MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Deinococcus radiodurans R1 plasmid MP1

Total Repeats: 3048

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000958	CTT	2	6	93	98	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_000958	TAT	2	6	151	156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_000958	CTG	2	6	442	447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_000958	TGA	2	6	472	477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_000958	GAC	2	6	522	527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957476
6	NC_000958	ACA	2	6	612	617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957476
7	NC_000958	CAC	2	6	654	659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10957476
8	NC_000958	TGG	2	6	816	821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957476
9	NC_000958	ATT	2	6	877	882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10957476
10	NC_000958	TGG	2	6	941	946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957476
11	NC_000958	TCG	2	6	1139	1144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957476
12	NC_000958	TGC	2	6	1167	1172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957476
13	NC_000958	TGG	2	6	1250	1255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957476
14	NC_000958	GGC	2	6	1313	1318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957477
15	NC_000958	CTC	2	6	1320	1325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10957477
16	NC_000958	GCA	2	6	1406	1411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957477
17	NC_000958	CTG	2	6	1488	1493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957477
18	NC_000958	TCG	2	6	1522	1527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957477
19	NC_000958	GCG	2	6	1535	1540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957477
20	NC_000958	AAG	2	6	1606	1611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957477
21	NC_000958	CAG	2	6	1612	1617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957477
22	NC_000958	GCT	2	6	1682	1687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957477
23	NC_000958	AGA	2	6	1766	1771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957477
24	NC_000958	TCT	2	6	1792	1797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957477
25	NC_000958	TCC	2	6	1859	1864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10957477
26	NC_000958	GCA	2	6	1964	1969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957477
27	NC_000958	GCA	2	6	2111	2116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957477
28	NC_000958	AAG	2	6	2188	2193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_000958	GGT	2	6	2249	2254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_000958	GTC	2	6	2303	2308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_000958	TGT	2	6	2379	2384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_000958	GGA	2	6	2399	2404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_000958	TGC	2	6	2528	2533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_000958	GGA	2	6	2615	2620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_000958	TGG	2	6	2643	2648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_000958	CAG	2	6	2669	2674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_000958	AAG	2	6	2729	2734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_000958	ATC	2	6	2751	2756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_000958	CGG	2	6	2779	2784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_000958	GAT	2	6	2848	2853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_000958	GTT	2	6	2910	2915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_000958	GAC	2	6	3032	3037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957490
43	NC_000958	GTG	2	6	3070	3075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957490
44	NC_000958	GAA	2	6	3133	3138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957490
45	NC_000958	TCG	2	6	3143	3148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957490
46	NC_000958	CAG	2	6	3168	3173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957490
47	NC_000958	ATC	2	6	3209	3214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957490
48	NC_000958	TTC	2	6	3235	3240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957490
49	NC_000958	AGG	2	6	3253	3258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10957490
50	NC_000958	CTC	2	6	3352	3357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10957490
51	NC_000958	GCA	2	6	3488	3493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957490
52	NC_000958	TTC	2	6	3587	3592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957490
53	NC_000958	AGC	2	6	3598	3603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957490
54	NC_000958	TCC	2	6	3627	3632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10957490
55	NC_000958	CGG	2	6	3636	3641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957490
56	NC_000958	GCG	2	6	3650	3655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957490
57	NC_000958	AGG	2	6	3659	3664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10957490
58	NC_000958	TCA	2	6	3728	3733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957490
59	NC_000958	GAG	2	6	3763	3768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10957490
60	NC_000958	ATG	2	6	3875	3880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957490
61	NC_000958	GCT	2	6	3898	3903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957490
62	NC_000958	CTG	2	6	3934	3939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957490
63	NC_000958	AAG	2	6	3949	3954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957490
64	NC_000958	GCA	2	6	4089	4094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957490
65	NC_000958	GAG	2	6	4249	4254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10957490
66	NC_000958	CTG	2	6	4264	4269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957490
67	NC_000958	TGC	2	6	4340	4345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957490
68	NC_000958	CCG	2	6	4465	4470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957490
69	NC_000958	CTG	2	6	4526	4531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957491
70	NC_000958	CCG	2	6	4616	4621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957491
71	NC_000958	TGT	2	6	4662	4667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10957491
72	NC_000958	GGT	2	6	4789	4794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957491
73	NC_000958	AGA	2	6	4797	4802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957491
74	NC_000958	GGT	3	9	4850	4858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957491
