MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp56

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000956	ATAA	2	8	26	33	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000956	AAAC	2	8	357	364	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_000956	ATCT	2	8	754	761	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_000956	AAAC	2	8	2137	2144	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_000956	TAAA	2	8	2315	2322	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_000956	TAAT	2	8	2431	2438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_000956	ATTT	2	8	2509	2516	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_000956	ATCA	2	8	2566	2573	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_000956	TTAA	2	8	2655	2662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_000956	CATT	2	8	3540	3547	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_000956	ATAA	2	8	4189	4196	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_000956	CTTA	2	8	5000	5007	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_000956	ATTT	2	8	6393	6400	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_000956	TTTG	2	8	6538	6545	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_000956	CAAT	2	8	6668	6675	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_000956	AAGT	2	8	9531	9538	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_000956	TCAA	2	8	21465	21472	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_000956	AATA	2	8	22500	22507	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_000956	TAAA	2	8	26818	26825	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_000956	ATTA	2	8	28291	28298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_000956	TGCA	2	8	29627	29634	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_000956	AAGA	2	8	29695	29702	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_000956	TTAT	2	8	31145	31152	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_000956	ATTT	3	12	34380	34391	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_000956	ATTA	2	8	34753	34760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_000956	TTTA	2	8	37426	37433	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_000956	CTAA	2	8	37865	37872	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_000956	TCTT	2	8	38196	38203	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_000956	TTCG	2	8	38274	38281	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_000956	GTTT	2	8	38298	38305	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_000956	CTTT	2	8	39055	39062	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_000956	GATC	2	8	39137	39144	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_000956	TTTC	2	8	39332	39339	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_000956	CTTT	2	8	39344	39351	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_000956	TAGA	2	8	39358	39365	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_000956	TTTA	2	8	39471	39478	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_000956	ATTT	2	8	39916	39923	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_000956	AATG	2	8	40169	40176	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_000956	ATAA	2	8	40219	40226	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_000956	AGAA	2	8	44292	44299	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_000956	TTTA	2	8	44811	44818	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_000956	GCAA	2	8	44824	44831	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_000956	TATT	2	8	45055	45062	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000956	TTAC	2	8	45596	45603	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_000956	TAAT	2	8	46077	46084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_000956	CTTG	2	8	46130	46137	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_000956	TTTA	2	8	46151	46158	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_000956	TAAT	2	8	46484	46491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_000956	CTAT	2	8	46662	46669	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_000956	TTAT	2	8	46942	46949	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_000956	AATG	2	8	47294	47301	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_000956	ATAG	2	8	47393	47400	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_000956	CTTT	2	8	48436	48443	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_000956	GCTT	2	8	48453	48460	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_000956	TTAA	2	8	48638	48645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_000956	ATCT	2	8	48939	48946	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_000956	AATG	2	8	49083	49090	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_000956	ATTA	2	8	49485	49492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_000956	TTAT	2	8	49703	49710	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_000956	ATTT	2	8	49974	49981	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_000956	TTTA	2	8	50072	50079	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_000956	GATA	2	8	50280	50287	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_000956	TCCA	2	8	50638	50645	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_000956	TTAT	2	8	52003	52010	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.