MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp56

Total Repeats: 30

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000956	CTAAA	2	10	4244	4253	60 %	20 %	0 %	20 %	11497377
2	NC_000956	TTCAA	2	10	7849	7858	40 %	40 %	0 %	20 %	364556568
3	NC_000956	GAAAA	2	10	10385	10394	80 %	0 %	20 %	0 %	11497410
4	NC_000956	CAAAA	2	10	12949	12958	80 %	0 %	0 %	20 %	11497414
5	NC_000956	GAAAA	2	10	13836	13845	80 %	0 %	20 %	0 %	11497415
6	NC_000956	AATCT	2	10	15752	15761	40 %	40 %	0 %	20 %	11497417
7	NC_000956	GGACT	2	10	16135	16144	20 %	20 %	40 %	20 %	11497384
8	NC_000956	AACTT	2	10	16220	16229	40 %	40 %	0 %	20 %	11497384
9	NC_000956	GAAAA	2	10	16856	16865	80 %	0 %	20 %	0 %	11497385
10	NC_000956	AAAGT	2	10	16878	16887	60 %	20 %	20 %	0 %	11497385
11	NC_000956	AAATC	2	10	18154	18163	60 %	20 %	0 %	20 %	11497387
12	NC_000956	ATTAA	2	10	18722	18731	60 %	40 %	0 %	0 %	11497388
13	NC_000956	AGTAA	2	10	19359	19368	60 %	20 %	20 %	0 %	11497390
14	NC_000956	TCACT	2	10	19516	19525	20 %	40 %	0 %	40 %	11497390
15	NC_000956	TTGCT	2	10	19613	19622	0 %	60 %	20 %	20 %	364556571
16	NC_000956	TATGT	2	10	19723	19732	20 %	60 %	20 %	0 %	364556571
17	NC_000956	CACTA	2	10	23042	23051	40 %	20 %	0 %	40 %	11497395
18	NC_000956	ATAAA	2	10	28309	28318	80 %	20 %	0 %	0 %	11497401
19	NC_000956	AAAGA	2	10	30517	30526	80 %	0 %	20 %	0 %	11497403
20	NC_000956	GAAAA	2	10	31389	31398	80 %	0 %	20 %	0 %	364556577
21	NC_000956	ATTTT	2	10	31594	31603	20 %	80 %	0 %	0 %	364556577
22	NC_000956	ATTAA	2	10	35589	35598	60 %	40 %	0 %	0 %	11497422
23	NC_000956	TGGCA	2	10	36139	36148	20 %	20 %	40 %	20 %	11497423
24	NC_000956	AATTA	2	10	36380	36389	60 %	40 %	0 %	0 %	11497423
25	NC_000956	TTAAA	2	10	36639	36648	60 %	40 %	0 %	0 %	11497424
26	NC_000956	ATTTT	2	10	37092	37101	20 %	80 %	0 %	0 %	11497424
27	NC_000956	AAACA	2	10	41107	41116	80 %	0 %	0 %	20 %	364556574
28	NC_000956	AAAAG	2	10	42230	42239	80 %	0 %	20 %	0 %	364556574
29	NC_000956	CATTT	2	10	42581	42590	20 %	60 %	0 %	20 %	364556574
30	NC_000956	AAATA	2	10	43220	43229	80 %	20 %	0 %	0 %	364556574

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.