MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Deinococcus radiodurans R1 plasmid MP1

Total Repeats: 257

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000958	AG	3	6	852	857	50 %	0 %	50 %	0 %	10957476
2	NC_000958	TC	3	6	895	900	0 %	50 %	0 %	50 %	10957476
3	NC_000958	GT	3	6	2564	2569	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_000958	CT	3	6	2712	2717	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_000958	AG	4	8	3333	3340	50 %	0 %	50 %	0 %	10957490
6	NC_000958	CT	3	6	3554	3559	0 %	50 %	0 %	50 %	10957490
7	NC_000958	AG	3	6	5401	5406	50 %	0 %	50 %	0 %	10957491
8	NC_000958	GC	3	6	6141	6146	0 %	0 %	50 %	50 %	10957491
9	NC_000958	GT	4	8	7498	7505	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_000958	GC	3	6	7986	7991	0 %	0 %	50 %	50 %	10957436
11	NC_000958	CA	3	6	8225	8230	50 %	0 %	0 %	50 %	10957436
12	NC_000958	GC	3	6	8910	8915	0 %	0 %	50 %	50 %	10957436
13	NC_000958	GC	3	6	9899	9904	0 %	0 %	50 %	50 %	10957438
14	NC_000958	CG	3	6	10794	10799	0 %	0 %	50 %	50 %	10957438
15	NC_000958	GC	3	6	10889	10894	0 %	0 %	50 %	50 %	10957439
16	NC_000958	CT	3	6	11304	11309	0 %	50 %	0 %	50 %	10957439
17	NC_000958	GC	3	6	12224	12229	0 %	0 %	50 %	50 %	10957440
18	NC_000958	CG	3	6	12406	12411	0 %	0 %	50 %	50 %	10957440
19	NC_000958	CG	3	6	12636	12641	0 %	0 %	50 %	50 %	10957440
20	NC_000958	AT	3	6	15169	15174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_000958	CT	3	6	15454	15459	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_000958	CG	3	6	16608	16613	0 %	0 %	50 %	50 %	10957443
23	NC_000958	CT	3	6	17500	17505	0 %	50 %	0 %	50 %	10957444
24	NC_000958	CG	3	6	18555	18560	0 %	0 %	50 %	50 %	10957475
25	NC_000958	TC	3	6	19246	19251	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_000958	CG	3	6	19468	19473	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_000958	GC	3	6	19924	19929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_000958	CT	3	6	22901	22906	0 %	50 %	0 %	50 %	10957525
29	NC_000958	GC	3	6	23554	23559	0 %	0 %	50 %	50 %	10957492
30	NC_000958	AC	3	6	23801	23806	50 %	0 %	0 %	50 %	10957492
31	NC_000958	GA	3	6	25253	25258	50 %	0 %	50 %	0 %	10957445
32	NC_000958	CG	3	6	26273	26278	0 %	0 %	50 %	50 %	10957446
33	NC_000958	CA	3	6	26457	26462	50 %	0 %	0 %	50 %	10957446
34	NC_000958	GC	3	6	26583	26588	0 %	0 %	50 %	50 %	10957447
35	NC_000958	GC	3	6	28961	28966	0 %	0 %	50 %	50 %	10957449
36	NC_000958	CG	3	6	29466	29471	0 %	0 %	50 %	50 %	10957449
37	NC_000958	GC	3	6	29669	29674	0 %	0 %	50 %	50 %	10957449
38	NC_000958	CG	3	6	30255	30260	0 %	0 %	50 %	50 %	10957450
39	NC_000958	AG	4	8	31028	31035	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_000958	CT	3	6	31186	31191	0 %	50 %	0 %	50 %	10957466
41	NC_000958	AT	3	6	31819	31824	50 %	50 %	0 %	0 %	10957466
42	NC_000958	GC	3	6	32417	32422	0 %	0 %	50 %	50 %	10957451
43	NC_000958	GA	3	6	32449	32454	50 %	0 %	50 %	0 %	10957451
44	NC_000958	CT	3	6	33059	33064	0 %	50 %	0 %	50 %	10957451
45	NC_000958	GA	3	6	33405	33410	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_000958	GC	3	6	38463	38468	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_000958	AG	3	6	39084	39089	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_000958	CT	3	6	39163	39168	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_000958	GC	3	6	39188	39193	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_000958	GA	3	6	39581	39586	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_000958	GC	3	6	42123	42128	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_000958	GC	3	6	43074	43079	0 %	0 %	50 %	50 %	10957497
53	NC_000958	GC	3	6	43200	43205	0 %	0 %	50 %	50 %	10957497
54	NC_000958	GC	4	8	44236	44243	0 %	0 %	50 %	50 %	10957497
55	NC_000958	CG	3	6	46162	46167	0 %	0 %	50 %	50 %	10957498
56	NC_000958	GC	3	6	46310	46315	0 %	0 %	50 %	50 %	10957498
57	NC_000958	GC	3	6	46565	46570	0 %	0 %	50 %	50 %	10957498
58	NC_000958	GC	4	8	46634	46641	0 %	0 %	50 %	50 %	10957498
59	NC_000958	CG	3	6	46710	46715	0 %	0 %	50 %	50 %	10957498
60	NC_000958	GC	3	6	47070	47075	0 %	0 %	50 %	50 %	10957498
61	NC_000958	GC	3	6	47168	47173	0 %	0 %	50 %	50 %	10957498
62	NC_000958	CG	3	6	47478	47483	0 %	0 %	50 %	50 %	10957498
63	NC_000958	GC	3	6	47531	47536	0 %	0 %	50 %	50 %	10957498
64	NC_000958	CG	3	6	48365	48370	0 %	0 %	50 %	50 %	10957454
65	NC_000958	GC	3	6	48405	48410	0 %	0 %	50 %	50 %	10957454
66	NC_000958	GC	3	6	48817	48822	0 %	0 %	50 %	50 %	10957454
67	NC_000958	GC	3	6	48917	48922	0 %	0 %	50 %	50 %	10957454
