MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Rv complete genome

Total Repeats: 77750

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000962	CAC	2	6	27	32	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607143
2	NC_000962	GTC	2	6	46	51	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607143
3	NC_000962	GAC	2	6	79	84	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607143
4	NC_000962	CAG	2	6	90	95	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607143
5	NC_000962	TCG	2	6	167	172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607143
6	NC_000962	AGC	2	6	199	204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607143
7	NC_000962	GCC	2	6	260	265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607143
8	NC_000962	CCG	2	6	304	309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607143
9	NC_000962	CGA	2	6	324	329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607143
10	NC_000962	GCC	2	6	339	344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607143
11	NC_000962	ACG	2	6	389	394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607143
12	NC_000962	TGA	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607143
13	NC_000962	CGC	3	9	561	569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607143
14	NC_000962	GTT	2	6	681	686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15607143
15	NC_000962	CGA	2	6	810	815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607143
16	NC_000962	TTC	2	6	856	861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15607143
17	NC_000962	CAA	2	6	888	893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15607143
18	NC_000962	AGC	2	6	926	931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607143
19	NC_000962	ACC	2	6	993	998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607143
20	NC_000962	CGA	2	6	1062	1067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607143
21	NC_000962	CAG	2	6	1086	1091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607143
22	NC_000962	GCG	2	6	1237	1242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607143
23	NC_000962	CCG	2	6	1259	1264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607143
24	NC_000962	CAC	2	6	1491	1496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607143
25	NC_000962	GTT	2	6	2186	2191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15607144
26	NC_000962	CCG	2	6	2242	2247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607144
27	NC_000962	TTG	2	6	2304	2309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15607144
28	NC_000962	CGA	2	6	2407	2412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607144
29	NC_000962	TTG	2	6	2463	2468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15607144
30	NC_000962	ATT	2	6	2477	2482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15607144
31	NC_000962	CGC	2	6	2510	2515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607144
32	NC_000962	GAC	2	6	2523	2528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607144
33	NC_000962	GGT	2	6	2576	2581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607144
34	NC_000962	CGT	2	6	2635	2640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607144
35	NC_000962	GCC	2	6	2691	2696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607144
36	NC_000962	CGG	2	6	2708	2713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607144
37	NC_000962	GCA	2	6	2794	2799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607144
38	NC_000962	CTT	2	6	2808	2813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15607144
39	NC_000962	CCA	2	6	2869	2874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607144
40	NC_000962	GAT	2	6	2988	2993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607144
41	NC_000962	TTG	3	9	3016	3024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15607144
42	NC_000962	CGG	2	6	3205	3210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607144
43	NC_000962	TTG	2	6	3362	3367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15607145
44	NC_000962	CGA	2	6	3416	3421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607145
45	NC_000962	GTG	2	6	3499	3504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607145
46	NC_000962	ACG	2	6	3506	3511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607145
47	NC_000962	CAA	2	6	3555	3560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15607145
48	NC_000962	ATC	2	6	3576	3581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607145
49	NC_000962	TGT	2	6	3623	3628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15607145
50	NC_000962	CGG	2	6	3673	3678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607145
51	NC_000962	GAT	2	6	3688	3693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607145
52	NC_000962	TGG	2	6	3869	3874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607145
53	NC_000962	GAA	2	6	3915	3920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15607145
54	NC_000962	AGC	2	6	4029	4034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607145
55	NC_000962	GGC	2	6	4044	4049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607145
56	NC_000962	GGC	2	6	4053	4058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607145
57	NC_000962	GAC	2	6	4111	4116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607145
58	NC_000962	GGC	2	6	4200	4205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607145
59	NC_000962	TGG	2	6	4227	4232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607145
60	NC_000962	GTT	2	6	4242	4247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15607145
61	NC_000962	CGA	2	6	4251	4256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607145
62	NC_000962	CGG	2	6	4301	4306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607145
63	NC_000962	CCG	2	6	4313	4318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607145
64	NC_000962	CCG	2	6	4358	4363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607145
65	NC_000962	GGT	2	6	4422	4427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607145
66	NC_000962	TGC	3	9	4532	4540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607146
67	NC_000962	CGA	2	6	4611	4616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607146
68	NC_000962	GGT	2	6	4745	4750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607146
69	NC_000962	CCA	2	6	4754	4759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607146
70	NC_000962	ACG	2	6	4792	4797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607146
71	NC_000962	CGC	2	6	4877	4882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607146
72	NC_000962	CGG	2	6	4927	4932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607146
73	NC_000962	AAG	2	6	5255	5260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448824735
74	NC_000962	GGT	2	6	5383	5388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448824735
75	NC_000962	CGA	2	6	5401	5406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448824735
76	NC_000962	TGC	2	6	5442	5447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448824735
77	NC_000962	CGA	2	6	5473	5478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448824735
78	NC_000962	GTG	2	6	5531	5536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448824735
79	NC_000962	CGG	2	6	5554	5559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448824735
80	NC_000962	TGG	2	6	5590	5595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448824735