75	NC_000958	CAG	2	6	4943	4948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957491
76	NC_000958	CCA	2	6	4981	4986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10957491
77	NC_000958	GAT	2	6	5080	5085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957491
78	NC_000958	ATG	2	6	5112	5117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957491
79	NC_000958	CTG	2	6	5159	5164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957491
80	NC_000958	GCC	2	6	5175	5180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957491
81	NC_000958	GCT	2	6	5298	5303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957491
82	NC_000958	GTT	2	6	5334	5339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10957491
83	NC_000958	GGC	2	6	5410	5415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957491
84	NC_000958	GAC	2	6	5419	5424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957491
85	NC_000958	GGT	2	6	5522	5527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957491
86	NC_000958	CAG	2	6	5582	5587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957491
87	NC_000958	GCG	2	6	5590	5595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957491
88	NC_000958	TCC	2	6	5871	5876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10957491
89	NC_000958	GTC	2	6	5973	5978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957491
90	NC_000958	TCA	2	6	6003	6008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957491
91	NC_000958	CAG	2	6	6402	6407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_000958	TCC	2	6	6484	6489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_000958	GAT	2	6	6494	6499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957474
94	NC_000958	GAG	2	6	6506	6511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10957474
95	NC_000958	ATC	2	6	6517	6522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957474
96	NC_000958	AAG	2	6	6567	6572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957474
97	NC_000958	AGC	2	6	6601	6606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957474
98	NC_000958	GTC	2	6	6636	6641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957474
99	NC_000958	TGG	2	6	6862	6867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957474
100	NC_000958	TCG	2	6	6908	6913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957474
101	NC_000958	GAC	2	6	6960	6965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957474
102	NC_000958	GGT	2	6	7055	7060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957474
103	NC_000958	TCA	2	6	7090	7095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957474
104	NC_000958	CAG	2	6	7166	7171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957474
105	NC_000958	CAA	2	6	7492	7497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_000958	CTG	2	6	7937	7942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957436
107	NC_000958	GCC	2	6	8061	8066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957436
108	NC_000958	GCT	2	6	8106	8111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957436
109	NC_000958	GCC	3	9	8128	8136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957436
110	NC_000958	GGT	2	6	8178	8183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957436
111	NC_000958	CGT	2	6	8205	8210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957436
112	NC_000958	TGC	2	6	8216	8221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957436
113	NC_000958	TGG	2	6	8267	8272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957436
114	NC_000958	GTG	2	6	8305	8310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957436
115	NC_000958	CGA	2	6	8391	8396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957436
116	NC_000958	GGC	2	6	8452	8457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957436
117	NC_000958	CAC	2	6	8544	8549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10957436
118	NC_000958	CAA	2	6	8575	8580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957436
119	NC_000958	TAC	2	6	8611	8616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957436
120	NC_000958	CAT	2	6	8694	8699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957436
121	NC_000958	TCA	2	6	8765	8770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957436
122	NC_000958	GAC	2	6	8785	8790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957436
123	NC_000958	GGC	2	6	8803	8808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957436
124	NC_000958	CGA	2	6	8856	8861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957436
125	NC_000958	GCC	2	6	8879	8884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957436
126	NC_000958	GAT	2	6	8925	8930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957436
127	NC_000958	GAC	2	6	8961	8966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957437
128	NC_000958	GCC	2	6	8988	8993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957437
129	NC_000958	AGC	2	6	9010	9015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957437
130	NC_000958	GCC	2	6	9052	9057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957437
131	NC_000958	GCT	2	6	9062	9067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957437
132	NC_000958	ACC	2	6	9099	9104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10957437
133	NC_000958	GCC	2	6	9105	9110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957437
134	NC_000958	TGC	2	6	9121	9126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957437
135	NC_000958	CGG	2	6	9280	9285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957437
136	NC_000958	CGA	2	6	9356	9361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957437
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262	NC_000958	ACT	2	6	15381	15386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
263	NC_000958	GAA	2	6	15503	15508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957442
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389	NC_000958	GTC	2	6	22189	22194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957465
390	NC_000958	GAC	2	6	22239	22244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957465
391	NC_000958	GAA	2	6	22245	22250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10957465
392	NC_000958	CCA	2	6	22287	22292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10957465
393	NC_000958	GAC	2	6	22513	22518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957465
394	NC_000958	GCT	2	6	22548	22553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957465
395	NC_000958	TCT	2	6	22581	22586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10957465
396	NC_000958	TGA	2	6	22631	22636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957465