68	NC_000958	CT	3	6	49294	49299	0 %	50 %	0 %	50 %	10957454
69	NC_000958	GC	3	6	50741	50746	0 %	0 %	50 %	50 %	10957455
70	NC_000958	TG	3	6	51519	51524	0 %	50 %	50 %	0 %	10957456
71	NC_000958	TG	3	6	51562	51567	0 %	50 %	50 %	0 %	10957456
72	NC_000958	TG	3	6	51721	51726	0 %	50 %	50 %	0 %	10957456
73	NC_000958	CG	3	6	51816	51821	0 %	0 %	50 %	50 %	10957456
74	NC_000958	GC	3	6	52037	52042	0 %	0 %	50 %	50 %	10957456
75	NC_000958	GC	3	6	52372	52377	0 %	0 %	50 %	50 %	10957456
76	NC_000958	CG	3	6	52805	52810	0 %	0 %	50 %	50 %	10957456
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80	NC_000958	CG	3	6	59958	59963	0 %	0 %	50 %	50 %	10957501
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82	NC_000958	GC	3	6	62117	62122	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_000958	CT	3	6	64437	64442	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_000958	TG	3	6	64583	64588	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_000958	TC	3	6	66395	66400	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_000958	CG	3	6	66617	66622	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_000958	GC	3	6	67073	67078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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90	NC_000958	TC	3	6	68847	68852	0 %	50 %	0 %	50 %	10957458
91	NC_000958	GC	3	6	69774	69779	0 %	0 %	50 %	50 %	10957504
92	NC_000958	GC	3	6	70147	70152	0 %	0 %	50 %	50 %	10957505
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96	NC_000958	GA	3	6	76648	76653	50 %	0 %	50 %	0 %	10957508
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98	NC_000958	CA	3	6	77041	77046	50 %	0 %	0 %	50 %	10957508
99	NC_000958	GA	3	6	77160	77165	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_000958	CG	3	6	77503	77508	0 %	0 %	50 %	50 %	10957509
101	NC_000958	CG	3	6	77645	77650	0 %	0 %	50 %	50 %	10957509
102	NC_000958	CG	3	6	77890	77895	0 %	0 %	50 %	50 %	10957509
103	NC_000958	GC	3	6	78063	78068	0 %	0 %	50 %	50 %	10957509
104	NC_000958	GC	3	6	78322	78327	0 %	0 %	50 %	50 %	10957509
105	NC_000958	GA	3	6	78531	78536	50 %	0 %	50 %	0 %	10957509
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107	NC_000958	CG	3	6	79206	79211	0 %	0 %	50 %	50 %	10957459
108	NC_000958	GC	3	6	79552	79557	0 %	0 %	50 %	50 %	10957459
109	NC_000958	CT	3	6	82576	82581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_000958	CA	3	6	82606	82611	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_000958	GC	3	6	82962	82967	0 %	0 %	50 %	50 %	10957510
112	NC_000958	GC	3	6	84609	84614	0 %	0 %	50 %	50 %	10957510
113	NC_000958	TC	3	6	85365	85370	0 %	50 %	0 %	50 %	10957460
114	NC_000958	GC	3	6	85497	85502	0 %	0 %	50 %	50 %	10957460
115	NC_000958	CT	3	6	87304	87309	0 %	50 %	0 %	50 %	10957460
116	NC_000958	GC	3	6	87746	87751	0 %	0 %	50 %	50 %	10957514
117	NC_000958	TG	3	6	89572	89577	0 %	50 %	50 %	0 %	10957462
118	NC_000958	GC	3	6	90795	90800	0 %	0 %	50 %	50 %	10957462
119	NC_000958	GA	3	6	91125	91130	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_000958	AG	3	6	91151	91156	50 %	0 %	50 %	0 %	10957463
121	NC_000958	GC	3	6	91211	91216	0 %	0 %	50 %	50 %	10957463
122	NC_000958	GC	3	6	91397	91402	0 %	0 %	50 %	50 %	10957463
123	NC_000958	CG	3	6	91820	91825	0 %	0 %	50 %	50 %	10957463
124	NC_000958	GC	3	6	92035	92040	0 %	0 %	50 %	50 %	10957463
125	NC_000958	GC	3	6	92114	92119	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_000958	CG	3	6	92739	92744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_000958	CG	3	6	92830	92835	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_000958	CG	3	6	93017	93022	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_000958	CG	3	6	93203	93208	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_000958	GC	3	6	95112	95117	0 %	0 %	50 %	50 %	10957464
131	NC_000958	GC	3	6	95273	95278	0 %	0 %	50 %	50 %	10957464
132	NC_000958	CG	3	6	95577	95582	0 %	0 %	50 %	50 %	10957464
133	NC_000958	GC	3	6	95753	95758	0 %	0 %	50 %	50 %	10957512
134	NC_000958	GC	3	6	96511	96516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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144	NC_000958	GC	3	6	100980	100985	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_000958	CG	3	6	101472	101477	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_000958	GC	3	6	102159	102164	0 %	0 %	50 %	50 %	10957402
147	NC_000958	CA	3	6	103977	103982	50 %	0 %	0 %	50 %	10957479
148	NC_000958	AG	3	6	104246	104251	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.