MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Madrid E chromosome

Total Repeats: 961

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000963	TA	3	6	5936	5941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000963	TA	4	8	6156	6163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_000963	AT	3	6	7580	7585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_000963	TA	3	6	8733	8738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_000963	TA	3	6	14389	14394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_000963	AT	3	6	14557	14562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_000963	TA	3	6	14585	14590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_000963	AT	3	6	15001	15006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_000963	AT	3	6	19679	19684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_000963	TA	3	6	19866	19871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_000963	AT	3	6	19879	19884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_000963	TA	3	6	20435	20440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_000963	AT	3	6	20531	20536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_000963	TA	3	6	20856	20861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_000963	AT	3	6	24347	24352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_000963	TA	3	6	26898	26903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_000963	AT	3	6	28201	28206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_000963	AT	4	8	28264	28271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_000963	AT	3	6	29025	29030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_000963	AT	3	6	29066	29071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_000963	AT	3	6	29267	29272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_000963	TA	3	6	29459	29464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_000963	AT	3	6	29588	29593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_000963	TA	3	6	29602	29607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_000963	TA	3	6	29683	29688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_000963	TA	3	6	30087	30092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_000963	AT	3	6	30910	30915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_000963	TA	3	6	31172	31177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_000963	TA	3	6	31230	31235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_000963	AT	3	6	31447	31452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_000963	TA	3	6	31544	31549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_000963	AT	3	6	31883	31888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_000963	TA	3	6	32013	32018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_000963	AT	3	6	32176	32181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_000963	AT	3	6	32571	32576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_000963	TA	3	6	33810	33815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_000963	TC	3	6	36306	36311	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_000963	TA	3	6	36369	36374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_000963	AT	3	6	37464	37469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_000963	TA	4	8	38049	38056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_000963	TA	3	6	40990	40995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_000963	TA	3	6	41500	41505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_000963	TG	3	6	42729	42734	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000963	AT	3	6	42744	42749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_000963	TG	3	6	44433	44438	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_000963	AT	3	6	44551	44556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_000963	TA	3	6	44791	44796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_000963	AT	4	8	46060	46067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_000963	AG	3	6	49650	49655	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_000963	TA	3	6	50648	50653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_000963	TG	3	6	50786	50791	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_000963	AT	4	8	54205	54212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_000963	TA	3	6	57627	57632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_000963	TA	3	6	58111	58116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_000963	TA	3	6	58170	58175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_000963	AT	3	6	58596	58601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_000963	AT	3	6	59138	59143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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59	NC_000963	AT	3	6	62298	62303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_000963	AT	3	6	66784	66789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_000963	TA	3	6	66898	66903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_000963	TA	3	6	69941	69946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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66	NC_000963	AT	3	6	70494	70499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_000963	TG	3	6	70600	70605	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_000963	TA	3	6	71697	71702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_000963	AT	3	6	71703	71708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_000963	TA	3	6	75623	75628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_000963	TA	3	6	79681	79686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_000963	TA	3	6	85777	85782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_000963	AT	4	8	88652	88659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_000963	TA	3	6	88860	88865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_000963	TG	3	6	92052	92057	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_000963	TA	3	6	92168	92173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_000963	TA	3	6	93573	93578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_000963	TA	3	6	94078	94083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_000963	TA	3	6	94125	94130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_000963	TA	3	6	94681	94686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_000963	AT	3	6	96161	96166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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85	NC_000963	TA	3	6	98989	98994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_000963	TA	3	6	99169	99174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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92	NC_000963	AT	3	6	109908	109913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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110	NC_000963	AT	3	6	140938	140943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_000963	TA	3	6	141585	141590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_000963	TA	3	6	141910	141915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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115	NC_000963	AT	3	6	142504	142509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_000963	TA	3	6	142526	142531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_000963	TA	3	6	144751	144756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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121	NC_000963	TA	3	6	152341	152346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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123	NC_000963	AG	3	6	156423	156428	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_000963	TA	4	8	156445	156452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_000963	TA	3	6	156467	156472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_000963	TA	3	6	160437	160442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_000963	TA	3	6	164779	164784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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134	NC_000963	AT	3	6	175329	175334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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138	NC_000963	AT	3	6	185091	185096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_000963	TA	3	6	188291	188296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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141	NC_000963	TA	3	6	189007	189012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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143	NC_000963	AT	3	6	189335	189340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_000963	TA	3	6	189444	189449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_000963	TC	4	8	194609	194616	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_000963	TA	3	6	194661	194666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_000963	TA	3	6	194851	194856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_000963	AT	3	6	195046	195051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_000963	AT	3	6	198171	198176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_000963	AT	3	6	209294	209299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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