MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv complete genome

Total Repeats: 1041

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000962	CCGA	2	8	1725	1732	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_000962	GCAC	2	8	11608	11615	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_000962	GCCC	2	8	12453	12460	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_000962	ATTC	2	8	13691	13698	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_000962	TCAA	2	8	25514	25521	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_000962	GAGC	2	8	25542	25549	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_000962	GGCC	2	8	25556	25563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_000962	ACCA	2	8	31124	31131	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_000962	GCTA	2	8	33855	33862	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_000962	CTAC	2	8	47219	47226	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_000962	CTGG	2	8	52716	52723	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_000962	GCCG	2	8	53570	53577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_000962	CGGT	2	8	79170	79177	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_000962	CGGT	2	8	79355	79362	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_000962	CTGG	2	8	87200	87207	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_000962	CGCA	2	8	89501	89508	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_000962	CGCT	2	8	97631	97638	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_000962	CCTG	2	8	97678	97685	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_000962	GCGA	2	8	97722	97729	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_000962	ACCG	2	8	99445	99452	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_000962	ATCC	2	8	125580	125587	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_000962	GCGA	2	8	130667	130674	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_000962	CGGG	2	8	130710	130717	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24	NC_000962	GCTC	2	8	131221	131228	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_000962	CGGG	2	8	133933	133940	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
26	NC_000962	TTCT	2	8	139849	139856	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_000962	ACGC	2	8	139921	139928	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_000962	GGGC	2	8	140013	140020	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
29	NC_000962	AGCA	2	8	141093	141100	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_000962	GCCG	2	8	143899	143906	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_000962	GCGT	2	8	148443	148450	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_000962	GCGG	2	8	149509	149516	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
33	NC_000962	GCCG	2	8	152236	152243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_000962	CCGG	2	8	155602	155609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_000962	GCGT	3	12	155630	155641	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_000962	GGCT	2	8	157776	157783	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_000962	CGCA	2	8	157802	157809	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_000962	TCGT	2	8	161493	161500	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_000962	CCGG	2	8	161501	161508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_000962	CCCG	2	8	161713	161720	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
41	NC_000962	ACTT	2	8	171190	171197	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_000962	GCCG	2	8	180898	180905	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_000962	TTGA	2	8	186722	186729	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000962	CTGG	2	8	196707	196714	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_000962	CTGT	2	8	212259	212266	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_000962	GGCC	2	8	218347	218354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_000962	CGGT	2	8	218683	218690	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_000962	GATG	2	8	219430	219437	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_000962	AACT	2	8	230625	230632	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_000962	GGAA	2	8	230800	230807	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_000962	ACGT	2	8	231552	231559	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_000962	ACAT	2	8	231619	231626	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_000962	GTGC	2	8	241330	241337	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_000962	GAAC	2	8	249016	249023	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_000962	CGCA	2	8	253625	253632	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_000962	GACG	2	8	256034	256041	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_000962	GCGG	2	8	272915	272922	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
58	NC_000962	CGGC	2	8	274281	274288	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_000962	TAGA	2	8	288390	288397	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_000962	ACTT	2	8	292095	292102	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_000962	TCGT	2	8	293722	293729	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_000962	AACT	2	8	295772	295779	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_000962	AACC	2	8	295780	295787	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_000962	ATGC	2	8	296770	296777	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_000962	GACG	2	8	302088	302095	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_000962	TCGG	2	8	310125	310132	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_000962	GCCG	2	8	336511	336518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_000962	TGGC	2	8	336523	336530	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_000962	CTGT	2	8	364517	364524	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_000962	AATC	2	8	375758	375765	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_000962	GGCC	2	8	386118	386125	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_000962	AAGG	2	8	387134	387141	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_000962	TGAC	2	8	396103	396110	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_000962	GTCA	2	8	396114	396121	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_000962	ATCG	2	8	417084	417091	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_000962	GCCA	2	8	417175	417182	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_000962	GTCC	2	8	417201	417208	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_000962	ACGG	2	8	417287	417294	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_000962	GAGC	2	8	424069	424076	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_000962	GAGC	2	8	424120	424127	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_000962	CACG	2	8	454390	454397	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_000962	TGCG	2	8	455502	455509	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_000962	GCTC	2	8	455882	455889	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_000962	GTCG	2	8	467407	467414	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_000962	GGAT	2	8	468173	468180	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_000962	CGAG	2	8	468316	468323	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_000962	CAAC	2	8	480265	480272	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_000962	AGAA	2	8	490772	490779	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_000962	GCGG	2	8	503148	503155	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
