MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Deinococcus radiodurans R1 plasmid MP1

Total Repeats: 206

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000958	AG	3	6	852	857	50 %	0 %	50 %	0 %	10957476
2	NC_000958	TC	3	6	895	900	0 %	50 %	0 %	50 %	10957476
3	NC_000958	AG	4	8	3333	3340	50 %	0 %	50 %	0 %	10957490
4	NC_000958	CT	3	6	3554	3559	0 %	50 %	0 %	50 %	10957490
5	NC_000958	AG	3	6	5401	5406	50 %	0 %	50 %	0 %	10957491
6	NC_000958	GC	3	6	6141	6146	0 %	0 %	50 %	50 %	10957491
7	NC_000958	GC	3	6	7986	7991	0 %	0 %	50 %	50 %	10957436
8	NC_000958	CA	3	6	8225	8230	50 %	0 %	0 %	50 %	10957436
9	NC_000958	GC	3	6	8910	8915	0 %	0 %	50 %	50 %	10957436
10	NC_000958	GC	3	6	9899	9904	0 %	0 %	50 %	50 %	10957438
11	NC_000958	CG	3	6	10794	10799	0 %	0 %	50 %	50 %	10957438
12	NC_000958	GC	3	6	10889	10894	0 %	0 %	50 %	50 %	10957439
13	NC_000958	CT	3	6	11304	11309	0 %	50 %	0 %	50 %	10957439
14	NC_000958	GC	3	6	12224	12229	0 %	0 %	50 %	50 %	10957440
15	NC_000958	CG	3	6	12406	12411	0 %	0 %	50 %	50 %	10957440
16	NC_000958	CG	3	6	12636	12641	0 %	0 %	50 %	50 %	10957440
17	NC_000958	CG	3	6	16608	16613	0 %	0 %	50 %	50 %	10957443
18	NC_000958	CT	3	6	17500	17505	0 %	50 %	0 %	50 %	10957444
19	NC_000958	CG	3	6	18555	18560	0 %	0 %	50 %	50 %	10957475
20	NC_000958	CT	3	6	22901	22906	0 %	50 %	0 %	50 %	10957525
21	NC_000958	GC	3	6	23554	23559	0 %	0 %	50 %	50 %	10957492
22	NC_000958	AC	3	6	23801	23806	50 %	0 %	0 %	50 %	10957492
23	NC_000958	GA	3	6	25253	25258	50 %	0 %	50 %	0 %	10957445
24	NC_000958	CG	3	6	26273	26278	0 %	0 %	50 %	50 %	10957446
25	NC_000958	CA	3	6	26457	26462	50 %	0 %	0 %	50 %	10957446
26	NC_000958	GC	3	6	26583	26588	0 %	0 %	50 %	50 %	10957447
27	NC_000958	GC	3	6	28961	28966	0 %	0 %	50 %	50 %	10957449
28	NC_000958	CG	3	6	29466	29471	0 %	0 %	50 %	50 %	10957449
29	NC_000958	GC	3	6	29669	29674	0 %	0 %	50 %	50 %	10957449
30	NC_000958	CG	3	6	30255	30260	0 %	0 %	50 %	50 %	10957450
31	NC_000958	CT	3	6	31186	31191	0 %	50 %	0 %	50 %	10957466
32	NC_000958	AT	3	6	31819	31824	50 %	50 %	0 %	0 %	10957466
33	NC_000958	GC	3	6	32417	32422	0 %	0 %	50 %	50 %	10957451
34	NC_000958	GA	3	6	32449	32454	50 %	0 %	50 %	0 %	10957451
35	NC_000958	CT	3	6	33059	33064	0 %	50 %	0 %	50 %	10957451
36	NC_000958	GC	3	6	43074	43079	0 %	0 %	50 %	50 %	10957497
37	NC_000958	GC	3	6	43200	43205	0 %	0 %	50 %	50 %	10957497
38	NC_000958	GC	4	8	44236	44243	0 %	0 %	50 %	50 %	10957497
39	NC_000958	CG	3	6	46162	46167	0 %	0 %	50 %	50 %	10957498
40	NC_000958	GC	3	6	46310	46315	0 %	0 %	50 %	50 %	10957498
41	NC_000958	GC	3	6	46565	46570	0 %	0 %	50 %	50 %	10957498
