	16082	50 %	0 %	25 %	25 %	15603897
34	NC_000963	AATT	2	8	16688	16695	50 %	50 %	0 %	0 %	15603897
35	NC_000963	AAAG	2	8	17158	17165	75 %	0 %	25 %	0 %	15603897
36	NC_000963	ATTC	2	8	17251	17258	25 %	50 %	0 %	25 %	15603897
37	NC_000963	TTCA	2	8	18303	18310	25 %	50 %	0 %	25 %	15603898
38	NC_000963	TAAA	2	8	18942	18949	75 %	25 %	0 %	0 %	15603898
39	NC_000963	TGAT	2	8	21833	21840	25 %	50 %	25 %	0 %	15603900
40	NC_000963	ATAC	2	8	22459	22466	50 %	25 %	0 %	25 %	15603902
41	NC_000963	AACT	2	8	22647	22654	50 %	25 %	0 %	25 %	15603902
42	NC_000963	AAAT	2	8	22881	22888	75 %	25 %	0 %	0 %	15603902
43	NC_000963	CACT	2	8	22977	22984	25 %	25 %	0 %	50 %	15603902
44	NC_000963	AAGT	2	8	23030	23037	50 %	25 %	25 %	0 %	15603902
45	NC_000963	ATTA	2	8	23412	23419	50 %	50 %	0 %	0 %	15603903
46	NC_000963	ATTT	2	8	23471	23478	25 %	75 %	0 %	0 %	15603904
47	NC_000963	TATT	2	8	23718	23725	25 %	75 %	0 %	0 %	15603904
48	NC_000963	AAAT	2	8	25619	25626	75 %	25 %	0 %	0 %	15603906
49	NC_000963	TTAA	2	8	27096	27103	50 %	50 %	0 %	0 %	15603908
50	NC_000963	TAGT	2	8	27259	27266	25 %	50 %	25 %	0 %	15603908
51	NC_000963	ATTT	2	8	27278	27285	25 %	75 %	0 %	0 %	15603908
52	NC_000963	TTGC	2	8	27553	27560	0 %	50 %	25 %	25 %	15603908
53	NC_000963	ATTT	2	8	27703	27710	25 %	75 %	0 %	0 %	15603908
54	NC_000963	TTCC	2	8	27793	27800	0 %	50 %	0 %	50 %	15603908
55	NC_000963	GCTT	2	8	27931	27938	0 %	50 %	25 %	25 %	15603908
56	NC_000963	TATT	2	8	32700	32707	25 %	75 %	0 %	0 %	15603910
57	NC_000963	ATTT	2	8	32841	32848	25 %	75 %	0 %	0 %	15603910
58	NC_000963	ATTT	2	8	33281	33288	25 %	75 %	0 %	0 %	15603911
59	NC_000963	AAAT	2	8	33305	33312	75 %	25 %	0 %	0 %	15603911
60	NC_000963	ATAA	2	8	33781	33788	75 %	25 %	0 %	0 %	15603911
61	NC_000963	AGCA	2	8	34269	34276	50 %	0 %	25 %	25 %	15603912
62	NC_000963	TTTC	2	8	34937	34944	0 %	75 %	0 %	25 %	15603913
63	NC_000963	ATTT	2	8	35802	35809	25 %	75 %	0 %	0 %	15603913
64	NC_000963	TTGA	2	8	36644	36651	25 %	50 %	25 %	0 %	15603914
65	NC_000963	AGTA	2	8	36763	36770	50 %	25 %	25 %	0 %	15603914
66	NC_000963	TACT	2	8	37113	37120	25 %	50 %	0 %	25 %	15603914
67	NC_000963	TAAA	2	8	38576	38583	75 %	25 %	0 %	0 %	15603915
68	NC_000963	GAGT	2	8	39870	39877	25 %	25 %	50 %	0 %	15603915
69	NC_000963	ATTA	2	8	41995	42002	50 %	50 %	0 %	0 %	15603916