81	NC_000962	GGT	2	6	5617	5622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448824735
82	NC_000962	AAG	2	6	5732	5737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448824735
83	NC_000962	CAA	2	6	5839	5844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448824735
84	NC_000962	CGA	2	6	5866	5871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448824735
85	NC_000962	GTC	2	6	5891	5896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448824735
86	NC_000962	TGG	2	6	6009	6014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448824735
87	NC_000962	AGC	2	6	6056	6061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448824735
88	NC_000962	GGC	2	6	6176	6181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448824735
89	NC_000962	GGT	2	6	6217	6222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448824735
90	NC_000962	GCG	2	6	6520	6525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448824735
91	NC_000962	ATC	2	6	6692	6697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448824735
92	NC_000962	ATC	2	6	6752	6757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448824735
93	NC_000962	ACG	2	6	6780	6785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448824735
94	NC_000962	TGT	2	6	6867	6872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448824735
95	NC_000962	GTT	3	9	6877	6885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448824735
96	NC_000962	CCG	2	6	6935	6940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448824735
97	NC_000962	CTG	2	6	7007	7012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448824735
98	NC_000962	GAA	2	6	7033	7038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448824735
99	NC_000962	CAA	2	6	7042	7047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448824735
100	NC_000962	ACC	2	6	7109	7114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448824735
101	NC_000962	GAC	2	6	7154	7159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448824735
102	NC_000962	GCC	4	12	7160	7171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448824735
103	NC_000962	GTT	2	6	7177	7182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448824735
104	NC_000962	GCC	2	6	7319	7324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607148
105	NC_000962	GAC	2	6	7326	7331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607148
106	NC_000962	TCG	2	6	7408	7413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607148
107	NC_000962	ACC	2	6	7552	7557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607148
108	NC_000962	TGG	2	6	7627	7632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607148
109	NC_000962	CGG	2	6	7672	7677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607148
110	NC_000962	CGA	2	6	7736	7741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607148
111	NC_000962	ACG	2	6	7768	7773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607148
112	NC_000962	CTG	2	6	7818	7823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607148
113	NC_000962	GGC	2	6	7836	7841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607148
114	NC_000962	CGC	2	6	7870	7875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607148
115	NC_000962	ACG	2	6	7924	7929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607148
116	NC_000962	CGA	2	6	7931	7936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607148
117	NC_000962	CCG	2	6	7990	7995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607148
118	NC_000962	TCG	2	6	8002	8007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607148
119	NC_000962	GTT	2	6	8067	8072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15607148
120	NC_000962	AGA	2	6	8078	8083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15607148
121	NC_000962	TCA	2	6	8149	8154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607148
122	NC_000962	GGT	2	6	8276	8281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15607148
123	NC_000962	TCG	2	6	8344	8349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607148
124	NC_000962	ACC	2	6	8401	8406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607148
125	NC_000962	GCG	2	6	8423	8428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607148
126	NC_000962	CAC	2	6	8429	8434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15607148
127	NC_000962	GCT	2	6	8570	8575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607148
128	NC_000962	CGA	2	6	8582	8587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607148
129	NC_000962	GCG	2	6	8621	8626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607148
130	NC_000962	CAT	2	6	8651	8656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607148
131	NC_000962	CGA	2	6	8657	8662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607148
132	NC_000962	CGA	2	6	8741	8746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607148
133	NC_000962	CGA	2	6	8774	8779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607148
134	NC_000962	ATC	2	6	8793	8798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15607148
135	NC_000962	CGA	2	6	8819	8824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607148
136	NC_000962	CGT	2	6	8846	8851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15607148
137	NC_000962	CGG	2	6	8918	8923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607148
138	NC_000962	GAC	2	6	8955	8960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607148
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140	NC_000962	CTT	2	6	8972	8977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15607148
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153	NC_000962	CGA	3	9	9605	9613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607148
154	NC_000962	CGG	2	6	9638	9643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607148
155	NC_000962	TGA	2	6	9709	9714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607148
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157	NC_000962	CGA	2	6	9770	9775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607148
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163	NC_000962	CCG	2	6	10266	10271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607149
164	NC_000962	GCC	2	6	10385	10390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607149
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258	NC_000962	TGA	2	6	17682	17687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15607157
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261	NC_000962	AGC	2	6	17741	17746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607157
262	NC_000962	CGG	2	6	17776	17781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607157
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385	NC_000962	CGA	2	6	25109	25114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607162
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495	NC_000962	CGG	2	6	32446	32451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15607171
496	NC_000962	GCC	3	9	32534	32542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15607171
497	NC_000962	CCT	2	6	32569	32574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15607171
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500	NC_000962	ACG	2	6	32759	32764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15607171

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