MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp56

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000956	TAAAA	2	10	134	143	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000956	TTTTA	2	10	239	248	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_000956	ATTAT	2	10	2530	2539	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_000956	CTAAA	2	10	4244	4253	60 %	20 %	0 %	20 %	11497377
5	NC_000956	ATTTT	2	10	6487	6496	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_000956	TTCAA	2	10	7849	7858	40 %	40 %	0 %	20 %	364556568
7	NC_000956	GAAAA	2	10	10385	10394	80 %	0 %	20 %	0 %	11497410
8	NC_000956	CAAAA	2	10	12949	12958	80 %	0 %	0 %	20 %	11497414
9	NC_000956	GAAAA	2	10	13836	13845	80 %	0 %	20 %	0 %	11497415
10	NC_000956	AATCT	2	10	15752	15761	40 %	40 %	0 %	20 %	11497417
11	NC_000956	GGACT	2	10	16135	16144	20 %	20 %	40 %	20 %	11497384
12	NC_000956	AACTT	2	10	16220	16229	40 %	40 %	0 %	20 %	11497384
13	NC_000956	GAAAA	2	10	16856	16865	80 %	0 %	20 %	0 %	11497385
14	NC_000956	AAAGT	2	10	16878	16887	60 %	20 %	20 %	0 %	11497385
15	NC_000956	AAATC	2	10	18154	18163	60 %	20 %	0 %	20 %	11497387
16	NC_000956	ATTAA	2	10	18722	18731	60 %	40 %	0 %	0 %	11497388
17	NC_000956	AGTAA	2	10	19359	19368	60 %	20 %	20 %	0 %	11497390
18	NC_000956	TCACT	2	10	19516	19525	20 %	40 %	0 %	40 %	11497390
19	NC_000956	TTGCT	2	10	19613	19622	0 %	60 %	20 %	20 %	364556571
20	NC_000956	TATGT	2	10	19723	19732	20 %	60 %	20 %	0 %	364556571
21	NC_000956	TTGTA	2	10	22688	22697	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_000956	CACTA	2	10	23042	23051	40 %	20 %	0 %	40 %	11497395
23	NC_000956	CAAAA	2	10	25708	25717	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_000956	TTTTA	2	10	26566	26575	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_000956	CAATC	2	10	26772	26781	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_000956	ATAAA	2	10	28309	28318	80 %	20 %	0 %	0 %	11497401
27	NC_000956	AAAGA	2	10	30517	30526	80 %	0 %	20 %	0 %	11497403
28	NC_000956	GAAAA	2	10	31389	31398	80 %	0 %	20 %	0 %	364556577
29	NC_000956	ATTTT	2	10	31594	31603	20 %	80 %	0 %	0 %	364556577
30	NC_000956	AAAAC	2	10	33888	33897	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_000956	ATTAA	2	10	35589	35598	60 %	40 %	0 %	0 %	11497422
32	NC_000956	TGGCA	2	10	36139	36148	20 %	20 %	40 %	20 %	11497423
33	NC_000956	AATTA	2	10	36380	36389	60 %	40 %	0 %	0 %	11497423
34	NC_000956	TTAAA	2	10	36639	36648	60 %	40 %	0 %	0 %	11497424
35	NC_000956	ATTTT	2	10	37092	37101	20 %	80 %	0 %	0 %	11497424
36	NC_000956	AAATT	2	10	39947	39956	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_000956	TTCAT	2	10	39978	39987	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_000956	AGAAA	2	10	40355	40364	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_000956	AAACA	2	10	41107	41116	80 %	0 %	0 %	20 %	364556574
40	NC_000956	AAAAG	2	10	42230	42239	80 %	0 %	20 %	0 %	364556574
41	NC_000956	CATTT	2	10	42581	42590	20 %	60 %	0 %	20 %	364556574
42	NC_000956	AAATA	2	10	43220	43229	80 %	20 %	0 %	0 %	364556574
43	NC_000956	AACTA	2	10	43731	43740	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_000956	AATTT	2	10	43823	43832	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_000956	TAATT	2	10	45276	45285	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_000956	ATTTA	2	10	45328	45337	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_000956	GTATT	2	10	45881	45890	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_000956	AATTA	2	10	47002	47011	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_000956	ATTTT	2	10	47041	47050	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_000956	ATATA	2	10	48690	48699	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_000956	ATTTT	2	10	49287	49296	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_000956	AATAT	2	10	49548	49557	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_000956	AAATT	2	10	50593	50602	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_000956	TAGTT	2	10	51644	51653	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.