70	NC_000963	ACTT	2	8	42943	42950	25 %	50 %	0 %	25 %	15603917
71	NC_000963	AATA	2	8	43432	43439	75 %	25 %	0 %	0 %	15603917
72	NC_000963	TAAA	2	8	43488	43495	75 %	25 %	0 %	0 %	15603917
73	NC_000963	AAAC	2	8	43785	43792	75 %	0 %	0 %	25 %	15603917
74	NC_000963	ATTT	3	12	43800	43811	25 %	75 %	0 %	0 %	15603917
75	NC_000963	TTTA	2	8	43987	43994	25 %	75 %	0 %	0 %	15603917
76	NC_000963	AGAA	2	8	45023	45030	75 %	0 %	25 %	0 %	15603918
77	NC_000963	AAAG	2	8	45403	45410	75 %	0 %	25 %	0 %	15603919
78	NC_000963	TAAA	2	8	45470	45477	75 %	25 %	0 %	0 %	15603919
79	NC_000963	AAGA	2	8	46448	46455	75 %	0 %	25 %	0 %	15603921
80	NC_000963	TAAT	2	8	46955	46962	50 %	50 %	0 %	0 %	15603921
81	NC_000963	ATTA	2	8	47031	47038	50 %	50 %	0 %	0 %	15603921
82	NC_000963	TTAT	2	8	47226	47233	25 %	75 %	0 %	0 %	15603921
83	NC_000963	GAAT	2	8	47803	47810	50 %	25 %	25 %	0 %	15603922
84	NC_000963	CTTA	2	8	48077	48084	25 %	50 %	0 %	25 %	15603922
85	NC_000963	ATGG	2	8	48357	48364	25 %	25 %	50 %	0 %	15603922
86	NC_000963	TATG	2	8	49085	49092	25 %	50 %	25 %	0 %	15603922
87	NC_000963	GCTA	2	8	51856	51863	25 %	25 %	25 %	25 %	15603924
88	NC_000963	AATT	2	8	51952	51959	50 %	50 %	0 %	0 %	15603924
89	NC_000963	CGAC	2	8	51975	51982	25 %	0 %	25 %	50 %	15603924
90	NC_000963	AAAT	2	8	52049	52056	75 %	25 %	0 %	0 %	15603925
91	NC_000963	ATAA	2	8	52412	52419	75 %	25 %	0 %	0 %	15603925
92	NC_000963	ATAA	2	8	52741	52748	75 %	25 %	0 %	0 %	15603925
93	NC_000963	TGTT	2	8	53020	53027	0 %	75 %	25 %	0 %	15603926
94	NC_000963	TTAA	2	8	53058	53065	50 %	50 %	0 %	0 %	15603926
95	NC_000963	TTAT	2	8	53156	53163	25 %	75 %	0 %	0 %	15603926
96	NC_000963	AACT	2	8	53545	53552	50 %	25 %	0 %	25 %	15603926
97	NC_000963	TAAT	2	8	54296	54303	50 %	50 %	0 %	0 %	15603927
98	NC_000963	TTGG	2	8	54341	54348	0 %	50 %	50 %	0 %	15603927
99	NC_000963	TAAA	2	8	54419	54426	75 %	25 %	0 %	0 %	15603927
100	NC_000963	TAGT	2	8	54662	54669	25 %	50 %	25 %	0 %	15603927
101	NC_000963	ATTT	2	8	54752	54759	25 %	75 %	0 %	0 %	15603927
102	NC_000963	TAAG	2	8	55019	55026	50 %	25 %	25 %	0 %	15603927
103	NC_000963	TGTA	2	8	55622	55629	25 %	50 %	25 %	0 %	15603927
104	NC_000963	ATCT	2	8	55673	55680	25 %	50 %	0 %	25 %	15603927
105	NC_000963	TTAT	2	8	55864	55871	25 %	75 %	0 %	0 %	15603927
106	NC_000963	TAAT	2	8	55959	55966	50 %	50 %	0 %	0 %	15603927
