MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp56

Total Repeats: 143

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000956	TG	3	6	615	620	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000956	AT	3	6	852	857	50 %	50 %	0 %	0 %	11497374
3	NC_000956	AG	3	6	1364	1369	50 %	0 %	50 %	0 %	11497374
4	NC_000956	AT	3	6	1429	1434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_000956	TA	4	8	1438	1445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_000956	AG	3	6	1574	1579	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_000956	AG	3	6	1737	1742	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_000956	TG	3	6	2345	2350	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_000956	AT	3	6	2577	2582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_000956	AT	3	6	2639	2644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_000956	AT	3	6	2672	2677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_000956	TA	3	6	2753	2758	50 %	50 %	0 %	0 %	11497375
13	NC_000956	TG	5	10	2759	2768	0 %	50 %	50 %	0 %	11497375
14	NC_000956	AT	3	6	3513	3518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_000956	AG	3	6	4108	4113	50 %	0 %	50 %	0 %	11497376
16	NC_000956	TC	3	6	4131	4136	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_000956	AT	3	6	4360	4365	50 %	50 %	0 %	0 %	11497377
18	NC_000956	AT	3	6	5661	5666	50 %	50 %	0 %	0 %	11497378
19	NC_000956	AT	3	6	5740	5745	50 %	50 %	0 %	0 %	11497378
20	NC_000956	CT	3	6	6652	6657	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_000956	TC	3	6	7776	7781	0 %	50 %	0 %	50 %	364556568
22	NC_000956	TG	3	6	8850	8855	0 %	50 %	50 %	0 %	364556569
23	NC_000956	AG	3	6	8991	8996	50 %	0 %	50 %	0 %	364556570
24	NC_000956	AT	3	6	9384	9389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_000956	TA	3	6	9400	9405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_000956	AT	4	8	9876	9883	50 %	50 %	0 %	0 %	11497383
27	NC_000956	AC	3	6	10518	10523	50 %	0 %	0 %	50 %	11497410
28	NC_000956	AG	3	6	10914	10919	50 %	0 %	50 %	0 %	11497410
29	NC_000956	TA	3	6	10966	10971	50 %	50 %	0 %	0 %	11497410
30	NC_000956	AG	3	6	12638	12643	50 %	0 %	50 %	0 %	11497414
31	NC_000956	AT	3	6	13303	13308	50 %	50 %	0 %	0 %	11497414
32	NC_000956	AT	3	6	13994	13999	50 %	50 %	0 %	0 %	11497415
33	NC_000956	TA	3	6	14173	14178	50 %	50 %	0 %	0 %	11497415
34	NC_000956	AT	3	6	14697	14702	50 %	50 %	0 %	0 %	11497416
35	NC_000956	TA	3	6	15096	15101	50 %	50 %	0 %	0 %	11497416
36	NC_000956	CA	3	6	15230	15235	50 %	0 %	0 %	50 %	11497416
37	NC_000956	CA	3	6	15596	15601	50 %	0 %	0 %	50 %	11497417
38	NC_000956	TA	3	6	15719	15724	50 %	50 %	0 %	0 %	11497417
39	NC_000956	CA	3	6	16271	16276	50 %	0 %	0 %	50 %	11497384
40	NC_000956	AT	3	6	16668	16673	50 %	50 %	0 %	0 %	11497385
41	NC_000956	AT	4	8	16942	16949	50 %	50 %	0 %	0 %	11497385
42	NC_000956	AT	3	6	17354	17359	50 %	50 %	0 %	0 %	11497386
43	NC_000956	AT	3	6	18666	18671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000956	TA	3	6	18676	18681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_000956	AT	3	6	18978	18983	50 %	50 %	0 %	0 %	11497389
46	NC_000956	AT	3	6	19388	19393	50 %	50 %	0 %	0 %	11497390
47	NC_000956	AT	3	6	19556	19561	50 %	50 %	0 %	0 %	11497390
48	NC_000956	AT	3	6	19861	19866	50 %	50 %	0 %	0 %	364556571
49	NC_000956	TA	3	6	20014	20019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_000956	AT	3	6	20088	20093	50 %	50 %	0 %	0 %	364556572
51	NC_000956	AT	3	6	20266	20271	50 %	50 %	0 %	0 %	364556572
52	NC_000956	AT	3	6	20473	20478	50 %	50 %	0 %	0 %	364556572
53	NC_000956	AT	3	6	21543	21548	50 %	50 %	0 %	0 %	11497394
54	NC_000956	TA	3	6	22512	22517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_000956	GA	3	6	22859	22864	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_000956	TA	3	6	23882	23887	50 %	50 %	0 %	0 %	11497395
57	NC_000956	TA	3	6	24469	24474	50 %	50 %	0 %	0 %	11497396
58	NC_000956	TA	3	6	24720	24725	50 %	50 %	0 %	0 %	11497397
59	NC_000956	GA	3	6	25335	25340	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_000956	TA	4	8	25581	25588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_000956	TA	3	6	25635	25640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_000956	AG	3	6	25676	25681	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_000956	AT	3	6	26059	26064	50 %	50 %	0 %	0 %	11497399
64	NC_000956	AT	3	6	26609	26614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_000956	AT	5	10	26725	26734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_000956	TA	3	6	26883	26888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_000956	TA	3	6	27273	27278	50 %	50 %	0 %	0 %	364556573
68	NC_000956	AG	3	6	27314	27319	50 %	0 %	50 %	0 %	364556573
69	NC_000956	TA	3	6	27354	27359	50 %	50 %	0 %	0 %	364556573
70	NC_000956	TA	3	6	27581	27586	50 %	50 %	0 %	0 %	364556573
71	NC_000956	AG	3	6	27770	27775	50 %	0 %	50 %	0 %	364556573
72	NC_000956	AT	3	6	28463	28468	50 %	50 %	0 %	0 %	11497401
73	NC_000956	GA	3	6	28904	28909	50 %	0 %	50 %	0 %	11497402
74	NC_000956	TG	3	6	29062	29067	0 %	50 %	50 %	0 %	11497402
