MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv complete genome

Total Repeats: 11341

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000962	CGAC	2	8	311	318	25 %	0 %	25 %	50 %	15607143
2	NC_000962	CGTT	2	8	527	534	0 %	50 %	25 %	25 %	15607143
3	NC_000962	CCCG	2	8	589	596	0 %	0 %	25 %	75 %	15607143
4	NC_000962	GGCA	2	8	660	667	25 %	0 %	50 %	25 %	15607143
5	NC_000962	CCCA	2	8	918	925	25 %	0 %	0 %	75 %	15607143
6	NC_000962	CCGA	2	8	1725	1732	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_000962	GTGG	2	8	2132	2139	0 %	25 %	75 %	0 %	15607144
8	NC_000962	GCCA	2	8	2150	2157	25 %	0 %	25 %	50 %	15607144
9	NC_000962	TCAG	2	8	2494	2501	25 %	25 %	25 %	25 %	15607144
10	NC_000962	CGTT	2	8	2720	2727	0 %	50 %	25 %	25 %	15607144
11	NC_000962	ACGG	2	8	3072	3079	25 %	0 %	50 %	25 %	15607144
12	NC_000962	GCCT	2	8	3134	3141	0 %	25 %	25 %	50 %	15607144
13	NC_000962	CGTC	2	8	3285	3292	0 %	25 %	25 %	50 %	15607145
14	NC_000962	GGTA	2	8	3465	3472	25 %	25 %	50 %	0 %	15607145
15	NC_000962	GGTT	2	8	3647	3654	0 %	50 %	50 %	0 %	15607145
16	NC_000962	CCGC	2	8	3875	3882	0 %	0 %	25 %	75 %	15607145
17	NC_000962	ATCG	2	8	4012	4019	25 %	25 %	25 %	25 %	15607145
18	NC_000962	CCAC	2	8	5499	5506	25 %	0 %	0 %	75 %	448824735
19	NC_000962	ACCG	2	8	5518	5525	25 %	0 %	25 %	50 %	448824735
20	NC_000962	CAAG	2	8	5713	5720	50 %	0 %	25 %	25 %	448824735
21	NC_000962	CGCC	2	8	5809	5816	0 %	0 %	25 %	75 %	448824735
22	NC_000962	CGGC	2	8	6624	6631	0 %	0 %	50 %	50 %	448824735
23	NC_000962	GACA	2	8	7304	7311	50 %	0 %	25 %	25 %	15607148
24	NC_000962	CGGT	2	8	7524	7531	0 %	25 %	50 %	25 %	15607148
25	NC_000962	CGAG	2	8	8456	8463	25 %	0 %	50 %	25 %	15607148
26	NC_000962	CCAC	2	8	8986	8993	25 %	0 %	0 %	75 %	15607148
27	NC_000962	CGGC	2	8	9298	9305	0 %	0 %	50 %	50 %	15607148
28	NC_000962	CGAC	2	8	9355	9362	25 %	0 %	25 %	50 %	15607148
29	NC_000962	GGTT	2	8	9583	9590	0 %	50 %	50 %	0 %	15607148
30	NC_000962	CCCG	2	8	10132	10139	0 %	0 %	25 %	75 %	15607149
31	NC_000962	GCAC	2	8	11608	11615	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_000962	GAGC	2	8	12092	12099	25 %	0 %	50 %	25 %	15607150
33	NC_000962	CTCA	2	8	12303	12310	25 %	25 %	0 %	50 %	15607150
34	NC_000962	GCCC	2	8	12453	12460	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
35	NC_000962	AACC	2	8	13338	13345	50 %	0 %	0 %	50 %	15607152
36	NC_000962	CCCG	2	8	13447	13454	0 %	0 %	25 %	75 %	15607152
37	NC_000962	ATTC	2	8	13691	13698	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_000962	ACCC	2	8	14098	14105	25 %	0 %	0 %	75 %	15607154
39	NC_000962	TGAT	2	8	14135	14142	25 %	50 %	25 %	0 %	15607154
40	NC_000962	TGCT	2	8	14182	14189	0 %	50 %	25 %	25 %	15607154
41	NC_000962	GCCC	2	8	14669	14676	0 %	0 %	25 %	75 %	15607154
42	NC_000962	GGGC	2	8	15450	15457	0 %	0 %	75 %	25 %	57116682
43	NC_000962	CTGA	2	8	15905	15912	25 %	25 %	25 %	25 %	15607156
44	NC_000962	TGGC	2	8	16048	16055	0 %	25 %	50 %	25 %	15607156
45	NC_000962	GCTT	2	8	16107	16114	0 %	50 %	25 %	25 %	15607156
46	NC_000962	CAGT	2	8	16135	16142	25 %	25 %	25 %	25 %	15607156
47	NC_000962	CGGT	2	8	16506	16513	0 %	25 %	50 %	25 %	15607156
48	NC_000962	GCCG	2	8	16565	16572	0 %	0 %	50 %	50 %	15607156
