MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Deinococcus radiodurans R1 plasmid MP1

Total Repeats: 372

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000958	TGAT	2	8	773	780	25 %	50 %	25 %	0 %	10957476
2	NC_000958	CGTG	2	8	1104	1111	0 %	25 %	50 %	25 %	10957476
3	NC_000958	CTGA	2	8	1566	1573	25 %	25 %	25 %	25 %	10957477
4	NC_000958	TGAA	2	8	2388	2395	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_000958	CGCA	2	8	3769	3776	25 %	0 %	25 %	50 %	10957490
6	NC_000958	GACT	2	8	3811	3818	25 %	25 %	25 %	25 %	10957490
7	NC_000958	CTGT	2	8	4868	4875	0 %	50 %	25 %	25 %	10957491
8	NC_000958	GCCA	2	8	4893	4900	25 %	0 %	25 %	50 %	10957491
9	NC_000958	GCCC	2	8	5121	5128	0 %	0 %	25 %	75 %	10957491
10	NC_000958	GGCA	2	8	5819	5826	25 %	0 %	50 %	25 %	10957491
11	NC_000958	CAGC	2	8	6053	6060	25 %	0 %	25 %	50 %	10957491
12	NC_000958	GCTG	2	8	6850	6857	0 %	25 %	50 %	25 %	10957474
13	NC_000958	GGCG	2	8	8679	8686	0 %	0 %	75 %	25 %	10957436
14	NC_000958	AAGA	2	8	9030	9037	75 %	0 %	25 %	0 %	10957437
15	NC_000958	ACGG	2	8	9133	9140	25 %	0 %	50 %	25 %	10957437
16	NC_000958	TGCG	2	8	9641	9648	0 %	25 %	50 %	25 %	10957438
17	NC_000958	CACC	2	8	9699	9706	25 %	0 %	0 %	75 %	10957438
18	NC_000958	CGGG	2	8	9720	9727	0 %	0 %	75 %	25 %	10957438
19	NC_000958	ACCC	2	8	10738	10745	25 %	0 %	0 %	75 %	10957438
20	NC_000958	GGCG	2	8	11270	11277	0 %	0 %	75 %	25 %	10957439
21	NC_000958	GCTC	2	8	13396	13403	0 %	25 %	25 %	50 %	10957441
22	NC_000958	GCTG	2	8	13633	13640	0 %	25 %	50 %	25 %	10957441
23	NC_000958	GCTG	2	8	13711	13718	0 %	25 %	50 %	25 %	10957441
24	NC_000958	CGCC	2	8	14137	14144	0 %	0 %	25 %	75 %	10957441
25	NC_000958	GGTC	2	8	14401	14408	0 %	25 %	50 %	25 %	10957524
26	NC_000958	GTCT	2	8	14422	14429	0 %	50 %	25 %	25 %	10957524
27	NC_000958	GGCA	2	8	14653	14660	25 %	0 %	50 %	25 %	10957524
28	NC_000958	CTGG	2	8	17036	17043	0 %	25 %	50 %	25 %	10957443
29	NC_000958	CGGG	2	8	17408	17415	0 %	0 %	75 %	25 %	10957443
30	NC_000958	GACC	2	8	17463	17470	25 %	0 %	25 %	50 %	10957444
31	NC_000958	CCTG	2	8	18182	18189	0 %	25 %	25 %	50 %	10957444
32	NC_000958	TGAC	2	8	18291	18298	25 %	25 %	25 %	25 %	10957475
33	NC_000958	GCTG	2	8	18741	18748	0 %	25 %	50 %	25 %	10957475
34	NC_000958	TCAA	2	8	19044	19051	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_000958	TGCT	2	8	20724	20731	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_000958	ATGA	2	8	21546	21553	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_000958	CAGC	2	8	22297	22304	25 %	0 %	25 %	50 %	10957465
38	NC_000958	CTGC	2	8	23867	23874	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_000958	GGCC	2	8	24148	24155	0 %	0 %	50 %	50 %	10957493
40	NC_000958	GCTT	2	8	24961	24968	0 %	50 %	25 %	25 %	10957493
41	NC_000958	TGGC	2	8	25086	25093	0 %	25 %	50 %	25 %	10957493
42	NC_000958	CTGC	2	8	26129	26136	0 %	25 %	25 %	50 %	10957446
43	NC_000958	CGCT	2	8	27091	27098	0 %	25 %	25 %	50 %	10957448
44	NC_000958	CGTG	2	8	28038	28045	0 %	25 %	50 %	25 %	10957448
45	NC_000958	TGCC	2	8	28453	28460	0 %	25 %	25 %	50 %	10957449
46	NC_000958	GGCA	2	8	29255	29262	25 %	0 %	50 %	25 %	10957449
47	NC_000958	TGCG	2	8	29590	29597	0 %	25 %	50 %	25 %	10957449
48	NC_000958	ATCA	2	8	31212	31219	50 %	25 %	0 %	25 %	10957466