42	NC_000958	GC	4	8	46634	46641	0 %	0 %	50 %	50 %	10957498
43	NC_000958	CG	3	6	46710	46715	0 %	0 %	50 %	50 %	10957498
44	NC_000958	GC	3	6	47070	47075	0 %	0 %	50 %	50 %	10957498
45	NC_000958	GC	3	6	47168	47173	0 %	0 %	50 %	50 %	10957498
46	NC_000958	CG	3	6	47478	47483	0 %	0 %	50 %	50 %	10957498
47	NC_000958	GC	3	6	47531	47536	0 %	0 %	50 %	50 %	10957498
48	NC_000958	CG	3	6	48365	48370	0 %	0 %	50 %	50 %	10957454
49	NC_000958	GC	3	6	48405	48410	0 %	0 %	50 %	50 %	10957454
50	NC_000958	GC	3	6	48817	48822	0 %	0 %	50 %	50 %	10957454
51	NC_000958	GC	3	6	48917	48922	0 %	0 %	50 %	50 %	10957454
52	NC_000958	CT	3	6	49294	49299	0 %	50 %	0 %	50 %	10957454
53	NC_000958	GC	3	6	50741	50746	0 %	0 %	50 %	50 %	10957455
54	NC_000958	TG	3	6	51519	51524	0 %	50 %	50 %	0 %	10957456
55	NC_000958	TG	3	6	51562	51567	0 %	50 %	50 %	0 %	10957456
56	NC_000958	TG	3	6	51721	51726	0 %	50 %	50 %	0 %	10957456
57	NC_000958	CG	3	6	51816	51821	0 %	0 %	50 %	50 %	10957456
58	NC_000958	GC	3	6	52037	52042	0 %	0 %	50 %	50 %	10957456
59	NC_000958	GC	3	6	52372	52377	0 %	0 %	50 %	50 %	10957456
60	NC_000958	CG	3	6	52805	52810	0 %	0 %	50 %	50 %	10957456
61	NC_000958	CG	3	6	55542	55547	0 %	0 %	50 %	50 %	10957499
62	NC_000958	CG	3	6	56374	56379	0 %	0 %	50 %	50 %	10957467
63	NC_000958	GC	3	6	57071	57076	0 %	0 %	50 %	50 %	10957500
64	NC_000958	CG	3	6	59958	59963	0 %	0 %	50 %	50 %	10957501
65	NC_000958	GC	3	6	60442	60447	0 %	0 %	50 %	50 %	10957457
66	NC_000958	AC	3	6	67673	67678	50 %	0 %	0 %	50 %	10957458
67	NC_000958	AG	3	6	67836	67841	50 %	0 %	50 %	0 %	10957458
68	NC_000958	TC	3	6	68847	68852	0 %	50 %	0 %	50 %	10957458
69	NC_000958	GC	3	6	69774	69779	0 %	0 %	50 %	50 %	10957504
70	NC_000958	GC	3	6	70147	70152	0 %	0 %	50 %	50 %	10957505
71	NC_000958	GT	3	6	71630	71635	0 %	50 %	50 %	0 %	10957506
72	NC_000958	CG	3	6	72480	72485	0 %	0 %	50 %	50 %	10957506
73	NC_000958	CG	3	6	74757	74762	0 %	0 %	50 %	50 %	10957508
74	NC_000958	GA	3	6	76648	76653	50 %	0 %	50 %	0 %	10957508
75	NC_000958	GC	3	6	76837	76842	0 %	0 %	50 %	50 %	10957508
76	NC_000958	CA	3	6	77041	77046	50 %	0 %	0 %	50 %	10957508
77	NC_000958	CG	3	6	77503	77508	0 %	0 %	50 %	50 %	10957509
78	NC_000958	CG	3	6	77645	77650	0 %	0 %	50 %	50 %	10957509
79	NC_000958	CG	3	6	77890	77895	0 %	0 %	50 %	50 %	10957509
80	NC_000958	GC	3	6	78063	78068	0 %	0 %	50 %	50 %	10957509
81	NC_000958	GC	3	6	78322	78327	0 %	0 %	50 %	50 %	10957509
82	NC_000958	GA	3	6	78531	78536	50 %	0 %	50 %	0 %	10957509
83	NC_000958	GC	3	6	78770	78775	0 %	0 %	50 %	50 %	10957459
84	NC_000958	CG	3	6	79206	79211	0 %	0 %	50 %	50 %	10957459
