MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp56

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000956	TATTGA	2	12	2678	2689	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000956	TAATAT	2	12	3572	3583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_000956	ATTAAT	2	12	3598	3609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_000956	AAATAC	2	12	4694	4705	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	11497377
5	NC_000956	ATCAAG	2	12	6695	6706	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_000956	GAATTT	2	12	8673	8684	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	364556569
7	NC_000956	TGAACT	2	12	8711	8722	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	364556569
8	NC_000956	TAGAAT	2	12	15400	15411	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	11497417
9	NC_000956	ACAGAA	2	12	17259	17270	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	11497386
10	NC_000956	AATGGT	2	12	18872	18883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497388
11	NC_000956	AGTTAA	2	12	19761	19772	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	364556571
12	NC_000956	CAAAAA	2	12	21150	21161	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	11497393
13	NC_000956	TTTTCG	2	12	21983	21994	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	11497394
14	NC_000956	ATATTG	2	12	24696	24707	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	11497397
15	NC_000956	TAAAAA	2	12	25035	25046	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	11497397
16	NC_000956	ACAAAT	2	12	26576	26587	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_000956	TAGTGT	2	12	28225	28236	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	364556573
18	NC_000956	AAGTAA	2	12	29541	29552	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_000956	CAAAAA	2	12	29587	29598	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_000956	AATTGT	2	12	29887	29898	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_000956	AAACAA	2	12	30408	30419	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	11497403
22	NC_000956	AAACGA	2	12	30498	30509	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	11497403
23	NC_000956	ATTAGA	2	12	31548	31559	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	364556577
24	NC_000956	AAAGCA	2	12	32418	32429	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	11497421
25	NC_000956	TAGAAA	2	12	34405	34416	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_000956	CTGATA	2	12	36798	36809	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	11497424
27	NC_000956	TTTAAT	2	12	37240	37251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_000956	CTCAGC	2	12	39761	39772	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	11497430
29	NC_000956	TATTTA	2	12	40427	40438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556574
30	NC_000956	TTCATT	2	12	40544	40555	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	364556574
31	NC_000956	CCTGTT	2	12	42501	42512	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	364556574
32	NC_000956	TATAAA	2	12	43700	43711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_000956	ATCATA	2	12	44676	44687	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_000956	TCTTTT	2	12	48400	48411	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_000956	TAAAAA	2	12	48582	48593	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_000956	GTCTAT	2	12	51322	51333	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	11497406
37	NC_000956	TAGTTT	2	12	51661	51672	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_000956	GTTTTT	2	12	51786	51797	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_000956	AAGTTA	2	12	52929	52940	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.