49	NC_000958	GCCA	2	8	31596	31603	25 %	0 %	25 %	50 %	10957466
50	NC_000958	TCAG	2	8	31885	31892	25 %	25 %	25 %	25 %	10957466
51	NC_000958	CATC	2	8	32006	32013	25 %	25 %	0 %	50 %	10957466
52	NC_000958	TGCG	2	8	32338	32345	0 %	25 %	50 %	25 %	10957451
53	NC_000958	TGGC	2	8	32581	32588	0 %	25 %	50 %	25 %	10957451
54	NC_000958	GGCA	2	8	33157	33164	25 %	0 %	50 %	25 %	10957451
55	NC_000958	CGAG	2	8	33374	33381	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_000958	AGTG	2	8	33514	33521	25 %	25 %	50 %	0 %	10957526
57	NC_000958	TGCC	2	8	33966	33973	0 %	25 %	25 %	50 %	10957452
58	NC_000958	GCCC	2	8	34107	34114	0 %	0 %	25 %	75 %	10957452
59	NC_000958	CTGG	2	8	35137	35144	0 %	25 %	50 %	25 %	10957452
60	NC_000958	TGTC	2	8	36133	36140	0 %	50 %	25 %	25 %	10957452
61	NC_000958	AGGT	2	8	36374	36381	25 %	25 %	50 %	0 %	10957452
62	NC_000958	GCTG	2	8	36423	36430	0 %	25 %	50 %	25 %	10957453
63	NC_000958	GGCA	2	8	36509	36516	25 %	0 %	50 %	25 %	10957453
64	NC_000958	TTCA	2	8	36632	36639	25 %	50 %	0 %	25 %	10957453
65	NC_000958	AAGC	2	8	36998	37005	50 %	0 %	25 %	25 %	10957453
66	NC_000958	CCAG	2	8	37645	37652	25 %	0 %	25 %	50 %	10957494
67	NC_000958	GCTC	2	8	37984	37991	0 %	25 %	25 %	50 %	10957494
68	NC_000958	GTCG	2	8	39070	39077	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_000958	CTCG	2	8	39090	39097	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_000958	ACCA	2	8	39691	39698	50 %	0 %	0 %	50 %	10957495
71	NC_000958	GCTC	2	8	41177	41184	0 %	25 %	25 %	50 %	10957495
72	NC_000958	CTGC	2	8	41837	41844	0 %	25 %	25 %	50 %	10957496
73	NC_000958	CTGC	2	8	41860	41867	0 %	25 %	25 %	50 %	10957496
74	NC_000958	GCGG	2	8	42050	42057	0 %	0 %	75 %	25 %	10957496
75	NC_000958	ACCG	2	8	42551	42558	25 %	0 %	25 %	50 %	10957497
76	NC_000958	ACCT	2	8	43407	43414	25 %	25 %	0 %	50 %	10957497
77	NC_000958	CGTG	2	8	43462	43469	0 %	25 %	50 %	25 %	10957497
78	NC_000958	CGCC	2	8	43689	43696	0 %	0 %	25 %	75 %	10957497
79	NC_000958	ACGC	2	8	43901	43908	25 %	0 %	25 %	50 %	10957497
80	NC_000958	GGCG	3	12	44068	44079	0 %	0 %	75 %	25 %	10957497
81	NC_000958	CTGA	2	8	44309	44316	25 %	25 %	25 %	25 %	10957497
82	NC_000958	GACC	2	8	44383	44390	25 %	0 %	25 %	50 %	10957497
83	NC_000958	GCCC	2	8	44617	44624	0 %	0 %	25 %	75 %	10957513
84	NC_000958	GCCT	2	8	45412	45419	0 %	25 %	25 %	50 %	10957498
85	NC_000958	CGCC	2	8	45473	45480	0 %	0 %	25 %	75 %	10957498
86	NC_000958	TCGC	2	8	46206	46213	0 %	25 %	25 %	50 %	10957498
87	NC_000958	TGGA	2	8	46366	46373	25 %	25 %	50 %	0 %	10957498
88	NC_000958	CAGC	2	8	46829	46836	25 %	0 %	25 %	50 %	10957498
89	NC_000958	GACC	2	8	46913	46920	25 %	0 %	25 %	50 %	10957498
90	NC_000958	GCGG	2	8	47013	47020	0 %	0 %	75 %	25 %	10957498
91	NC_000958	CCCG	2	8	47716	47723	0 %	0 %	25 %	75 %	10957498
92	NC_000958	TGGG	2	8	50180	50187	0 %	25 %	75 %	0 %	10957455
93	NC_000958	TGGC	2	8	50713	50720	0 %	25 %	50 %	25 %	10957455
94	NC_000958	CAGC	2	8	51084	51091	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_000958	AGGC	2	8	51167	51174	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_000958	GGAC	2	8	51265	51272	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_000958	CACT	2	8	52055	52062	25 %	25 %	0 %	50 %	10957456
98	NC_000958	TGTC	2	8	52285	52292	0 %	50 %	25 %	25 %	10957456