107	NC_000963	TAGT	2	8	56275	56282	25 %	50 %	25 %	0 %	15603928
108	NC_000963	ATAG	2	8	57250	57257	50 %	25 %	25 %	0 %	15603930
109	NC_000963	TCTT	2	8	57466	57473	0 %	75 %	0 %	25 %	15603930
110	NC_000963	TATT	2	8	58673	58680	25 %	75 %	0 %	0 %	15603931
111	NC_000963	AAGA	2	8	59334	59341	75 %	0 %	25 %	0 %	15603932
112	NC_000963	GATG	2	8	60008	60015	25 %	25 %	50 %	0 %	15603932
113	NC_000963	TAAA	2	8	60749	60756	75 %	25 %	0 %	0 %	15603932
114	NC_000963	TAAA	2	8	60773	60780	75 %	25 %	0 %	0 %	15603932
115	NC_000963	TTGG	2	8	61049	61056	0 %	50 %	50 %	0 %	15603933
116	NC_000963	TCAA	2	8	61242	61249	50 %	25 %	0 %	25 %	15603933
117	NC_000963	CTCA	2	8	61276	61283	25 %	25 %	0 %	50 %	15603933
118	NC_000963	TGTT	2	8	61602	61609	0 %	75 %	25 %	0 %	15603933
119	NC_000963	TGTT	2	8	61619	61626	0 %	75 %	25 %	0 %	15603933
120	NC_000963	TATG	2	8	61811	61818	25 %	50 %	25 %	0 %	15603933
121	NC_000963	TGCC	2	8	63242	63249	0 %	25 %	25 %	50 %	15603935
122	NC_000963	AAAT	2	8	63785	63792	75 %	25 %	0 %	0 %	15603935
123	NC_000963	TGAT	2	8	63968	63975	25 %	50 %	25 %	0 %	15603935
124	NC_000963	ATTT	2	8	64397	64404	25 %	75 %	0 %	0 %	15603935
125	NC_000963	ATTT	2	8	64567	64574	25 %	75 %	0 %	0 %	15603935
126	NC_000963	AAGT	2	8	64827	64834	50 %	25 %	25 %	0 %	15603936
127	NC_000963	TAAT	2	8	64908	64915	50 %	50 %	0 %	0 %	15603936
128	NC_000963	TGGT	2	8	66975	66982	0 %	50 %	50 %	0 %	15603939
129	NC_000963	AAAC	2	8	67020	67027	75 %	0 %	0 %	25 %	15603939
130	NC_000963	ATGG	2	8	67362	67369	25 %	25 %	50 %	0 %	15603939
131	NC_000963	TGCT	2	8	67398	67405	0 %	50 %	25 %	25 %	15603939
132	NC_000963	ATCA	2	8	68130	68137	50 %	25 %	0 %	25 %	15603939
133	NC_000963	TAGA	2	8	68466	68473	50 %	25 %	25 %	0 %	15603939
134	NC_000963	AAAT	2	8	68778	68785	75 %	25 %	0 %	0 %	15603940
135	NC_000963	TTTA	2	8	68787	68794	25 %	75 %	0 %	0 %	15603940
136	NC_000963	ATTT	2	8	69116	69123	25 %	75 %	0 %	0 %	15603941
137	NC_000963	TGCT	2	8	71917	71924	0 %	50 %	25 %	25 %	15603943
138	NC_000963	AATG	2	8	72243	72250	50 %	25 %	25 %	0 %	15603943
139	NC_000963	TTAT	2	8	72637	72644	25 %	75 %	0 %	0 %	15603943
140	NC_000963	GAAA	2	8	72698	72705	75 %	0 %	25 %	0 %	15603943
141	NC_000963	TAAA	2	8	72709	72716	75 %	25 %	0 %	0 %	15603943
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