MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp56

Total Repeats: 264

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000956	TAT	2	6	14	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000956	TAA	2	6	79	84	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_000956	TTG	2	6	109	114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_000956	AAT	2	6	148	153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_000956	AGT	2	6	193	198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_000956	TAT	2	6	460	465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_000956	TTA	2	6	511	516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_000956	AAC	2	6	521	526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_000956	ATT	2	6	587	592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_000956	ATA	3	9	667	675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_000956	TAA	2	6	701	706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_000956	TAA	2	6	781	786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_000956	ACA	2	6	815	820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_000956	ATT	2	6	822	827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_000956	GTA	2	6	831	836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_000956	ATT	2	6	1448	1453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_000956	AAG	2	6	1630	1635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_000956	AAG	2	6	1853	1858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_000956	ATA	2	6	1873	1878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_000956	TAG	2	6	2063	2068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_000956	ATT	2	6	2069	2074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_000956	TAA	2	6	2190	2195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_000956	TAA	2	6	2214	2219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_000956	TGA	2	6	2259	2264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_000956	ATA	2	6	2390	2395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_000956	TTA	2	6	2448	2453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_000956	AAT	2	6	2546	2551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_000956	ATA	2	6	2617	2622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_000956	TAT	2	6	2635	2640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_000956	AAT	2	6	2645	2650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_000956	AAT	2	6	2699	2704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_000956	ATT	2	6	3560	3565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_000956	AGG	2	6	3566	3571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_000956	ATT	2	6	4114	4119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_000956	CTA	2	6	4145	4150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_000956	ATC	2	6	4990	4995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_000956	GCG	2	6	5024	5029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_000956	TAA	2	6	5050	5055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_000956	GAA	2	6	6444	6449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_000956	TTG	2	6	6565	6570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_000956	TTA	2	6	6602	6607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_000956	TGG	3	9	6615	6623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_000956	CCA	2	6	6625	6630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_000956	TGG	2	6	6798	6803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_000956	GGA	2	6	7421	7426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_000956	TGG	2	6	9282	9287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_000956	TAG	2	6	9363	9368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_000956	AAT	2	6	9391	9396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_000956	CTA	2	6	9484	9489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_000956	GTA	2	6	9548	9553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_000956	GCA	2	6	9559	9564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_000956	TTG	2	6	9572	9577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_000956	CTA	2	6	20739	20744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_000956	ATA	2	6	20770	20775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_000956	TAA	2	6	20799	20804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_000956	TAA	3	9	20821	20829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_000956	ATT	2	6	21487	21492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_000956	AGC	2	6	21501	21506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_000956	TCC	2	6	22485	22490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_000956	TAT	2	6	22586	22591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_000956	CTA	2	6	22592	22597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_000956	TAA	2	6	22768	22773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_000956	CAT	2	6	22826	22831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_000956	ATT	2	6	22832	22837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_000956	ATT	2	6	22839	22844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_000956	TAT	2	6	25313	25318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_000956	ATT	2	6	25811	25816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_000956	ATA	2	6	25874	25879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_000956	TAT	2	6	26483	26488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_000956	ATT	2	6	26618	26623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_000956	ATT	2	6	26639	26644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_000956	TAA	2	6	26646	26651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_000956	TTA	2	6	26675	26680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_000956	AAT	2	6	26682	26687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_000956	AGG	2	6	28285	28290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_000956	CCT	2	6	29514	29519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_000956	AGA	2	6	29666	29671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_000956	TAG	2	6	31028	31033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_000956	TGT	2	6	31139	31144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_000956	ACT	2	6	31719	31724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_000956	AGC	2	6	31751	31756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_000956	CAA	2	6	31776	31781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_000956	AAG	2	6	31801	31806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_000956	TAA	2	6	31828	31833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_000956	TAC	2	6	31841	31846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_000956	ATA	2	6	33823	33828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_000956	TAA	2	6	33853	33858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_000956	AGA	2	6	33971	33976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_000956	TAT	2	6	34079	34084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_000956	AAT	2	6	34257	34262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_000956	CAA	2	6	34492	34497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_000956	CTT	2	6	34498	34503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_000956	AAT	2	6	34524	34529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_000956	TCT	2	6	34551	34556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_000956	AAT	2	6	34662	34667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_000956	TTA	2	6	34711	34716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_000956	AGG	2	6	34740	34745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_000956	ATG	2	6	34833	34838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_000956	ATT	2	6	34857	34862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_000956	GAA	2	6	34970	34975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_000956	GAG	2	6	35057	35062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_000956	ATT	2	6	35083	35088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_000956	ATT	2	6	37142	37147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_000956	TCT	2	6	37265	37270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_000956	CTT	2	6	37302	37307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_000956	TTG	2	6	37342	37347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_000956	GTG	2	6	37348	37353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_000956	TCT	2	6	37385	37390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_000956	TTC	2	6	37414	37419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_000956	TAT	2	6	37441	37446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_000956	ATT	2	6	37451	37456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_000956	ATA	2	6	37479	37484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_000956	AAT	2	6	37503	37508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_000956	TTA	2	6	37583	37588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_000956	TAT	2	6	37596	37601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_000956	TAG	2	6	37670	37675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_000956	TAT	2	6	37735	37740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_000956	GTA	2	6	37906	37911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_000956	ATT	2	6	37915	37920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_000956	TCT	2	6	37961	37966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_000956	AAT	2	6	37969	37974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_000956	CCA	2	6	38227	38232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_000956	TCA	2	6	38237	38242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_000956	GGT	2	6	38353	38358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_000956	ATT	2	6	38415	38420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_000956	CAT	2	6	38481	38486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_000956	TCC	2	6	38579	38584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_000956	CAT	2	6	38792	38797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_000956	TTC	2	6	39039	39044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_000956	TCA	2	6	39272	39277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_000956	TTC	2	6	39298	39303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_000956	TAA	2	6	39443	39448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_000956	CCT	2	6	39939	39944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_000956	TCA	2	6	40077	40082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_000956	ATT	2	6	43863	43868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_000956	CTA	2	6	43876	43881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_000956	TAT	2	6	43898	43903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_000956	TAA	2	6	43916	43921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_000956	TAA	2	6	43957	43962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_000956	CTT	2	6	44112	44117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_000956	TAA	2	6	44187	44192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_000956	AAT	2	6	44309	44314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_000956	ATG	2	6	44352	44357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_000956	TAG	2	6	44374	44379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.