MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Deinococcus radiodurans R1 plasmid MP1

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000958	TGAA	2	8	2388	2395	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000958	TCAA	2	8	19044	19051	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_000958	TGCT	2	8	20724	20731	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_000958	ATGA	2	8	21546	21553	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_000958	CTGC	2	8	23867	23874	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_000958	CGAG	2	8	33374	33381	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_000958	GTCG	2	8	39070	39077	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_000958	CTCG	2	8	39090	39097	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_000958	CAGC	2	8	51084	51091	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_000958	AGGC	2	8	51167	51174	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_000958	GGAC	2	8	51265	51272	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_000958	GGTC	2	8	52899	52906	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_000958	CCGC	2	8	54722	54729	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14	NC_000958	GGGC	2	8	54956	54963	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15	NC_000958	AACA	2	8	55058	55065	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_000958	CGTG	2	8	62132	62139	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_000958	CACG	2	8	62375	62382	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_000958	CGTC	2	8	62709	62716	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_000958	CTGG	2	8	64691	64698	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_000958	AAAG	2	8	67642	67649	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_000958	GGCC	2	8	73367	73374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_000958	GTTG	2	8	73607	73614	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_000958	GTCA	2	8	73648	73655	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_000958	GCTG	2	8	77141	77148	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_000958	ACAT	2	8	82217	82224	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_000958	GTCT	2	8	82414	82421	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_000958	GCAA	2	8	82471	82478	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_000958	AGTA	2	8	82514	82521	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_000958	AGCG	2	8	88746	88753	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_000958	TTCA	2	8	89191	89198	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_000958	CTGG	2	8	92173	92180	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_000958	CGAG	2	8	92387	92394	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_000958	CAGC	2	8	92484	92491	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_000958	GCAC	2	8	92552	92559	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_000958	TTGG	2	8	92848	92855	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_000958	CTCG	2	8	92857	92864	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_000958	GCGG	2	8	93025	93032	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
38	NC_000958	GCCC	2	8	93231	93238	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
39	NC_000958	GGCG	2	8	93276	93283	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_000958	GAGC	2	8	93306	93313	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_000958	TCGT	2	8	93458	93465	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_000958	GGGC	2	8	94058	94065	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
43	NC_000958	GCCT	2	8	94647	94654	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_000958	TGAT	2	8	94670	94677	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_000958	CAAG	3	12	97315	97326	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_000958	GGCG	2	8	100759	100766	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
47	NC_000958	TCGG	2	8	101021	101028	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_000958	GGCG	2	8	101037	101044	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
49	NC_000958	CAGG	2	8	101151	101158	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_000958	CGAC	2	8	101571	101578	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_000958	TCTT	2	8	101871	101878	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_000958	CTCC	2	8	106263	106270	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
53	NC_000958	CCCA	2	8	106325	106332	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
54	NC_000958	AGGC	2	8	108237	108244	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_000958	GCTC	2	8	108396	108403	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_000958	GCAC	2	8	112132	112139	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_000958	GGCT	2	8	117576	117583	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_000958	TCCT	2	8	117645	117652	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_000958	GAAA	2	8	120476	120483	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_000958	AGCG	2	8	120484	120491	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_000958	GCAG	2	8	121516	121523	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_000958	TGCA	2	8	121696	121703	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_000958	GCTG	2	8	132692	132699	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_000958	CTGG	2	8	134204	134211	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_000958	TGGG	2	8	134852	134859	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
66	NC_000958	GGCT	2	8	139752	139759	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_000958	AGAC	2	8	139798	139805	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_000958	CGTC	2	8	141510	141517	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_000958	CATG	2	8	147185	147192	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_000958	TCGC	2	8	147225	147232	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_000958	TTTC	2	8	148426	148433	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_000958	GGAC	2	8	152636	152643	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_000958	ACGC	2	8	152692	152699	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_000958	TCGG	2	8	168745	168752	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_000958	CATT	2	8	170263	170270	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.