MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Deinococcus radiodurans R1 plasmid MP1

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000958	ATCTG	2	10	2437	2446	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_000958	TCCGG	2	10	14271	14280	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_000958	GGTCA	2	10	19958	19967	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_000958	AGTTG	2	10	25144	25153	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_000958	TGCTG	2	10	31074	31083	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_000958	CCCCA	2	10	39244	39253	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
7	NC_000958	ACGCC	2	10	54020	54029	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
8	NC_000958	GGCCC	2	10	60925	60934	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
9	NC_000958	CCCCA	2	10	60994	61003	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
10	NC_000958	GCCGT	2	10	61172	61181	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_000958	CGCAG	2	10	61429	61438	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_000958	GTTTT	2	10	63454	63463	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_000958	CGTGA	2	10	64557	64566	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_000958	GGTCA	2	10	67107	67116	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_000958	GGGAT	2	10	73469	73478	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
16	NC_000958	GCTGA	2	10	88787	88796	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_000958	GCGCC	2	10	93324	93333	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
18	NC_000958	GCGCC	2	10	93771	93780	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
19	NC_000958	CGTGC	2	10	94386	94395	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_000958	TCGCC	2	10	96628	96637	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
21	NC_000958	GCGCG	2	10	96954	96963	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
22	NC_000958	GGGGA	2	10	98584	98593	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
23	NC_000958	GGGGC	2	10	98597	98606	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
24	NC_000958	GCCGC	2	10	114401	114410	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
25	NC_000958	CTGGC	2	10	114427	114436	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_000958	GTAGA	2	10	120375	120384	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_000958	AAGAG	2	10	132825	132834	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_000958	CGTGA	2	10	134070	134079	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_000958	CGGCG	2	10	147996	148005	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
30	NC_000958	GAGCA	2	10	151485	151494	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_000958	GAGCG	2	10	152608	152617	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
32	NC_000958	AAGGC	2	10	169553	169562	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.