MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp56

Total Repeats: 110

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000956	TTGG	2	8	865	872	0 %	50 %	50 %	0 %	11497374
2	NC_000956	AGAA	2	8	1374	1381	75 %	0 %	25 %	0 %	11497374
3	NC_000956	AAGC	2	8	2865	2872	50 %	0 %	25 %	25 %	11497375
4	NC_000956	TTTA	2	8	3172	3179	25 %	75 %	0 %	0 %	11497375
5	NC_000956	CTAT	2	8	3305	3312	25 %	50 %	0 %	25 %	11497375
6	NC_000956	ATTA	2	8	4423	4430	50 %	50 %	0 %	0 %	11497377
7	NC_000956	TAAT	2	8	4874	4881	50 %	50 %	0 %	0 %	11497377
8	NC_000956	TGGG	2	8	5434	5441	0 %	25 %	75 %	0 %	11497378
9	NC_000956	TCAA	2	8	5706	5713	50 %	25 %	0 %	25 %	11497378
10	NC_000956	TCCT	2	8	5842	5849	0 %	50 %	0 %	50 %	11497379
11	NC_000956	TGTT	2	8	5929	5936	0 %	75 %	25 %	0 %	11497379
12	NC_000956	TTTA	2	8	7359	7366	25 %	75 %	0 %	0 %	364556575
13	NC_000956	GTAA	2	8	7397	7404	50 %	25 %	25 %	0 %	364556575
14	NC_000956	TCAT	2	8	8311	8318	25 %	50 %	0 %	25 %	364556568
15	NC_000956	CAAA	2	8	8380	8387	75 %	0 %	0 %	25 %	364556568
16	NC_000956	TTAC	2	8	8619	8626	25 %	50 %	0 %	25 %	364556569
17	NC_000956	AATG	2	8	8866	8873	50 %	25 %	25 %	0 %	364556569
18	NC_000956	TTTA	2	8	10465	10472	25 %	75 %	0 %	0 %	11497410
19	NC_000956	AGAA	2	8	10686	10693	75 %	0 %	25 %	0 %	11497410
20	NC_000956	GCTG	2	8	10800	10807	0 %	25 %	50 %	25 %	11497410
21	NC_000956	TGCC	2	8	10901	10908	0 %	25 %	25 %	50 %	11497410
22	NC_000956	GATT	2	8	11120	11127	25 %	50 %	25 %	0 %	11497410
23	NC_000956	ATTT	2	8	11962	11969	25 %	75 %	0 %	0 %	11497412
24	NC_000956	TGAG	2	8	12066	12073	25 %	25 %	50 %	0 %	11497412
25	NC_000956	CTTG	2	8	12264	12271	0 %	50 %	25 %	25 %	11497413
26	NC_000956	AATT	2	8	12410	12417	50 %	50 %	0 %	0 %	11497413
27	NC_000956	AACG	2	8	12995	13002	50 %	0 %	25 %	25 %	11497414
28	NC_000956	CAAG	2	8	13100	13107	50 %	0 %	25 %	25 %	11497414
29	NC_000956	TAAT	2	8	13578	13585	50 %	50 %	0 %	0 %	11497414
30	NC_000956	CTAC	2	8	13640	13647	25 %	25 %	0 %	50 %	11497414
31	NC_000956	AGAA	2	8	13876	13883	75 %	0 %	25 %	0 %	11497415
32	NC_000956	CTTT	2	8	14187	14194	0 %	75 %	0 %	25 %	11497415
33	NC_000956	GAAT	2	8	15435	15442	50 %	25 %	25 %	0 %	11497417
34	NC_000956	TCAA	2	8	15658	15665	50 %	25 %	0 %	25 %	11497417
35	NC_000956	TCAG	2	8	15902	15909	25 %	25 %	25 %	25 %	11497417
36	NC_000956	AATT	2	8	15931	15938	50 %	50 %	0 %	0 %	11497417
