MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rickettsia prowazekii str. Madrid E chromosome

Total Repeats: 2813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000963	AG	3	6	685	690	50 %	0 %	50 %	0 %	15603882
2	NC_000963	AT	3	6	787	792	50 %	50 %	0 %	0 %	15603882
3	NC_000963	AT	3	6	1546	1551	50 %	50 %	0 %	0 %	15603884
4	NC_000963	TA	3	6	1664	1669	50 %	50 %	0 %	0 %	15603884
5	NC_000963	AG	3	6	2238	2243	50 %	0 %	50 %	0 %	15603885
6	NC_000963	TA	3	6	2401	2406	50 %	50 %	0 %	0 %	15603885
7	NC_000963	TG	3	6	2517	2522	0 %	50 %	50 %	0 %	15603885
8	NC_000963	AT	3	6	2661	2666	50 %	50 %	0 %	0 %	15603885
9	NC_000963	TC	3	6	2974	2979	0 %	50 %	0 %	50 %	15603886
10	NC_000963	AT	3	6	3393	3398	50 %	50 %	0 %	0 %	15603886
11	NC_000963	GA	3	6	3473	3478	50 %	0 %	50 %	0 %	15603886
12	NC_000963	AT	4	8	3895	3902	50 %	50 %	0 %	0 %	15603887
13	NC_000963	GA	3	6	4225	4230	50 %	0 %	50 %	0 %	15603887
14	NC_000963	TA	3	6	4564	4569	50 %	50 %	0 %	0 %	15603887
15	NC_000963	AT	3	6	5769	5774	50 %	50 %	0 %	0 %	15603887
16	NC_000963	TA	3	6	5936	5941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_000963	TA	4	8	6156	6163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_000963	TC	3	6	6785	6790	0 %	50 %	0 %	50 %	15603888
19	NC_000963	AT	3	6	7580	7585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_000963	TA	3	6	8301	8306	50 %	50 %	0 %	0 %	15603890
21	NC_000963	TA	3	6	8733	8738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_000963	TG	3	6	9910	9915	0 %	50 %	50 %	0 %	15603891
23	NC_000963	GA	3	6	10053	10058	50 %	0 %	50 %	0 %	15603891
24	NC_000963	AT	3	6	10970	10975	50 %	50 %	0 %	0 %	15603892
25	NC_000963	AT	4	8	12034	12041	50 %	50 %	0 %	0 %	15603893
26	NC_000963	TA	3	6	12057	12062	50 %	50 %	0 %	0 %	15603893
27	NC_000963	TA	3	6	12482	12487	50 %	50 %	0 %	0 %	15603894
28	NC_000963	TA	3	6	12831	12836	50 %	50 %	0 %	0 %	15603894
29	NC_000963	CT	3	6	12922	12927	0 %	50 %	0 %	50 %	15603894
30	NC_000963	TA	3	6	13513	13518	50 %	50 %	0 %	0 %	15603895
31	NC_000963	TG	3	6	13647	13652	0 %	50 %	50 %	0 %	15603895
32	NC_000963	TA	3	6	14389	14394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_000963	AT	3	6	14557	14562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_000963	TA	3	6	14585	14590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_000963	AT	3	6	15001	15006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_000963	AG	3	6	15847	15852	50 %	0 %	50 %	0 %	15603896
37	NC_000963	TA	3	6	16978	16983	50 %	50 %	0 %	0 %	15603897
38	NC_000963	AT	3	6	17311	17316	50 %	50 %	0 %	0 %	15603897
39	NC_000963	TA	3	6	17486	17491	50 %	50 %	0 %	0 %	15603897
40	NC_000963	TA	3	6	18615	18620	50 %	50 %	0 %	0 %	15603898
41	NC_000963	AT	3	6	18672	18677	50 %	50 %	0 %	0 %	15603898
42	NC_000963	AT	3	6	19679	19684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_000963	TA	3	6	19866	19871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000963	AT	3	6	19879	19884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_000963	TA	3	6	20435	20440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_000963	AT	3	6	20531	20536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_000963	TA	3	6	20856	20861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_000963	AG	3	6	22304	22309	50 %	0 %	50 %	0 %	15603901
49	NC_000963	TA	3	6	23879	23884	50 %	50 %	0 %	0 %	15603904
50	NC_000963	AT	3	6	24347	24352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_000963	AG	3	6	25270	25275	50 %	0 %	50 %	0 %	15603906
52	NC_000963	TA	3	6	25284	25289	50 %	50 %	0 %	0 %	15603906
53	NC_000963	AT	3	6	25432	25437	50 %	50 %	0 %	0 %	15603906
54	NC_000963	AT	3	6	25990	25995	50 %	50 %	0 %	0 %	15603906
55	NC_000963	TA	3	6	26494	26499	50 %	50 %	0 %	0 %	15603907
56	NC_000963	AT	3	6	26837	26842	50 %	50 %	0 %	0 %	15603907
57	NC_000963	TA	3	6	26898	26903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_000963	TC	3	6	27680	27685	0 %	50 %	0 %	50 %	15603908
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60	NC_000963	AT	3	6	28159	28164	50 %	50 %	0 %	0 %	15603908
