MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Deinococcus radiodurans R1 plasmid MP1

Total Repeats: 110

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000958	C	6	6	1202	1207	0 %	0 %	0 %	100 %	10957476
2	NC_000958	T	6	6	4679	4684	0 %	100 %	0 %	0 %	10957491
3	NC_000958	T	7	7	5506	5512	0 %	100 %	0 %	0 %	10957491
4	NC_000958	T	6	6	8036	8041	0 %	100 %	0 %	0 %	10957436
5	NC_000958	A	6	6	14480	14485	100 %	0 %	0 %	0 %	10957524
6	NC_000958	G	6	6	14722	14727	0 %	0 %	100 %	0 %	10957524
7	NC_000958	C	6	6	16536	16541	0 %	0 %	0 %	100 %	10957443
8	NC_000958	G	6	6	16990	16995	0 %	0 %	100 %	0 %	10957443
9	NC_000958	T	6	6	18386	18391	0 %	100 %	0 %	0 %	10957475
10	NC_000958	C	6	6	18432	18437	0 %	0 %	0 %	100 %	10957475
11	NC_000958	A	9	9	19024	19032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_000958	G	6	6	20083	20088	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13	NC_000958	T	6	6	21121	21126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_000958	T	6	6	22956	22961	0 %	100 %	0 %	0 %	10957525
15	NC_000958	A	6	6	24948	24953	100 %	0 %	0 %	0 %	10957493
16	NC_000958	G	7	7	27210	27216	0 %	0 %	100 %	0 %	10957448
17	NC_000958	G	6	6	32049	32054	0 %	0 %	100 %	0 %	10957466
18	NC_000958	T	6	6	32268	32273	0 %	100 %	0 %	0 %	10957451
19	NC_000958	A	7	7	32306	32312	100 %	0 %	0 %	0 %	10957451
20	NC_000958	T	6	6	33757	33762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_000958	A	6	6	33884	33889	100 %	0 %	0 %	0 %	10957452
22	NC_000958	A	6	6	35008	35013	100 %	0 %	0 %	0 %	10957452
23	NC_000958	G	6	6	35056	35061	0 %	0 %	100 %	0 %	10957452
24	NC_000958	T	6	6	41747	41752	0 %	100 %	0 %	0 %	10957496
25	NC_000958	T	6	6	41785	41790	0 %	100 %	0 %	0 %	10957496
26	NC_000958	C	6	6	42019	42024	0 %	0 %	0 %	100 %	10957496
27	NC_000958	G	8	8	42322	42329	0 %	0 %	100 %	0 %	10957497
28	NC_000958	C	6	6	44492	44497	0 %	0 %	0 %	100 %	10957497
29	NC_000958	G	6	6	45668	45673	0 %	0 %	100 %	0 %	10957498
30	NC_000958	G	6	6	46410	46415	0 %	0 %	100 %	0 %	10957498
31	NC_000958	A	6	6	48085	48090	100 %	0 %	0 %	0 %	10957454
32	NC_000958	C	6	6	51942	51947	0 %	0 %	0 %	100 %	10957456
33	NC_000958	A	7	7	54404	54410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_000958	G	6	6	57615	57620	0 %	0 %	100 %	0 %	10957500
35	NC_000958	G	6	6	58380	58385	0 %	0 %	100 %	0 %	10957501
36	NC_000958	G	6	6	60062	60067	0 %	0 %	100 %	0 %	10957501
37	NC_000958	G	6	6	61619	61624	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
38	NC_000958	T	6	6	61940	61945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_000958	A	8	8	64720	64727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_000958	G	6	6	67232	67237	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
41	NC_000958	G	6	6	67578	67583	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
42	NC_000958	A	6	6	68370	68375	100 %	0 %	0 %	0 %	10957458
43	NC_000958	A	6	6	69061	69066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000958	G	6	6	70801	70806	0 %	0 %	100 %	0 %	10957505
45	NC_000958	G	6	6	70961	70966	0 %	0 %	100 %	0 %	10957506
46	NC_000958	G	6	6	72505	72510	0 %	0 %	100 %	0 %	10957506
47	NC_000958	G	6	6	77586	77591	0 %	0 %	100 %	0 %	10957509
48	NC_000958	C	6	6	77843	77848	0 %	0 %	0 %	100 %	10957509
49	NC_000958	C	7	7	77855	77861	0 %	0 %	0 %	100 %	10957509
50	NC_000958	C	7	7	78400	78406	0 %	0 %	0 %	100 %	10957509
51	NC_000958	A	6	6	80752	80757	100 %	0 %	0 %	0 %	10957459
52	NC_000958	C	6	6	81480	81485	0 %	0 %	0 %	100 %	10957459
53	NC_000958	T	6	6	82015	82020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_000958	C	6	6	83189	83194	0 %	0 %	0 %	100 %	10957510
55	NC_000958	T	6	6	87635	87640	0 %	100 %	0 %	0 %	10957514