397	NC_000958	CTC	2	6	22643	22648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10957465
398	NC_000958	ATC	2	6	22655	22660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957465
399	NC_000958	AGG	2	6	22664	22669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
400	NC_000958	CTG	2	6	22747	22752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
401	NC_000958	ACA	2	6	23050	23055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957525
402	NC_000958	TTG	2	6	23108	23113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10957525
403	NC_000958	TTG	2	6	23120	23125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10957525
404	NC_000958	ATT	2	6	23415	23420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10957492
405	NC_000958	GCG	2	6	23438	23443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957492
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407	NC_000958	TAA	2	6	23494	23499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10957492
408	NC_000958	CGC	2	6	23698	23703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957492
409	NC_000958	CGC	2	6	23813	23818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957492
410	NC_000958	GGC	2	6	23834	23839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
411	NC_000958	CGG	2	6	23848	23853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
412	NC_000958	CCT	2	6	23876	23881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
413	NC_000958	GGC	2	6	23902	23907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
414	NC_000958	AGG	3	9	24050	24058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10957493
415	NC_000958	CTG	3	9	24123	24131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957493
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419	NC_000958	CGC	2	6	24305	24310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957493
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421	NC_000958	ACA	2	6	24355	24360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	10957493
422	NC_000958	CTG	2	6	24378	24383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957493
423	NC_000958	CGG	2	6	24481	24486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957493
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425	NC_000958	CGT	2	6	24550	24555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957493
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428	NC_000958	CGC	2	6	24829	24834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957493
429	NC_000958	ACG	2	6	24919	24924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957493
430	NC_000958	GGC	2	6	25019	25024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957493
431	NC_000958	GAC	2	6	25038	25043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957493
432	NC_000958	GCA	2	6	25055	25060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957493
433	NC_000958	GGC	2	6	25079	25084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957493
434	NC_000958	GCA	2	6	25094	25099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957493
435	NC_000958	CCT	2	6	25104	25109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
436	NC_000958	GAT	2	6	25233	25238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	10957445
437	NC_000958	GGA	2	6	25272	25277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10957445
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440	NC_000958	ATC	2	6	25681	25686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957445
441	NC_000958	CGT	2	6	25725	25730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957445
442	NC_000958	CGT	2	6	25746	25751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957445
443	NC_000958	ATC	2	6	25849	25854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10957445
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446	NC_000958	CAC	2	6	26013	26018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10957445
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449	NC_000958	CGC	2	6	26294	26299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957446
450	NC_000958	TGG	2	6	26329	26334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957446
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452	NC_000958	TGG	2	6	26365	26370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957446
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454	NC_000958	GGA	3	9	26550	26558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	10957447
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456	NC_000958	TGG	2	6	26591	26596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957447
457	NC_000958	TGG	2	6	26615	26620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	10957447
458	NC_000958	CGG	2	6	26639	26644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957447
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461	NC_000958	GCG	2	6	26807	26812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957447
462	NC_000958	CAG	2	6	26940	26945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
463	NC_000958	ATG	2	6	26957	26962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
464	NC_000958	TGT	2	6	27011	27016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10957448
465	NC_000958	CCG	2	6	27066	27071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957448
466	NC_000958	CCG	2	6	27299	27304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	10957448
467	NC_000958	CGG	2	6	27383	27388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957448
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469	NC_000958	ACG	2	6	27578	27583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	10957448
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472	NC_000958	CGG	2	6	27662	27667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957448
473	NC_000958	CGG	2	6	27693	27698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957448
474	NC_000958	GTC	2	6	27790	27795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957448
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476	NC_000958	GTC	2	6	27846	27851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957448
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480	NC_000958	GCT	2	6	27954	27959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957448
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497	NC_000958	ACC	2	6	28707	28712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	10957449
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499	NC_000958	GCG	2	6	28845	28850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	10957449
500	NC_000958	CTG	2	6	28857	28862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	10957449

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