MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp5

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000957	ATA	2	6	74	79	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000957	AAT	2	6	239	244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_000957	AAC	2	6	283	288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	364556595
4	NC_000957	CAA	2	6	334	339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	364556595
5	NC_000957	ATT	2	6	367	372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556595
6	NC_000957	CCT	2	6	426	431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	364556595
7	NC_000957	CAA	2	6	442	447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	364556595
8	NC_000957	TAA	2	6	571	576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556595
9	NC_000957	TAC	2	6	629	634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	364556595
10	NC_000957	AAT	2	6	656	661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_000957	TAA	2	6	719	724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_000957	TAA	2	6	805	810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497446
13	NC_000957	TAA	2	6	952	957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497446
14	NC_000957	TAA	2	6	998	1003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497446
15	NC_000957	TAC	2	6	1035	1040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497446
16	NC_000957	ACT	2	6	1084	1089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497446
17	NC_000957	ATA	2	6	1187	1192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_000957	AAT	2	6	1216	1221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497451
19	NC_000957	TAA	2	6	1356	1361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497451
20	NC_000957	TTG	2	6	1537	1542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497451
21	NC_000957	TAT	2	6	1644	1649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_000957	ATT	2	6	1827	1832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_000957	CTT	2	6	1948	1953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_000957	TCG	2	6	1968	1973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_000957	ACA	2	6	2160	2165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497447
26	NC_000957	TAA	2	6	2189	2194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497447
27	NC_000957	CAA	2	6	2224	2229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497447
28	NC_000957	CAA	2	6	2380	2385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497447
29	NC_000957	ACT	2	6	2386	2391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497447
30	NC_000957	TTA	2	6	2426	2431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497447
31	NC_000957	GAA	2	6	2496	2501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497447
32	NC_000957	CAA	2	6	2531	2536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497447
33	NC_000957	TAA	6	18	2579	2596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497447
34	NC_000957	AGA	2	6	2603	2608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497447
35	NC_000957	TAA	2	6	2641	2646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497447
36	NC_000957	CAA	2	6	2654	2659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497447
37	NC_000957	TTC	2	6	2683	2688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497447
38	NC_000957	TTA	2	6	2694	2699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497447
39	NC_000957	ATA	2	6	2733	2738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497447
40	NC_000957	CTA	2	6	2788	2793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497447
41	NC_000957	AGA	2	6	2858	2863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497447
42	NC_000957	TAT	2	6	2939	2944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497447
43	NC_000957	ACA	2	6	2971	2976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497447
44	NC_000957	CAA	2	6	3024	3029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497447
45	NC_000957	AAC	2	6	3073	3078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497447
46	NC_000957	TAT	2	6	3113	3118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497447
47	NC_000957	ACA	2	6	3154	3159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497447
48	NC_000957	ATA	2	6	3195	3200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497447
49	NC_000957	GTT	2	6	3246	3251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497447
50	NC_000957	ATT	2	6	3314	3319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_000957	AAT	2	6	3354	3359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497448
52	NC_000957	ATT	2	6	3409	3414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497448
53	NC_000957	ATG	2	6	3458	3463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497448
54	NC_000957	TAA	3	9	3660	3668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497448
55	NC_000957	GTA	2	6	3745	3750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497448
56	NC_000957	TCA	2	6	3751	3756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497448
57	NC_000957	CAA	2	6	3782	3787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497448
58	NC_000957	AGG	2	6	3825	3830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497448
59	NC_000957	ATA	2	6	3832	3837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497448
60	NC_000957	TAT	2	6	3882	3887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497448
61	NC_000957	TAA	2	6	3911	3916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497448
62	NC_000957	TAT	2	6	4164	4169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497448
63	NC_000957	ATT	2	6	4170	4175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497448
64	NC_000957	GAA	2	6	4228	4233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497448
65	NC_000957	TTG	2	6	4250	4255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497448
66	NC_000957	TAG	2	6	4259	4264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497448
67	NC_000957	GAA	2	6	4270	4275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497448
68	NC_000957	ATA	2	6	4292	4297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497448
69	NC_000957	AAT	2	6	4318	4323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497448
70	NC_000957	TAA	2	6	4339	4344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_000957	TAA	2	6	4358	4363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_000957	ATG	2	6	4497	4502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497449
73	NC_000957	TGA	2	6	4674	4679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497449
74	NC_000957	TGA	2	6	4725	4730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497449
75	NC_000957	TAA	2	6	4852	4857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_000957	TTG	2	6	4883	4888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_000957	AAT	2	6	4890	4895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_000957	TAT	2	6	4902	4907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_000957	CTA	2	6	5007	5012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_000957	AGA	2	6	5017	5022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_000957	TCC	2	6	5027	5032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_000957	AAT	2	6	5195	5200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.