99	NC_000958	GCTG	2	8	52384	52391	0 %	25 %	50 %	25 %	10957456
100	NC_000958	TCGG	2	8	52734	52741	0 %	25 %	50 %	25 %	10957456
101	NC_000958	GGTC	2	8	52899	52906	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_000958	CCGC	2	8	54722	54729	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
103	NC_000958	GGGC	2	8	54956	54963	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
104	NC_000958	AACA	2	8	55058	55065	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_000958	GTCC	2	8	55355	55362	0 %	25 %	25 %	50 %	10957519
106	NC_000958	TGGC	2	8	55524	55531	0 %	25 %	50 %	25 %	10957499
107	NC_000958	GGGC	2	8	57509	57516	0 %	0 %	75 %	25 %	10957500
108	NC_000958	CTTT	2	8	58164	58171	0 %	75 %	0 %	25 %	10957501
109	NC_000958	GCGG	2	8	58725	58732	0 %	0 %	75 %	25 %	10957501
110	NC_000958	GGGC	2	8	58901	58908	0 %	0 %	75 %	25 %	10957501
111	NC_000958	CGTG	2	8	59089	59096	0 %	25 %	50 %	25 %	10957501
112	NC_000958	GACG	2	8	60021	60028	25 %	0 %	50 %	25 %	10957501
113	NC_000958	CGTG	2	8	62132	62139	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_000958	CACG	2	8	62375	62382	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_000958	CGTC	2	8	62709	62716	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_000958	CTGG	2	8	64691	64698	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_000958	GCTG	2	8	65646	65653	0 %	25 %	50 %	25 %	10957469
118	NC_000958	AAAG	2	8	67642	67649	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_000958	GTGC	2	8	68488	68495	0 %	25 %	50 %	25 %	10957458
120	NC_000958	GCGG	2	8	70899	70906	0 %	0 %	75 %	25 %	10957506
121	NC_000958	GCGG	2	8	71298	71305	0 %	0 %	75 %	25 %	10957506
122	NC_000958	AGCC	2	8	73309	73316	25 %	0 %	25 %	50 %	10957507
123	NC_000958	GGCC	2	8	73367	73374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_000958	GTTG	2	8	73607	73614	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_000958	GTCA	2	8	73648	73655	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_000958	GCCA	2	8	73853	73860	25 %	0 %	25 %	50 %	10957508
127	NC_000958	TCGC	2	8	74379	74386	0 %	25 %	25 %	50 %	10957508
128	NC_000958	GCTT	2	8	74785	74792	0 %	50 %	25 %	25 %	10957508
129	NC_000958	GCTG	2	8	75230	75237	0 %	25 %	50 %	25 %	10957508
130	NC_000958	CGCC	2	8	75291	75298	0 %	0 %	25 %	75 %	10957508
131	NC_000958	GGTC	2	8	75640	75647	0 %	25 %	50 %	25 %	10957508
132	NC_000958	CTGG	2	8	76191	76198	0 %	25 %	50 %	25 %	10957508
133	NC_000958	GTCG	2	8	76346	76353	0 %	25 %	50 %	25 %	10957508
134	NC_000958	CGCC	2	8	76666	76673	0 %	0 %	25 %	75 %	10957508
135	NC_000958	CGAA	2	8	76752	76759	50 %	0 %	25 %	25 %	10957508
136	NC_000958	GTCC	2	8	76765	76772	0 %	25 %	25 %	50 %	10957508
137	NC_000958	GCTG	2	8	77141	77148	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_000958	TCGC	2	8	77364	77371	0 %	25 %	25 %	50 %	10957509
139	NC_000958	CGTC	2	8	77633	77640	0 %	25 %	25 %	50 %	10957509
140	NC_000958	TCGG	2	8	77936	77943	0 %	25 %	50 %	25 %	10957509
141	NC_000958	GGAC	2	8	78085	78092	25 %	0 %	50 %	25 %	10957509
142	NC_000958	GTGG	2	8	78366	78373	0 %	25 %	75 %	0 %	10957509
143	NC_000958	GCGG	2	8	78387	78394	0 %	0 %	75 %	25 %	10957509
144	NC_000958	GCTG	2	8	78791	78798	0 %	25 %	50 %	25 %	10957459
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.