85	NC_000958	GC	3	6	79552	79557	0 %	0 %	50 %	50 %	10957459
86	NC_000958	GC	3	6	82962	82967	0 %	0 %	50 %	50 %	10957510
87	NC_000958	GC	3	6	84609	84614	0 %	0 %	50 %	50 %	10957510
88	NC_000958	TC	3	6	85365	85370	0 %	50 %	0 %	50 %	10957460
89	NC_000958	GC	3	6	85497	85502	0 %	0 %	50 %	50 %	10957460
90	NC_000958	CT	3	6	87304	87309	0 %	50 %	0 %	50 %	10957460
91	NC_000958	GC	3	6	87746	87751	0 %	0 %	50 %	50 %	10957514
92	NC_000958	TG	3	6	89572	89577	0 %	50 %	50 %	0 %	10957462
93	NC_000958	GC	3	6	90795	90800	0 %	0 %	50 %	50 %	10957462
94	NC_000958	AG	3	6	91151	91156	50 %	0 %	50 %	0 %	10957463
95	NC_000958	GC	3	6	91211	91216	0 %	0 %	50 %	50 %	10957463
96	NC_000958	GC	3	6	91397	91402	0 %	0 %	50 %	50 %	10957463
97	NC_000958	CG	3	6	91820	91825	0 %	0 %	50 %	50 %	10957463
98	NC_000958	GC	3	6	92035	92040	0 %	0 %	50 %	50 %	10957463
99	NC_000958	GC	3	6	95112	95117	0 %	0 %	50 %	50 %	10957464
100	NC_000958	GC	3	6	95273	95278	0 %	0 %	50 %	50 %	10957464
101	NC_000958	CG	3	6	95577	95582	0 %	0 %	50 %	50 %	10957464
102	NC_000958	GC	3	6	95753	95758	0 %	0 %	50 %	50 %	10957512
103	NC_000958	CG	3	6	98005	98010	0 %	0 %	50 %	50 %	10957399
104	NC_000958	GC	3	6	98086	98091	0 %	0 %	50 %	50 %	10957399
105	NC_000958	TC	3	6	98887	98892	0 %	50 %	0 %	50 %	10957400
106	NC_000958	GC	3	6	99197	99202	0 %	0 %	50 %	50 %	10957400
107	NC_000958	CG	3	6	99426	99431	0 %	0 %	50 %	50 %	10957400
108	NC_000958	CG	3	6	100004	100009	0 %	0 %	50 %	50 %	10957401
109	NC_000958	GC	3	6	100150	100155	0 %	0 %	50 %	50 %	10957401
110	NC_000958	GC	3	6	102159	102164	0 %	0 %	50 %	50 %	10957402
111	NC_000958	CA	3	6	103977	103982	50 %	0 %	0 %	50 %	10957479
112	NC_000958	CT	3	6	104306	104311	0 %	50 %	0 %	50 %	10957517
113	NC_000958	TC	3	6	104538	104543	0 %	50 %	0 %	50 %	10957403
114	NC_000958	CG	3	6	106973	106978	0 %	0 %	50 %	50 %	10957404
115	NC_000958	GC	3	6	107481	107486	0 %	0 %	50 %	50 %	10957405
116	NC_000958	CT	3	6	108874	108879	0 %	50 %	0 %	50 %	10957480
117	NC_000958	GC	3	6	109547	109552	0 %	0 %	50 %	50 %	10957480
118	NC_000958	CT	3	6	110053	110058	0 %	50 %	0 %	50 %	10957406
119	NC_000958	AC	3	6	110120	110125	50 %	0 %	0 %	50 %	10957406
120	NC_000958	CG	5	10	110481	110490	0 %	0 %	50 %	50 %	10957406
121	NC_000958	CG	4	8	110553	110560	0 %	0 %	50 %	50 %	10957406
122	NC_000958	GC	3	6	110981	110986	0 %	0 %	50 %	50 %	10957406
123	NC_000958	GC	3	6	111080	111085	0 %	0 %	50 %	50 %	10957406
124	NC_000958	CG	4	8	111165	111172	0 %	0 %	50 %	50 %	10957406
125	NC_000958	CG	3	6	111413	111418	0 %	0 %	50 %	50 %	10957407