75	NC_000956	TG	3	6	29612	29617	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_000956	AT	3	6	29719	29724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_000956	GA	3	6	29794	29799	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_000956	TA	3	6	29866	29871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_000956	TA	4	8	30689	30696	50 %	50 %	0 %	0 %	11497403
80	NC_000956	CT	3	6	31156	31161	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_000956	TA	3	6	31208	31213	50 %	50 %	0 %	0 %	364556577
82	NC_000956	TG	3	6	31996	32001	0 %	50 %	50 %	0 %	11497421
83	NC_000956	AT	3	6	32338	32343	50 %	50 %	0 %	0 %	11497421
84	NC_000956	AT	3	6	32522	32527	50 %	50 %	0 %	0 %	11497404
85	NC_000956	AT	3	6	32862	32867	50 %	50 %	0 %	0 %	11497404
86	NC_000956	AG	4	8	33766	33773	50 %	0 %	50 %	0 %	11497404
87	NC_000956	GT	3	6	33873	33878	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_000956	TA	3	6	33925	33930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_000956	TA	3	6	33954	33959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_000956	AT	3	6	34311	34316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_000956	GA	3	6	35548	35553	50 %	0 %	50 %	0 %	11497422
92	NC_000956	TA	3	6	36778	36783	50 %	50 %	0 %	0 %	11497424
93	NC_000956	TA	3	6	37050	37055	50 %	50 %	0 %	0 %	11497424
94	NC_000956	TA	3	6	37172	37177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_000956	TA	3	6	38074	38079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_000956	AG	3	6	38944	38949	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_000956	AT	3	6	40239	40244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_000956	TA	3	6	41063	41068	50 %	50 %	0 %	0 %	364556574
99	NC_000956	CT	3	6	41988	41993	0 %	50 %	0 %	50 %	364556574
100	NC_000956	AT	4	8	42106	42113	50 %	50 %	0 %	0 %	364556574
101	NC_000956	GT	3	6	42356	42361	0 %	50 %	50 %	0 %	364556574
102	NC_000956	TA	3	6	43276	43281	50 %	50 %	0 %	0 %	364556574
103	NC_000956	TA	3	6	43652	43657	50 %	50 %	0 %	0 %	364556574
104	NC_000956	AT	3	6	43714	43719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_000956	TA	3	6	43739	43744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_000956	AT	3	6	43803	43808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_000956	AT	3	6	44618	44623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_000956	TA	3	6	44706	44711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_000956	TA	3	6	45011	45016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_000956	TA	3	6	45632	45637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_000956	AG	3	6	45992	45997	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_000956	AG	3	6	46008	46013	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_000956	AT	3	6	46171	46176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_000956	AT	3	6	46352	46357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_000956	AT	3	6	46616	46621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_000956	AT	4	8	46744	46751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_000956	AT	3	6	47026	47031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_000956	AT	3	6	47178	47183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_000956	AG	3	6	47265	47270	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_000956	TA	3	6	47421	47426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_000956	AT	3	6	47768	47773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_000956	AT	3	6	47802	47807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_000956	GT	3	6	47861	47866	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_000956	GT	3	6	48374	48379	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_000956	TA	4	8	48696	48703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_000956	TA	3	6	49030	49035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_000956	TA	4	8	49833	49840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_000956	AC	3	6	49865	49870	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_000956	TA	3	6	49925	49930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_000956	AT	5	10	49949	49958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_000956	TA	3	6	49964	49969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_000956	AT	3	6	50044	50049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_000956	TA	3	6	50301	50306	50 %	50 %	0 %	0 %	364556578
134	NC_000956	AT	3	6	50727	50732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_000956	TA	3	6	50962	50967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_000956	AT	3	6	51051	51056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_000956	TA	3	6	51164	51169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_000956	AT	3	6	51243	51248	50 %	50 %	0 %	0 %	11497406
139	NC_000956	GT	3	6	51447	51452	0 %	50 %	50 %	0 %	11497406
140	NC_000956	AT	3	6	51567	51572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_000956	AT	3	6	51747	51752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_000956	AT	3	6	51802	51807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_000956	TA	3	6	52078	52083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.