90	NC_000962	ACCG	2	8	505028	505035	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_000962	CGGG	2	8	505065	505072	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
92	NC_000962	GAGG	2	8	507021	507028	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
93	NC_000962	GCGT	2	8	507107	507114	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_000962	ACGG	2	8	510357	510364	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_000962	GATG	2	8	515331	515338	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_000962	CTGA	2	8	515955	515962	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_000962	GCAA	2	8	518591	518598	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_000962	GCTG	2	8	521464	521471	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_000962	CCGT	2	8	528509	528516	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_000962	CGGC	2	8	533821	533828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_000962	CGGC	2	8	538564	538571	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_000962	GACG	2	8	538574	538581	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_000962	CCGA	2	8	544826	544833	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_000962	AATC	2	8	545257	545264	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_000962	GTCT	2	8	545879	545886	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_000962	CGGC	2	8	559880	559887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_000962	CCGG	2	8	560815	560822	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_000962	AGCA	2	8	564959	564966	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_000962	CGAC	2	8	565629	565636	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_000962	CGCC	2	8	577519	577526	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
111	NC_000962	GCAT	2	8	577602	577609	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_000962	GTTT	2	8	586336	586343	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_000962	GCCG	2	8	591350	591357	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_000962	GCTA	2	8	596652	596659	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_000962	GCGT	2	8	604538	604545	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_000962	CCGA	2	8	604563	604570	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_000962	CCGA	2	8	608566	608573	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_000962	GTCC	2	8	611121	611128	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_000962	GCCC	2	8	625537	625544	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
120	NC_000962	AGCC	2	8	630018	630025	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_000962	CCGG	2	8	635542	635549	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_000962	TGCC	2	8	639979	639986	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_000962	CGCC	2	8	640924	640931	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
124	NC_000962	GCCG	2	8	651521	651528	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_000962	TGGC	2	8	654811	654818	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_000962	CCAG	2	8	657521	657528	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_000962	CGGT	2	8	658265	658272	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_000962	GTGC	2	8	660965	660972	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_000962	AAGG	2	8	660988	660995	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_000962	CGGC	2	8	663472	663479	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_000962	TTGC	2	8	665566	665573	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_000962	GTCG	2	8	665637	665644	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_000962	CGGC	2	8	668466	668473	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_000962	GTGG	2	8	668483	668490	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
135	NC_000962	GCCG	2	8	671972	671979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_000962	CGAA	2	8	676075	676082	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_000962	CGGC	2	8	677100	677107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_000962	CCGG	2	8	679106	679113	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_000962	TTCA	2	8	684392	684399	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_000962	CGGA	2	8	695622	695629	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_000962	TCCG	2	8	696994	697001	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_000962	CGGG	2	8	697086	697093	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
143	NC_000962	CCCA	2	8	704221	704228	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
144	NC_000962	ACCG	2	8	704318	704325	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_000962	CCGC	2	8	706933	706940	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
146	NC_000962	GGTC	2	8	713970	713977	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_000962	CGGC	2	8	728327	728334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_000962	CATG	2	8	728341	728348	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_000962	CACC	2	8	728573	728580	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
150	NC_000962	GCTG	2	8	730238	730245	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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175	NC_000962	GTGG	2	8	798573	798580	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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293	NC_000962	GCTT	2	8	1216161	1216168	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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492	NC_000962	GCTC	2	8	2136118	2136125	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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494	NC_000962	GGCC	2	8	2142030	2142037	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
495	NC_000962	CGAT	2	8	2142271	2142278	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
496	NC_000962	CAGG	2	8	2142456	2142463	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
497	NC_000962	AAAG	2	8	2142500	2142507	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
498	NC_000962	ACCG	2	8	2151397	2151404	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
499	NC_000962	ACTC	2	8	2152932	2152939	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
500	NC_000962	ACGG	2	8	2153011	2153018	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

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