126	NC_000958	CG	3	6	111584	111589	0 %	0 %	50 %	50 %	10957407
127	NC_000958	CG	3	6	111690	111695	0 %	0 %	50 %	50 %	10957407
128	NC_000958	GC	3	6	111807	111812	0 %	0 %	50 %	50 %	10957407
129	NC_000958	CG	3	6	111857	111862	0 %	0 %	50 %	50 %	10957407
130	NC_000958	CG	3	6	112435	112440	0 %	0 %	50 %	50 %	10957408
131	NC_000958	GC	3	6	112887	112892	0 %	0 %	50 %	50 %	10957408
132	NC_000958	CG	3	6	114155	114160	0 %	0 %	50 %	50 %	10957409
133	NC_000958	GA	3	6	114549	114554	50 %	0 %	50 %	0 %	10957481
134	NC_000958	CG	3	6	115057	115062	0 %	0 %	50 %	50 %	10957481
135	NC_000958	CT	3	6	115852	115857	0 %	50 %	0 %	50 %	10957521
136	NC_000958	GC	3	6	116041	116046	0 %	0 %	50 %	50 %	10957521
137	NC_000958	CG	3	6	116760	116765	0 %	0 %	50 %	50 %	10957483
138	NC_000958	CG	3	6	117291	117296	0 %	0 %	50 %	50 %	10957483
139	NC_000958	CT	3	6	117769	117774	0 %	50 %	0 %	50 %	10957484
140	NC_000958	GC	3	6	117869	117874	0 %	0 %	50 %	50 %	10957484
141	NC_000958	CG	3	6	118252	118257	0 %	0 %	50 %	50 %	10957484
142	NC_000958	CG	3	6	118373	118378	0 %	0 %	50 %	50 %	10957484
143	NC_000958	CG	3	6	118681	118686	0 %	0 %	50 %	50 %	10957484
144	NC_000958	GC	3	6	119408	119413	0 %	0 %	50 %	50 %	10957515
145	NC_000958	CG	3	6	119947	119952	0 %	0 %	50 %	50 %	10957485
146	NC_000958	AG	3	6	119963	119968	50 %	0 %	50 %	0 %	10957485
147	NC_000958	TC	3	6	123181	123186	0 %	50 %	0 %	50 %	10957410
148	NC_000958	CG	3	6	123403	123408	0 %	0 %	50 %	50 %	10957410
149	NC_000958	GC	3	6	123859	123864	0 %	0 %	50 %	50 %	10957410
150	NC_000958	CT	3	6	124466	124471	0 %	50 %	0 %	50 %	10957411
151	NC_000958	GC	3	6	126175	126180	0 %	0 %	50 %	50 %	10957412
152	NC_000958	GC	3	6	128217	128222	0 %	0 %	50 %	50 %	10957414
153	NC_000958	GC	3	6	128255	128260	0 %	0 %	50 %	50 %	10957414
154	NC_000958	CA	3	6	130353	130358	50 %	0 %	0 %	50 %	10957416
155	NC_000958	AC	3	6	131091	131096	50 %	0 %	0 %	50 %	10957416
156	NC_000958	CG	3	6	131861	131866	0 %	0 %	50 %	50 %	10957416
157	NC_000958	CA	3	6	131867	131872	50 %	0 %	0 %	50 %	10957416
158	NC_000958	TC	3	6	135082	135087	0 %	50 %	0 %	50 %	15795188
159	NC_000958	CG	3	6	135304	135309	0 %	0 %	50 %	50 %	15795188
160	NC_000958	GC	3	6	135759	135764	0 %	0 %	50 %	50 %	15795188
161	NC_000958	CT	3	6	140622	140627	0 %	50 %	0 %	50 %	10957419
162	NC_000958	CG	3	6	143644	143649	0 %	0 %	50 %	50 %	10957421
163	NC_000958	GC	3	6	143894	143899	0 %	0 %	50 %	50 %	10957421
164	NC_000958	GC	3	6	144247	144252	0 %	0 %	50 %	50 %	10957421
165	NC_000958	GC	5	10	144442	144451	0 %	0 %	50 %	50 %	10957422
166	NC_000958	GC	3	6	146260	146265	0 %	0 %	50 %	50 %	10957424
