MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp21

Total Repeats: 117

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000955	ATA	2	6	63	68	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000955	AAT	2	6	228	233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_000955	AAC	2	6	272	277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	365823330
4	NC_000955	ATT	2	6	356	361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365823330
5	NC_000955	CCT	2	6	415	420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	365823330
6	NC_000955	CAA	2	6	431	436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	365823330
7	NC_000955	TAT	2	6	517	522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365823330
8	NC_000955	ATT	2	6	567	572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365823330
9	NC_000955	ACT	3	9	607	615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365823330
10	NC_000955	AAT	2	6	636	641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_000955	TAA	2	6	802	807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497368
12	NC_000955	AGA	2	6	1069	1074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497368
13	NC_000955	TTG	2	6	1075	1080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497368
14	NC_000955	ATT	2	6	1133	1138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_000955	TAA	2	6	1177	1182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_000955	TTA	3	9	1306	1314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_000955	TAA	2	6	1385	1390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_000955	ATA	2	6	1424	1429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_000955	ACA	2	6	1534	1539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497361
20	NC_000955	AAC	2	6	1543	1548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497361
21	NC_000955	TAA	2	6	1563	1568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497361
22	NC_000955	CAA	2	6	1598	1603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497361
23	NC_000955	CAA	2	6	1754	1759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497361
24	NC_000955	ACT	2	6	1760	1765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497361
25	NC_000955	TTA	2	6	1800	1805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497361
26	NC_000955	CAA	2	6	1905	1910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497361
27	NC_000955	ATA	2	6	1967	1972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497361
28	NC_000955	AGA	2	6	1977	1982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497361
29	NC_000955	TAA	2	6	2015	2020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497361
30	NC_000955	ATT	2	6	2021	2026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497361
31	NC_000955	AAT	2	6	2106	2111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497361
32	NC_000955	TAT	2	6	2313	2318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497361
33	NC_000955	AAC	2	6	2447	2452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497361
34	NC_000955	TAT	2	6	2487	2492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497361
35	NC_000955	ATT	2	6	2559	2564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497361
36	NC_000955	ATA	2	6	2569	2574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497361
37	NC_000955	ATT	2	6	2585	2590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497361
38	NC_000955	GAA	2	6	2598	2603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497361
39	NC_000955	AAC	2	6	2748	2753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_000955	CCT	2	6	2951	2956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	11497362
41	NC_000955	TAA	2	6	3089	3094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497362
42	NC_000955	TAT	2	6	3125	3130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497362
43	NC_000955	CTC	3	9	3253	3261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	11497362
44	NC_000955	GGT	2	6	3331	3336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497362
45	NC_000955	ATT	2	6	3384	3389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497362
46	NC_000955	GAA	2	6	3564	3569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497362
47	NC_000955	TAT	2	6	3573	3578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497362
48	NC_000955	ATA	2	6	5018	5023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_000955	ATA	2	6	5705	5710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_000955	ATA	2	6	6203	6208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_000955	ATA	2	6	6640	6645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_000955	GTG	2	6	9895	9900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_000955	ATA	2	6	10697	10702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_000955	ATA	2	6	13260	13265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_000955	ATA	2	6	13323	13328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_000955	ATA	2	6	13447	13452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_000955	ATA	2	6	13510	13515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_000955	ATA	2	6	13699	13704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_000955	ATA	2	6	14575	14580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_000955	GGA	2	6	14635	14640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_000955	ATA	2	6	14697	14702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365823331
62	NC_000955	GTA	2	6	14964	14969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365823331
63	NC_000955	TAA	5	15	15046	15060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365823331
64	NC_000955	ATA	2	6	15072	15077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365823331
65	NC_000955	ATT	2	6	15302	15307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_000955	TAT	2	6	15564	15569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497364
67	NC_000955	AAC	2	6	15698	15703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497364
68	NC_000955	ACA	2	6	15813	15818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497364
69	NC_000955	TTA	2	6	15852	15857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497370
70	NC_000955	GTT	2	6	15992	15997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497370
71	NC_000955	TAG	2	6	16005	16010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497370
72	NC_000955	TAA	2	6	16082	16087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497370
73	NC_000955	TTG	2	6	16113	16118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_000955	TAA	2	6	16119	16124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_000955	TAT	2	6	16125	16130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_000955	ATT	2	6	16133	16138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_000955	TAA	2	6	16260	16265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497365
78	NC_000955	TAT	2	6	16593	16598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_000955	AAC	2	6	16619	16624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497371
80	NC_000955	TAT	2	6	16659	16664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497371
81	NC_000955	ACA	2	6	16700	16705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497371
82	NC_000955	ATA	2	6	16741	16746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497371
83	NC_000955	GTT	2	6	16792	16797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497371
84	NC_000955	ATT	2	6	16860	16865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_000955	AAT	2	6	16900	16905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497366
86	NC_000955	ATT	2	6	16955	16960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497366
87	NC_000955	ATG	2	6	17004	17009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497366
88	NC_000955	TAA	3	9	17206	17214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497366
89	NC_000955	GTA	2	6	17291	17296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497366
90	NC_000955	TCA	2	6	17297	17302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497366
91	NC_000955	CAA	2	6	17328	17333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497366
92	NC_000955	AGG	2	6	17371	17376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497366
93	NC_000955	ATA	2	6	17378	17383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497366
94	NC_000955	TAT	2	6	17428	17433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497366
95	NC_000955	TAA	2	6	17457	17462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497366
96	NC_000955	TAT	2	6	17710	17715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497366
97	NC_000955	ATT	2	6	17716	17721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497366
98	NC_000955	GAA	2	6	17774	17779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497366
99	NC_000955	TTG	2	6	17796	17801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497366
100	NC_000955	TAG	2	6	17805	17810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497366
101	NC_000955	GAA	2	6	17816	17821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497366
102	NC_000955	ATA	2	6	17838	17843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497366
103	NC_000955	AAT	2	6	17864	17869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497366
104	NC_000955	TAA	2	6	17885	17890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_000955	TAA	2	6	17904	17909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_000955	ATG	2	6	18043	18048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_000955	TGA	2	6	18221	18226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_000955	TGA	2	6	18272	18277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_000955	TAA	2	6	18399	18404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_000955	TTG	2	6	18430	18435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_000955	AAT	2	6	18437	18442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_000955	TAT	2	6	18449	18454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_000955	CTG	2	6	18551	18556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_000955	AGA	2	6	18561	18566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_000955	TTA	2	6	18579	18584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_000955	TAA	2	6	18723	18728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_000955	AAT	2	6	18739	18744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.