49	NC_000962	CGGG	2	8	17800	17807	0 %	0 %	75 %	25 %	15607157
50	NC_000962	CTGG	2	8	17908	17915	0 %	25 %	50 %	25 %	15607157
51	NC_000962	GTGC	2	8	18408	18415	0 %	25 %	50 %	25 %	15607157
52	NC_000962	GCCG	2	8	18426	18433	0 %	0 %	50 %	50 %	15607157
53	NC_000962	CCGC	2	8	18791	18798	0 %	0 %	25 %	75 %	15607158
54	NC_000962	GCCG	2	8	20255	20262	0 %	0 %	50 %	50 %	15607159
55	NC_000962	CCAG	2	8	20743	20750	25 %	0 %	25 %	50 %	15607159
56	NC_000962	CACC	2	8	20926	20933	25 %	0 %	0 %	75 %	15607159
57	NC_000962	CGGG	2	8	21882	21889	0 %	0 %	75 %	25 %	15607160
58	NC_000962	GCCG	2	8	21973	21980	0 %	0 %	50 %	50 %	15607160
59	NC_000962	GCTG	2	8	22353	22360	0 %	25 %	50 %	25 %	15607160
60	NC_000962	CGGC	2	8	22373	22380	0 %	0 %	50 %	50 %	15607160
61	NC_000962	GCCG	2	8	23044	23051	0 %	0 %	50 %	50 %	15607160
62	NC_000962	CCCA	2	8	23056	23063	25 %	0 %	0 %	75 %	15607160
63	NC_000962	GCTG	2	8	24195	24202	0 %	25 %	50 %	25 %	15607162
64	NC_000962	CGGC	2	8	24243	24250	0 %	0 %	50 %	50 %	15607162
65	NC_000962	GCCG	2	8	24343	24350	0 %	0 %	50 %	50 %	15607162
66	NC_000962	CGGG	2	8	24418	24425	0 %	0 %	75 %	25 %	15607162
67	NC_000962	TCAA	2	8	25514	25521	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_000962	GAGC	2	8	25542	25549	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_000962	GGCC	2	8	25556	25563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_000962	GCTC	2	8	26505	26512	0 %	25 %	25 %	50 %	15607163
71	NC_000962	CCAA	2	8	26722	26729	50 %	0 %	0 %	50 %	15607163
72	NC_000962	CAGC	2	8	26788	26795	25 %	0 %	25 %	50 %	15607163
73	NC_000962	CGGC	2	8	27608	27615	0 %	0 %	50 %	50 %	15607165
74	NC_000962	CCGG	2	8	28094	28101	0 %	0 %	50 %	50 %	15607165
75	NC_000962	GCTC	2	8	28650	28657	0 %	25 %	25 %	50 %	15607166
76	NC_000962	TGCG	2	8	28789	28796	0 %	25 %	50 %	25 %	15607166
77	NC_000962	CCGG	2	8	29054	29061	0 %	0 %	50 %	50 %	15607166
78	NC_000962	CGTC	2	8	29385	29392	0 %	25 %	25 %	50 %	15607167
79	NC_000962	CACG	2	8	29745	29752	25 %	0 %	25 %	50 %	15607168
80	NC_000962	ACCG	2	8	29826	29833	25 %	0 %	25 %	50 %	15607168
81	NC_000962	CCGG	2	8	30145	30152	0 %	0 %	50 %	50 %	15607168
82	NC_000962	GTCG	2	8	30321	30328	0 %	25 %	50 %	25 %	15607168
83	NC_000962	CCCG	2	8	30943	30950	0 %	0 %	25 %	75 %	15607168
84	NC_000962	ACCA	2	8	31124	31131	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_000962	CGAG	2	8	31455	31462	25 %	0 %	50 %	25 %	15607169
86	NC_000962	CGAC	2	8	31752	31759	25 %	0 %	25 %	50 %	15607170
87	NC_000962	GCCG	2	8	32479	32486	0 %	0 %	50 %	50 %	15607171
88	NC_000962	CCGA	2	8	33468	33475	25 %	0 %	25 %	50 %	15607172
89	NC_000962	GCTA	2	8	33855	33862	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_000962	GGCC	2	8	34603	34610	0 %	0 %	50 %	50 %	15607174
91	NC_000962	ATCG	2	8	35096	35103	25 %	25 %	25 %	25 %	15607174
92	NC_000962	GATC	2	8	35434	35441	25 %	25 %	25 %	25 %	15607174
93	NC_000962	CCAC	2	8	36255	36262	25 %	0 %	0 %	75 %	15607174
94	NC_000962	ACCG	2	8	36649	36656	25 %	0 %	25 %	50 %	15607175
95	NC_000962	CTGG	2	8	36993	37000	0 %	25 %	50 %	25 %	15607176
96	NC_000962	TGCC	2	8	37028	37035	0 %	25 %	25 %	50 %	15607176