167	NC_000958	GC	3	6	146384	146389	0 %	0 %	50 %	50 %	10957424
168	NC_000958	AC	3	6	146534	146539	50 %	0 %	0 %	50 %	10957424
169	NC_000958	CT	3	6	148793	148798	0 %	50 %	0 %	50 %	10957426
170	NC_000958	AG	4	8	150025	150032	50 %	0 %	50 %	0 %	10957427
171	NC_000958	GA	3	6	150281	150286	50 %	0 %	50 %	0 %	10957427
172	NC_000958	CT	3	6	151577	151582	0 %	50 %	0 %	50 %	10957428
173	NC_000958	GC	3	6	153241	153246	0 %	0 %	50 %	50 %	10957429
174	NC_000958	GC	3	6	154686	154691	0 %	0 %	50 %	50 %	10957430
175	NC_000958	GC	3	6	157258	157263	0 %	0 %	50 %	50 %	10957431
176	NC_000958	GA	3	6	157901	157906	50 %	0 %	50 %	0 %	10957431
177	NC_000958	GC	3	6	159091	159096	0 %	0 %	50 %	50 %	10957431
178	NC_000958	CG	3	6	159445	159450	0 %	0 %	50 %	50 %	10957431
179	NC_000958	CT	3	6	159659	159664	0 %	50 %	0 %	50 %	10957431
180	NC_000958	CT	3	6	159779	159784	0 %	50 %	0 %	50 %	10957431
181	NC_000958	CG	3	6	159915	159920	0 %	0 %	50 %	50 %	10957431
182	NC_000958	AC	3	6	159988	159993	50 %	0 %	0 %	50 %	10957431
183	NC_000958	GC	3	6	160694	160699	0 %	0 %	50 %	50 %	10957431
184	NC_000958	CG	3	6	160819	160824	0 %	0 %	50 %	50 %	10957431
185	NC_000958	CT	3	6	160910	160915	0 %	50 %	0 %	50 %	10957431
186	NC_000958	CG	3	6	163195	163200	0 %	0 %	50 %	50 %	10957432
187	NC_000958	GA	3	6	163499	163504	50 %	0 %	50 %	0 %	10957432
188	NC_000958	CT	3	6	163915	163920	0 %	50 %	0 %	50 %	10957432
189	NC_000958	GC	3	6	164970	164975	0 %	0 %	50 %	50 %	10957432
190	NC_000958	CG	4	8	165015	165022	0 %	0 %	50 %	50 %	10957432
191	NC_000958	CG	3	6	165363	165368	0 %	0 %	50 %	50 %	10957433
192	NC_000958	GC	3	6	165779	165784	0 %	0 %	50 %	50 %	10957433
193	NC_000958	CG	3	6	165909	165914	0 %	0 %	50 %	50 %	10957433
194	NC_000958	GC	3	6	166244	166249	0 %	0 %	50 %	50 %	10957433
195	NC_000958	AC	3	6	167432	167437	50 %	0 %	0 %	50 %	10957434
196	NC_000958	GA	3	6	168091	168096	50 %	0 %	50 %	0 %	10957434
197	NC_000958	TA	3	6	170525	170530	50 %	50 %	0 %	0 %	10957478
198	NC_000958	AG	3	6	170644	170649	50 %	0 %	50 %	0 %	10957478
199	NC_000958	AT	3	6	170906	170911	50 %	50 %	0 %	0 %	10957478
200	NC_000958	CG	3	6	173091	173096	0 %	0 %	50 %	50 %	10957435
201	NC_000958	CT	3	6	173220	173225	0 %	50 %	0 %	50 %	10957435
202	NC_000958	GT	3	6	173770	173775	0 %	50 %	50 %	0 %	10957435
203	NC_000958	GA	3	6	173788	173793	50 %	0 %	50 %	0 %	10957435
204	NC_000958	AC	3	6	175799	175804	50 %	0 %	0 %	50 %	10957488
205	NC_000958	GA	3	6	176794	176799	50 %	0 %	50 %	0 %	10957489
206	NC_000958	TC	3	6	177413	177418	0 %	50 %	0 %	50 %	10957489

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.