MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Deinococcus radiodurans R1 plasmid CP1

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000959	ACGA	2	8	905	912	50 %	0 %	25 %	25 %	10957531
2	NC_000959	TCCT	2	8	1123	1130	0 %	50 %	0 %	50 %	10957531
3	NC_000959	CCCT	2	8	1196	1203	0 %	25 %	0 %	75 %	10957531
4	NC_000959	TGCG	2	8	1477	1484	0 %	25 %	50 %	25 %	10957531
5	NC_000959	GCGG	2	8	1790	1797	0 %	0 %	75 %	25 %	10957531
6	NC_000959	GCTC	2	8	1869	1876	0 %	25 %	25 %	50 %	10957531
7	NC_000959	GTGG	2	8	2040	2047	0 %	25 %	75 %	0 %	10957548
8	NC_000959	CTGG	2	8	2244	2251	0 %	25 %	50 %	25 %	10957548
9	NC_000959	TTTC	2	8	5503	5510	0 %	75 %	0 %	25 %	10957545
10	NC_000959	CTGG	2	8	6438	6445	0 %	25 %	50 %	25 %	10957550
11	NC_000959	GGGT	2	8	7441	7448	0 %	25 %	75 %	0 %	10957550
12	NC_000959	GCTC	2	8	8918	8925	0 %	25 %	25 %	50 %	10957551
13	NC_000959	CATC	2	8	9894	9901	25 %	25 %	0 %	50 %	10957551
14	NC_000959	CGTT	2	8	10040	10047	0 %	50 %	25 %	25 %	10957551
15	NC_000959	TGAT	2	8	13639	13646	25 %	50 %	25 %	0 %	10957546
16	NC_000959	TCTG	2	8	13727	13734	0 %	50 %	25 %	25 %	10957546
17	NC_000959	CGCT	2	8	13884	13891	0 %	25 %	25 %	50 %	10957546
18	NC_000959	GCTG	2	8	14553	14560	0 %	25 %	50 %	25 %	10957561
19	NC_000959	GCCA	2	8	14614	14621	25 %	0 %	25 %	50 %	10957561
20	NC_000959	GCTC	2	8	14873	14880	0 %	25 %	25 %	50 %	10957552
21	NC_000959	ACGG	2	8	15302	15309	25 %	0 %	50 %	25 %	10957552
22	NC_000959	TGGC	2	8	16511	16518	0 %	25 %	50 %	25 %	10957562
23	NC_000959	CGGT	2	8	18430	18437	0 %	25 %	50 %	25 %	15789333
24	NC_000959	GCGG	2	8	19108	19115	0 %	0 %	75 %	25 %	15789333
25	NC_000959	CCGA	2	8	20267	20274	25 %	0 %	25 %	50 %	10957535
26	NC_000959	ACCT	2	8	21605	21612	25 %	25 %	0 %	50 %	15789334
27	NC_000959	CTGG	2	8	22387	22394	0 %	25 %	50 %	25 %	15789334
28	NC_000959	TCAG	2	8	22543	22550	25 %	25 %	25 %	25 %	15789334
29	NC_000959	CTTC	2	8	23191	23198	0 %	50 %	0 %	50 %	10957553
30	NC_000959	GCCC	2	8	23339	23346	0 %	0 %	25 %	75 %	10957563
31	NC_000959	ACCC	2	8	23492	23499	25 %	0 %	0 %	75 %	10957563
32	NC_000959	CGTC	2	8	23737	23744	0 %	25 %	25 %	50 %	10957563
33	NC_000959	GCTG	2	8	25039	25046	0 %	25 %	50 %	25 %	10957559
34	NC_000959	TCAC	2	8	25419	25426	25 %	25 %	0 %	50 %	10957559
35	NC_000959	AGCA	2	8	26063	26070	50 %	0 %	25 %	25 %	10957558
36	NC_000959	ACCA	2	8	26159	26166	50 %	0 %	0 %	50 %	10957558
37	NC_000959	GCTG	2	8	27249	27256	0 %	25 %	50 %	25 %	10957547
38	NC_000959	AATC	2	8	28362	28369	50 %	25 %	0 %	25 %	10957556
39	NC_000959	CAGC	2	8	28638	28645	25 %	0 %	25 %	50 %	10957556
40	NC_000959	ACCC	2	8	29056	29063	25 %	0 %	0 %	75 %	10957537
41	NC_000959	GCCA	2	8	29261	29268	25 %	0 %	25 %	50 %	10957537
42	NC_000959	CGCC	2	8	29357	29364	0 %	0 %	25 %	75 %	10957537
43	NC_000959	CGTC	2	8	29760	29767	0 %	25 %	25 %	50 %	10957537
44	NC_000959	GCTG	2	8	30496	30503	0 %	25 %	50 %	25 %	10957538
45	NC_000959	GCTC	2	8	35401	35408	0 %	25 %	25 %	50 %	10957539
46	NC_000959	AACG	2	8	36263	36270	50 %	0 %	25 %	25 %	10957540
47	NC_000959	CTGG	2	8	36463	36470	0 %	25 %	50 %	25 %	10957540
48	NC_000959	GCAA	2	8	36601	36608	50 %	0 %	25 %	25 %	10957540
49	NC_000959	TCCT	2	8	38509	38516	0 %	50 %	0 %	50 %	10957541
50	NC_000959	GCCT	2	8	39297	39304	0 %	25 %	25 %	50 %	10957542
51	NC_000959	GAGC	2	8	39917	39924	25 %	0 %	50 %	25 %	10957542
52	NC_000959	GGAG	2	8	40076	40083	25 %	0 %	75 %	0 %	10957542
53	NC_000959	CTCG	2	8	40637	40644	0 %	25 %	25 %	50 %	10957542
54	NC_000959	CAGG	2	8	40974	40981	25 %	0 %	50 %	25 %	10957542
55	NC_000959	ACCA	2	8	41568	41575	50 %	0 %	0 %	50 %	10957543
56	NC_000959	AGGA	2	8	42263	42270	50 %	0 %	50 %	0 %	10957543
57	NC_000959	TATC	2	8	42560	42567	25 %	50 %	0 %	25 %	10957543
58	NC_000959	TTTG	2	8	42742	42749	0 %	75 %	25 %	0 %	10957555
59	NC_000959	ATTC	2	8	42900	42907	25 %	50 %	0 %	25 %	10957555
60	NC_000959	CTTG	2	8	43655	43662	0 %	50 %	25 %	25 %	10957544
61	NC_000959	TTCT	2	8	43732	43739	0 %	75 %	0 %	25 %	10957544
62	NC_000959	CTGG	2	8	44887	44894	0 %	25 %	50 %	25 %	10957564
63	NC_000959	GAAG	2	8	45179	45186	50 %	0 %	50 %	0 %	10957564
64	NC_000959	CAGC	2	8	45218	45225	25 %	0 %	25 %	50 %	10957564

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.