MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp56

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000956	AT	3	6	852	857	50 %	50 %	0 %	0 %	11497374
2	NC_000956	AG	3	6	1364	1369	50 %	0 %	50 %	0 %	11497374
3	NC_000956	TA	3	6	2753	2758	50 %	50 %	0 %	0 %	11497375
4	NC_000956	TG	5	10	2759	2768	0 %	50 %	50 %	0 %	11497375
5	NC_000956	AG	3	6	4108	4113	50 %	0 %	50 %	0 %	11497376
6	NC_000956	AT	3	6	4360	4365	50 %	50 %	0 %	0 %	11497377
7	NC_000956	AT	3	6	5661	5666	50 %	50 %	0 %	0 %	11497378
8	NC_000956	AT	3	6	5740	5745	50 %	50 %	0 %	0 %	11497378
9	NC_000956	TC	3	6	7776	7781	0 %	50 %	0 %	50 %	364556568
10	NC_000956	TG	3	6	8850	8855	0 %	50 %	50 %	0 %	364556569
11	NC_000956	AG	3	6	8991	8996	50 %	0 %	50 %	0 %	364556570
12	NC_000956	AT	4	8	9876	9883	50 %	50 %	0 %	0 %	11497383
13	NC_000956	AC	3	6	10518	10523	50 %	0 %	0 %	50 %	11497410
14	NC_000956	AG	3	6	10914	10919	50 %	0 %	50 %	0 %	11497410
15	NC_000956	TA	3	6	10966	10971	50 %	50 %	0 %	0 %	11497410
16	NC_000956	AG	3	6	12638	12643	50 %	0 %	50 %	0 %	11497414
17	NC_000956	AT	3	6	13303	13308	50 %	50 %	0 %	0 %	11497414
18	NC_000956	AT	3	6	13994	13999	50 %	50 %	0 %	0 %	11497415
19	NC_000956	TA	3	6	14173	14178	50 %	50 %	0 %	0 %	11497415
20	NC_000956	AT	3	6	14697	14702	50 %	50 %	0 %	0 %	11497416
21	NC_000956	TA	3	6	15096	15101	50 %	50 %	0 %	0 %	11497416
22	NC_000956	CA	3	6	15230	15235	50 %	0 %	0 %	50 %	11497416
23	NC_000956	CA	3	6	15596	15601	50 %	0 %	0 %	50 %	11497417
24	NC_000956	TA	3	6	15719	15724	50 %	50 %	0 %	0 %	11497417
25	NC_000956	CA	3	6	16271	16276	50 %	0 %	0 %	50 %	11497384
26	NC_000956	AT	3	6	16668	16673	50 %	50 %	0 %	0 %	11497385
27	NC_000956	AT	4	8	16942	16949	50 %	50 %	0 %	0 %	11497385
28	NC_000956	AT	3	6	17354	17359	50 %	50 %	0 %	0 %	11497386
29	NC_000956	AT	3	6	18978	18983	50 %	50 %	0 %	0 %	11497389
30	NC_000956	AT	3	6	19388	19393	50 %	50 %	0 %	0 %	11497390
31	NC_000956	AT	3	6	19556	19561	50 %	50 %	0 %	0 %	11497390
32	NC_000956	AT	3	6	19861	19866	50 %	50 %	0 %	0 %	364556571
33	NC_000956	AT	3	6	20088	20093	50 %	50 %	0 %	0 %	364556572
34	NC_000956	AT	3	6	20266	20271	50 %	50 %	0 %	0 %	364556572
35	NC_000956	AT	3	6	20473	20478	50 %	50 %	0 %	0 %	364556572
36	NC_000956	AT	3	6	21543	21548	50 %	50 %	0 %	0 %	11497394
37	NC_000956	TA	3	6	23882	23887	50 %	50 %	0 %	0 %	11497395
38	NC_000956	TA	3	6	24469	24474	50 %	50 %	0 %	0 %	11497396
39	NC_000956	TA	3	6	24720	24725	50 %	50 %	0 %	0 %	11497397
40	NC_000956	AT	3	6	26059	26064	50 %	50 %	0 %	0 %	11497399
41	NC_000956	TA	3	6	27273	27278	50 %	50 %	0 %	0 %	364556573
42	NC_000956	AG	3	6	27314	27319	50 %	0 %	50 %	0 %	364556573
43	NC_000956	TA	3	6	27354	27359	50 %	50 %	0 %	0 %	364556573
44	NC_000956	TA	3	6	27581	27586	50 %	50 %	0 %	0 %	364556573
45	NC_000956	AG	3	6	27770	27775	50 %	0 %	50 %	0 %	364556573
46	NC_000956	AT	3	6	28463	28468	50 %	50 %	0 %	0 %	11497401
47	NC_000956	GA	3	6	28904	28909	50 %	0 %	50 %	0 %	11497402
48	NC_000956	TG	3	6	29062	29067	0 %	50 %	50 %	0 %	11497402
49	NC_000956	TA	4	8	30689	30696	50 %	50 %	0 %	0 %	11497403
50	NC_000956	TA	3	6	31208	31213	50 %	50 %	0 %	0 %	364556577
51	NC_000956	TG	3	6	31996	32001	0 %	50 %	50 %	0 %	11497421
52	NC_000956	AT	3	6	32338	32343	50 %	50 %	0 %	0 %	11497421
53	NC_000956	AT	3	6	32522	32527	50 %	50 %	0 %	0 %	11497404
54	NC_000956	AT	3	6	32862	32867	50 %	50 %	0 %	0 %	11497404
55	NC_000956	AG	4	8	33766	33773	50 %	0 %	50 %	0 %	11497404
56	NC_000956	GA	3	6	35548	35553	50 %	0 %	50 %	0 %	11497422
57	NC_000956	TA	3	6	36778	36783	50 %	50 %	0 %	0 %	11497424
58	NC_000956	TA	3	6	37050	37055	50 %	50 %	0 %	0 %	11497424
59	NC_000956	TA	3	6	41063	41068	50 %	50 %	0 %	0 %	364556574
60	NC_000956	CT	3	6	41988	41993	0 %	50 %	0 %	50 %	364556574
61	NC_000956	AT	4	8	42106	42113	50 %	50 %	0 %	0 %	364556574
62	NC_000956	GT	3	6	42356	42361	0 %	50 %	50 %	0 %	364556574
63	NC_000956	TA	3	6	43276	43281	50 %	50 %	0 %	0 %	364556574
64	NC_000956	TA	3	6	43652	43657	50 %	50 %	0 %	0 %	364556574
65	NC_000956	TA	3	6	50301	50306	50 %	50 %	0 %	0 %	364556578
66	NC_000956	AT	3	6	51243	51248	50 %	50 %	0 %	0 %	11497406
67	NC_000956	GT	3	6	51447	51452	0 %	50 %	50 %	0 %	11497406

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.