MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Madrid E chromosome

Total Repeats: 4258

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000963	ATT	2	6	834	839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000963	GTT	2	6	884	889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_000963	TAT	2	6	3735	3740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_000963	TAG	2	6	5884	5889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_000963	ATT	2	6	5895	5900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_000963	TCT	2	6	5901	5906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_000963	GTT	2	6	5908	5913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_000963	TAA	2	6	5926	5931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_000963	CAT	2	6	6022	6027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_000963	TAA	2	6	6037	6042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_000963	ATA	2	6	6120	6125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_000963	ATT	2	6	6174	6179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_000963	TTA	2	6	7503	7508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_000963	ATT	2	6	7554	7559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_000963	ACA	2	6	7637	7642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_000963	TAT	2	6	8750	8755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_000963	TTA	2	6	8863	8868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_000963	TAA	2	6	8904	8909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_000963	TTA	2	6	9008	9013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_000963	ACC	2	6	9081	9086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_000963	GTA	2	6	9112	9117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_000963	CAT	2	6	9142	9147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_000963	ATT	2	6	9155	9160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_000963	CAT	2	6	9178	9183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_000963	ACA	2	6	9190	9195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_000963	TAA	2	6	9199	9204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_000963	TTA	2	6	9340	9345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_000963	TAT	2	6	9402	9407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_000963	AAT	2	6	9452	9457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_000963	TAT	2	6	9476	9481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_000963	AGA	2	6	11810	11815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_000963	ATA	2	6	14367	14372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_000963	TTA	2	6	14377	14382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_000963	GTT	2	6	14432	14437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_000963	TTA	2	6	14446	14451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_000963	GTA	2	6	14463	14468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_000963	TTG	2	6	14499	14504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_000963	ATT	2	6	14513	14518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_000963	ATT	2	6	14664	14669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_000963	ATC	2	6	14704	14709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_000963	AAG	2	6	14815	14820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_000963	ATT	2	6	14925	14930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_000963	TTG	2	6	14938	14943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000963	ATT	2	6	14984	14989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_000963	TAA	2	6	17863	17868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_000963	GAA	3	9	17903	17911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_000963	ATA	2	6	19082	19087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_000963	ACC	2	6	19132	19137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_000963	ATA	2	6	19229	19234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_000963	TAA	2	6	19242	19247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_000963	AAG	2	6	19264	19269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_000963	TTA	2	6	19306	19311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_000963	CTT	2	6	19380	19385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_000963	ATT	2	6	19407	19412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_000963	TAG	2	6	19443	19448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_000963	AAT	2	6	19572	19577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_000963	CAT	2	6	19730	19735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_000963	TAG	2	6	19899	19904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_000963	GTA	2	6	20023	20028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_000963	TAA	2	6	20029	20034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_000963	AAT	2	6	20106	20111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_000963	GAA	2	6	20206	20211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_000963	TAA	2	6	20224	20229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_000963	TAG	2	6	20244	20249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_000963	AGT	2	6	20337	20342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_000963	TAT	2	6	20398	20403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_000963	AAT	2	6	20425	20430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_000963	ATT	2	6	20584	20589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_000963	AAG	2	6	20643	20648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_000963	GTT	2	6	20673	20678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_000963	AAT	2	6	20710	20715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_000963	ATA	2	6	20770	20775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_000963	TCT	2	6	20903	20908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_000963	ATC	2	6	20933	20938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_000963	TGA	2	6	21092	21097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_000963	TAC	2	6	24983	24988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_000963	TTA	2	6	25158	25163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_000963	CTG	2	6	26036	26041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_000963	TAG	2	6	26045	26050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_000963	TTA	2	6	26907	26912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_000963	TTC	2	6	26927	26932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_000963	ATT	2	6	26940	26945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_000963	ATT	2	6	27022	27027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_000963	CAG	2	6	27051	27056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_000963	AAT	2	6	28182	28187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_000963	ATT	2	6	28194	28199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_000963	TAG	2	6	28234	28239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_000963	ATT	2	6	28290	28295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_000963	ATA	2	6	28433	28438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_000963	TGC	2	6	28538	28543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_000963	TTC	2	6	28561	28566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_000963	TGA	2	6	28626	28631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_000963	TAA	2	6	28693	28698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_000963	CAT	2	6	28756	28761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_000963	TAA	2	6	28775	28780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_000963	TCA	2	6	28937	28942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_000963	TAT	2	6	28961	28966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_000963	ATT	2	6	29110	29115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_000963	AAT	2	6	29119	29124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_000963	TGA	2	6	29223	29228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_000963	GTA	2	6	29233	29238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_000963	ATT	2	6	29277	29282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_000963	TAA	2	6	29303	29308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_000963	ATT	2	6	29321	29326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_000963	TCT	2	6	29356	29361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_000963	TTA	2	6	29370	29375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_000963	ATT	2	6	29423	29428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_000963	ACA	2	6	29445	29450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_000963	ATC	2	6	29465	29470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_000963	TTA	2	6	29594	29599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_000963	TAA	2	6	29643	29648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_000963	TAA	2	6	29664	29669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_000963	ATT	2	6	29720	29725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_000963	TCT	2	6	29743	29748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_000963	TAA	2	6	29874	29879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_000963	TAT	2	6	29967	29972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_000963	TAT	2	6	30056	30061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_000963	TAA	2	6	30126	30131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_000963	CAC	2	6	30831	30836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_000963	TTA	2	6	30995	31000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_000963	TCT	2	6	31085	31090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_000963	CTG	2	6	31113	31118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_000963	CTT	2	6	31124	31129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_000963	TAA	3	9	31295	31303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_000963	ATT	2	6	31421	31426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_000963	AAT	2	6	31479	31484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_000963	TCT	2	6	31491	31496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_000963	AAT	2	6	31607	31612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_000963	ATT	2	6	31649	31654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_000963	GTT	2	6	31813	31818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_000963	ATT	2	6	31933	31938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_000963	ATT	2	6	31996	32001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_000963	ATA	2	6	32002	32007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_000963	ATA	2	6	32030	32035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_000963	TAT	2	6	32095	32100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_000963	TAT	2	6	32105	32110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_000963	TAA	2	6	32117	32122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_000963	ATT	3	9	32136	32144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_000963	ACT	2	6	32167	32172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_000963	TAT	2	6	32252	32257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_000963	ATA	2	6	32306	32311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_000963	GAT	2	6	32319	32324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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