56	NC_000958	A	6	6	88758	88763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_000958	T	6	6	89259	89264	0 %	100 %	0 %	0 %	10957462
58	NC_000958	T	6	6	94027	94032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_000958	C	7	7	94843	94849	0 %	0 %	0 %	100 %	10957464
60	NC_000958	G	6	6	95289	95294	0 %	0 %	100 %	0 %	10957464
61	NC_000958	C	6	6	95810	95815	0 %	0 %	0 %	100 %	10957512
62	NC_000958	G	6	6	97510	97515	0 %	0 %	100 %	0 %	10957399
63	NC_000958	T	7	7	97850	97856	0 %	100 %	0 %	0 %	10957399
64	NC_000958	T	6	6	98698	98703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_000958	G	6	6	98986	98991	0 %	0 %	100 %	0 %	10957400
66	NC_000958	G	6	6	99506	99511	0 %	0 %	100 %	0 %	10957400
67	NC_000958	G	6	6	99761	99766	0 %	0 %	100 %	0 %	10957401
68	NC_000958	C	6	6	101459	101464	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
69	NC_000958	C	6	6	101661	101666	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
70	NC_000958	C	6	6	106400	106405	0 %	0 %	0 %	100 %	10957404
71	NC_000958	A	6	6	108949	108954	100 %	0 %	0 %	0 %	10957480
72	NC_000958	A	6	6	109198	109203	100 %	0 %	0 %	0 %	10957480
73	NC_000958	G	6	6	109342	109347	0 %	0 %	100 %	0 %	10957480
74	NC_000958	C	6	6	111841	111846	0 %	0 %	0 %	100 %	10957407
75	NC_000958	C	6	6	113275	113280	0 %	0 %	0 %	100 %	10957409
76	NC_000958	A	6	6	121248	121253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_000958	T	6	6	121472	121477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_000958	G	6	6	124018	124023	0 %	0 %	100 %	0 %	10957410
79	NC_000958	G	6	6	127475	127480	0 %	0 %	100 %	0 %	10957414
80	NC_000958	T	6	6	127809	127814	0 %	100 %	0 %	0 %	10957414
81	NC_000958	A	6	6	129512	129517	100 %	0 %	0 %	0 %	10957415
82	NC_000958	T	7	7	129563	129569	0 %	100 %	0 %	0 %	10957415
83	NC_000958	A	8	8	134233	134240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_000958	G	6	6	135918	135923	0 %	0 %	100 %	0 %	15795188
85	NC_000958	G	6	6	136440	136445	0 %	0 %	100 %	0 %	10957528
86	NC_000958	C	6	6	137062	137067	0 %	0 %	0 %	100 %	10957486
87	NC_000958	A	6	6	137375	137380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_000958	A	6	6	139541	139546	100 %	0 %	0 %	0 %	10957418
89	NC_000958	C	6	6	141021	141026	0 %	0 %	0 %	100 %	10957419
90	NC_000958	T	8	8	141672	141679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_000958	G	6	6	143426	143431	0 %	0 %	100 %	0 %	10957421
92	NC_000958	C	6	6	144870	144875	0 %	0 %	0 %	100 %	10957422
93	NC_000958	A	6	6	144917	144922	100 %	0 %	0 %	0 %	10957422
94	NC_000958	G	6	6	152219	152224	0 %	0 %	100 %	0 %	10957428
95	NC_000958	C	6	6	153082	153087	0 %	0 %	0 %	100 %	10957429
96	NC_000958	T	7	7	157055	157061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_000958	G	6	6	158246	158251	0 %	0 %	100 %	0 %	10957431
98	NC_000958	C	7	7	158659	158665	0 %	0 %	0 %	100 %	10957431
99	NC_000958	G	6	6	161255	161260	0 %	0 %	100 %	0 %	10957431
100	NC_000958	C	6	6	161808	161813	0 %	0 %	0 %	100 %	10957431
101	NC_000958	C	7	7	162464	162470	0 %	0 %	0 %	100 %	10957432
102	NC_000958	G	6	6	163793	163798	0 %	0 %	100 %	0 %	10957432
103	NC_000958	C	6	6	165057	165062	0 %	0 %	0 %	100 %	10957432
104	NC_000958	C	6	6	165243	165248	0 %	0 %	0 %	100 %	10957433
105	NC_000958	G	6	6	165386	165391	0 %	0 %	100 %	0 %	10957433
106	NC_000958	A	9	9	169102	169110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_000958	T	6	6	171596	171601	0 %	100 %	0 %	0 %	10957435
108	NC_000958	T	6	6	171873	171878	0 %	100 %	0 %	0 %	10957435
109	NC_000958	C	7	7	173710	173716	0 %	0 %	0 %	100 %	10957435
110	NC_000958	A	7	7	175319	175325	100 %	0 %	0 %	0 %	10957488

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.