37	NC_000956	GTTT	2	8	15951	15958	0 %	75 %	25 %	0 %	11497417
38	NC_000956	TAAT	2	8	16492	16499	50 %	50 %	0 %	0 %	11497385
39	NC_000956	AGAT	2	8	17171	17178	50 %	25 %	25 %	0 %	11497385
40	NC_000956	TATC	2	8	17383	17390	25 %	50 %	0 %	25 %	11497386
41	NC_000956	AAAC	2	8	17575	17582	75 %	0 %	0 %	25 %	11497386
42	NC_000956	ATTT	2	8	17591	17598	25 %	75 %	0 %	0 %	11497386
43	NC_000956	ATTA	2	8	18110	18117	50 %	50 %	0 %	0 %	11497387
44	NC_000956	TACA	2	8	18506	18513	50 %	25 %	0 %	25 %	11497387
45	NC_000956	AATA	2	8	19114	19121	75 %	25 %	0 %	0 %	11497389
46	NC_000956	TCAA	2	8	19149	19156	50 %	25 %	0 %	25 %	11497389
47	NC_000956	AGGA	2	8	19221	19228	50 %	0 %	50 %	0 %	11497389
48	NC_000956	CTAT	2	8	19233	19240	25 %	50 %	0 %	25 %	11497389
49	NC_000956	TAAC	2	8	19303	19310	50 %	25 %	0 %	25 %	11497390
50	NC_000956	ATAG	2	8	20388	20395	50 %	25 %	25 %	0 %	364556572
51	NC_000956	ATAG	2	8	20421	20428	50 %	25 %	25 %	0 %	364556572
52	NC_000956	AGAT	2	8	20440	20447	50 %	25 %	25 %	0 %	364556572
53	NC_000956	ATTG	2	8	21249	21256	25 %	50 %	25 %	0 %	11497393
54	NC_000956	TCTT	2	8	21559	21566	0 %	75 %	0 %	25 %	11497394
55	NC_000956	CTTG	2	8	21963	21970	0 %	50 %	25 %	25 %	11497394
56	NC_000956	AAGA	3	12	23323	23334	75 %	0 %	25 %	0 %	11497395
57	NC_000956	AATA	2	8	23450	23457	75 %	25 %	0 %	0 %	11497395
58	NC_000956	GAAA	2	8	23516	23523	75 %	0 %	25 %	0 %	11497395
59	NC_000956	AAAT	2	8	23602	23609	75 %	25 %	0 %	0 %	11497395
60	NC_000956	GAAA	2	8	23715	23722	75 %	0 %	25 %	0 %	11497395
61	NC_000956	TTTA	2	8	24434	24441	25 %	75 %	0 %	0 %	11497396
62	NC_000956	TTGC	2	8	24605	24612	0 %	50 %	25 %	25 %	11497397
63	NC_000956	TAAA	2	8	24810	24817	75 %	25 %	0 %	0 %	11497397
64	NC_000956	TAAA	2	8	25161	25168	75 %	25 %	0 %	0 %	11497397
65	NC_000956	TAAA	2	8	25267	25274	75 %	25 %	0 %	0 %	11497397
66	NC_000956	ATGG	2	8	26268	26275	25 %	25 %	50 %	0 %	11497399
67	NC_000956	TAAG	2	8	27060	27067	50 %	25 %	25 %	0 %	364556573
68	NC_000956	AAAT	2	8	27361	27368	75 %	25 %	0 %	0 %	364556573
69	NC_000956	AATC	2	8	27932	27939	50 %	25 %	0 %	25 %	364556573
70	NC_000956	AGAT	2	8	28156	28163	50 %	25 %	25 %	0 %	364556573
71	NC_000956	TATG	2	8	28495	28502	25 %	50 %	25 %	0 %	11497401
72	NC_000956	AAAT	3	12	28879	28890	75 %	25 %	0 %	0 %	11497402
73	NC_000956	TTTA	2	8	28910	28917	25 %	75 %	0 %	0 %	11497402
74	NC_000956	ACCA	2	8	29263	29270	50 %	0 %	0 %	50 %	11497402