97	NC_000962	GCAT	2	8	37388	37395	25 %	25 %	25 %	25 %	57116683
98	NC_000962	GCTG	2	8	37902	37909	0 %	25 %	50 %	25 %	57116683
99	NC_000962	AACG	2	8	38657	38664	50 %	0 %	25 %	25 %	57116683
100	NC_000962	CCGA	2	8	38718	38725	25 %	0 %	25 %	50 %	57116683
101	NC_000962	CCAC	2	8	38874	38881	25 %	0 %	0 %	75 %	57116683
102	NC_000962	CAGC	2	8	39101	39108	25 %	0 %	25 %	50 %	15607178
103	NC_000962	CCGG	2	8	39597	39604	0 %	0 %	50 %	50 %	15607178
104	NC_000962	GGCC	2	8	40128	40135	0 %	0 %	50 %	50 %	15607179
105	NC_000962	CGAT	2	8	40578	40585	25 %	25 %	25 %	25 %	15607179
106	NC_000962	GCCG	2	8	40878	40885	0 %	0 %	50 %	50 %	15607179
107	NC_000962	CACC	2	8	40903	40910	25 %	0 %	0 %	75 %	15607179
108	NC_000962	ACCG	2	8	41126	41133	25 %	0 %	25 %	50 %	15607179
109	NC_000962	GCGT	2	8	41152	41159	0 %	25 %	50 %	25 %	15607179
110	NC_000962	CCAC	2	8	41881	41888	25 %	0 %	0 %	75 %	15607180
111	NC_000962	CGAT	2	8	41890	41897	25 %	25 %	25 %	25 %	15607180
112	NC_000962	GGCC	2	8	42586	42593	0 %	0 %	50 %	50 %	57116684
113	NC_000962	CCCG	2	8	43177	43184	0 %	0 %	25 %	75 %	57116684
114	NC_000962	CGGG	2	8	43206	43213	0 %	0 %	75 %	25 %	57116684
115	NC_000962	CGAC	2	8	43845	43852	25 %	0 %	25 %	50 %	15607183
116	NC_000962	GAGC	2	8	44225	44232	25 %	0 %	50 %	25 %	15607183
117	NC_000962	GGGC	2	8	45384	45391	0 %	0 %	75 %	25 %	15607183
118	NC_000962	CGGC	2	8	45479	45486	0 %	0 %	50 %	50 %	15607183
119	NC_000962	GCCG	2	8	46442	46449	0 %	0 %	50 %	50 %	15607183
120	NC_000962	TTGC	2	8	46606	46613	0 %	50 %	25 %	25 %	15607184
121	NC_000962	CCGC	2	8	46754	46761	0 %	0 %	25 %	75 %	15607184
122	NC_000962	CCGC	2	8	46787	46794	0 %	0 %	25 %	75 %	15607184
123	NC_000962	GGTC	2	8	46895	46902	0 %	25 %	50 %	25 %	15607184
124	NC_000962	CTAC	2	8	47219	47226	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_000962	CGGG	2	8	47446	47453	0 %	0 %	75 %	25 %	15607185
126	NC_000962	GCAG	2	8	47519	47526	25 %	0 %	50 %	25 %	15607185
127	NC_000962	GTGC	2	8	48419	48426	0 %	25 %	50 %	25 %	15607186
128	NC_000962	GCCG	2	8	48703	48710	0 %	0 %	50 %	50 %	15607186
129	NC_000962	CAGC	2	8	49888	49895	25 %	0 %	25 %	50 %	15607187
130	NC_000962	CGGG	2	8	50077	50084	0 %	0 %	75 %	25 %	15607188
131	NC_000962	GCCG	2	8	50177	50184	0 %	0 %	50 %	50 %	15607188
132	NC_000962	GGTG	2	8	50500	50507	0 %	25 %	75 %	0 %	15607188
133	NC_000962	CTCA	2	8	51116	51123	25 %	25 %	0 %	50 %	15607188
134	NC_000962	CGCT	2	8	51255	51262	0 %	25 %	25 %	50 %	15607189
135	NC_000962	GGTA	2	8	52121	52128	25 %	25 %	50 %	0 %	15607190
136	NC_000962	CTGG	2	8	52716	52723	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_000962	GCCG	2	8	53570	53577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_000962	ACCA	2	8	53741	53748	50 %	0 %	0 %	50 %	57116685
139	NC_000962	GTGC	2	8	54626	54633	0 %	25 %	50 %	25 %	57116685
140	NC_000962	ACCG	2	8	55504	55511	25 %	0 %	25 %	50 %	57116685
141	NC_000962	CCCG	2	8	55666	55673	0 %	0 %	25 %	75 %	57116685
142	NC_000962	GGCC	2	8	56340	56347	0 %	0 %	50 %	50 %	15607193
143	NC_000962	CGCT	2	8	57067	57074	0 %	25 %	25 %	50 %	15607193
144	NC_000962	GCGG	2	8	58824	58831	0 %	0 %	75 %	25 %	15607196
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