61	NC_000963	AT	3	6	28201	28206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_000963	AT	4	8	28264	28271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_000963	AT	3	6	29025	29030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_000963	AT	3	6	29066	29071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_000963	AT	3	6	29267	29272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_000963	TA	3	6	29459	29464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_000963	AT	3	6	29588	29593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_000963	TA	3	6	29602	29607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_000963	TA	3	6	29683	29688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_000963	TA	3	6	30087	30092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_000963	AT	3	6	30910	30915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_000963	TA	3	6	31172	31177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_000963	TA	3	6	31230	31235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_000963	AT	3	6	31447	31452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_000963	TA	3	6	31544	31549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_000963	AT	3	6	31883	31888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_000963	TA	3	6	32013	32018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_000963	AT	3	6	32176	32181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_000963	AT	3	6	32571	32576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_000963	AG	4	8	32917	32924	50 %	0 %	50 %	0 %	15603910
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89	NC_000963	AT	3	6	35107	35112	50 %	50 %	0 %	0 %	15603913
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91	NC_000963	AT	3	6	36063	36068	50 %	50 %	0 %	0 %	15603913
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94	NC_000963	AT	3	6	36806	36811	50 %	50 %	0 %	0 %	15603914
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100	NC_000963	AT	3	6	40424	40429	50 %	50 %	0 %	0 %	15603915
101	NC_000963	AG	3	6	40835	40840	50 %	0 %	50 %	0 %	15603915
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103	NC_000963	TA	3	6	41500	41505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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110	NC_000963	AT	3	6	44551	44556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_000963	TA	3	6	44791	44796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_000963	AT	3	6	45801	45806	50 %	50 %	0 %	0 %	15603920
113	NC_000963	TC	3	6	45816	45821	0 %	50 %	0 %	50 %	15603920
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115	NC_000963	TA	3	6	46366	46371	50 %	50 %	0 %	0 %	15603921
116	NC_000963	AG	3	6	46459	46464	50 %	0 %	50 %	0 %	15603921
117	NC_000963	TA	3	6	46646	46651	50 %	50 %	0 %	0 %	15603921
118	NC_000963	AT	3	6	47107	47112	50 %	50 %	0 %	0 %	15603921
119	NC_000963	AG	3	6	47113	47118	50 %	0 %	50 %	0 %	15603921
120	NC_000963	AT	3	6	47369	47374	50 %	50 %	0 %	0 %	15603921
121	NC_000963	AG	3	6	49650	49655	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_000963	AG	3	6	49708	49713	50 %	0 %	50 %	0 %	15603923
123	NC_000963	AT	3	6	49999	50004	50 %	50 %	0 %	0 %	15603923
124	NC_000963	TA	3	6	50648	50653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_000963	TG	3	6	50786	50791	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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129	NC_000963	TA	3	6	52517	52522	50 %	50 %	0 %	0 %	15603925
130	NC_000963	TA	3	6	53269	53274	50 %	50 %	0 %	0 %	15603926
131	NC_000963	AT	4	8	53435	53442	50 %	50 %	0 %	0 %	15603926
132	NC_000963	TA	3	6	53902	53907	50 %	50 %	0 %	0 %	15603926
133	NC_000963	AT	4	8	54006	54013	50 %	50 %	0 %	0 %	15603926
134	NC_000963	AT	4	8	54205	54212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_000963	AT	3	6	54897	54902	50 %	50 %	0 %	0 %	15603927
136	NC_000963	AT	3	6	54923	54928	50 %	50 %	0 %	0 %	15603927
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138	NC_000963	TA	3	6	55535	55540	50 %	50 %	0 %	0 %	15603927
139	NC_000963	TA	4	8	55608	55615	50 %	50 %	0 %	0 %	15603927
140	NC_000963	AT	3	6	55900	55905	50 %	50 %	0 %	0 %	15603927
141	NC_000963	TA	3	6	56043	56048	50 %	50 %	0 %	0 %	15603928
142	NC_000963	AT	4	8	56538	56545	50 %	50 %	0 %	0 %	15603929
143	NC_000963	AT	3	6	56549	56554	50 %	50 %	0 %	0 %	15603929
144	NC_000963	TA	3	6	57317	57322	50 %	50 %	0 %	0 %	15603930
145	NC_000963	TA	3	6	57627	57632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_000963	TA	3	6	58111	58116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_000963	TA	3	6	58170	58175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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150	NC_000963	AT	3	6	59138	59143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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