75	NC_000956	AAGA	2	8	30436	30443	75 %	0 %	25 %	0 %	11497403
76	NC_000956	TAAA	2	8	30790	30797	75 %	25 %	0 %	0 %	11497403
77	NC_000956	CAGT	2	8	30965	30972	25 %	25 %	25 %	25 %	11497403
78	NC_000956	ATGA	2	8	31651	31658	50 %	25 %	25 %	0 %	364556577
79	NC_000956	TAAA	2	8	32262	32269	75 %	25 %	0 %	0 %	11497421
80	NC_000956	AATT	2	8	32308	32315	50 %	50 %	0 %	0 %	11497421
81	NC_000956	CAAA	2	8	32467	32474	75 %	0 %	0 %	25 %	11497404
82	NC_000956	AAAT	2	8	32505	32512	75 %	25 %	0 %	0 %	11497404
83	NC_000956	AATT	2	8	32556	32563	50 %	50 %	0 %	0 %	11497404
84	NC_000956	TAGC	2	8	32663	32670	25 %	25 %	25 %	25 %	11497404
85	NC_000956	TGAT	2	8	32870	32877	25 %	50 %	25 %	0 %	11497404
86	NC_000956	AGCA	2	8	33231	33238	50 %	0 %	25 %	25 %	11497404
87	NC_000956	AAAT	2	8	33257	33264	75 %	25 %	0 %	0 %	11497404
88	NC_000956	TACA	2	8	33461	33468	50 %	25 %	0 %	25 %	11497404
89	NC_000956	TTTA	2	8	33622	33629	25 %	75 %	0 %	0 %	11497404
90	NC_000956	ACAT	2	8	35435	35442	50 %	25 %	0 %	25 %	11497422
91	NC_000956	GTTC	2	8	35486	35493	0 %	50 %	25 %	25 %	11497422
92	NC_000956	TGCT	2	8	36342	36349	0 %	50 %	25 %	25 %	11497423
93	NC_000956	ATGT	2	8	36828	36835	25 %	50 %	25 %	0 %	11497424
94	NC_000956	GTAT	2	8	36853	36860	25 %	50 %	25 %	0 %	11497424
95	NC_000956	TCCT	2	8	39546	39553	0 %	50 %	0 %	50 %	11497430
96	NC_000956	AATC	2	8	41470	41477	50 %	25 %	0 %	25 %	364556574
97	NC_000956	TTGT	2	8	41919	41926	0 %	75 %	25 %	0 %	364556574
98	NC_000956	TTTC	2	8	42051	42058	0 %	75 %	0 %	25 %	364556574
99	NC_000956	GTTA	2	8	42275	42282	25 %	50 %	25 %	0 %	364556574
100	NC_000956	CCTT	2	8	42646	42653	0 %	50 %	0 %	50 %	364556574
101	NC_000956	AATT	2	8	42907	42914	50 %	50 %	0 %	0 %	364556574
102	NC_000956	GCTA	2	8	43166	43173	25 %	25 %	25 %	25 %	364556574
103	NC_000956	ATTT	2	8	43246	43253	25 %	75 %	0 %	0 %	364556574
104	NC_000956	TAGT	2	8	43291	43298	25 %	50 %	25 %	0 %	364556574
105	NC_000956	TATT	2	8	51263	51270	25 %	75 %	0 %	0 %	11497406
106	NC_000956	ATCT	2	8	51360	51367	25 %	50 %	0 %	25 %	11497406
107	NC_000956	ATGT	2	8	52243	52250	25 %	50 %	25 %	0 %	11497443
108	NC_000956	CTTT	2	8	52418	52425	0 %	75 %	0 %	25 %	11497443
109	NC_000956	TTTG	2	8	52592	52599	0 %	75 %	25 %	0 %	11497443
110	NC_000956	ATTT	2	8	52607	52614	25 %	75 %	0 %	0 %	11497443

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.