MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp21

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000955	AAC	2	6	272	277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	365823330
2	NC_000955	ATT	2	6	356	361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365823330
3	NC_000955	CCT	2	6	415	420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	365823330
4	NC_000955	CAA	2	6	431	436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	365823330
5	NC_000955	TAT	2	6	517	522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365823330
6	NC_000955	ATT	2	6	567	572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365823330
7	NC_000955	ACT	3	9	607	615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365823330
8	NC_000955	TAA	2	6	802	807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497368
9	NC_000955	AGA	2	6	1069	1074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497368
10	NC_000955	TTG	2	6	1075	1080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497368
11	NC_000955	ACA	2	6	1534	1539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497361
12	NC_000955	AAC	2	6	1543	1548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497361
13	NC_000955	TAA	2	6	1563	1568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497361
14	NC_000955	CAA	2	6	1598	1603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497361
15	NC_000955	CAA	2	6	1754	1759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497361
16	NC_000955	ACT	2	6	1760	1765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497361
17	NC_000955	TTA	2	6	1800	1805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497361
18	NC_000955	CAA	2	6	1905	1910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497361
19	NC_000955	ATA	2	6	1967	1972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497361
20	NC_000955	AGA	2	6	1977	1982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497361
21	NC_000955	TAA	2	6	2015	2020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497361
22	NC_000955	ATT	2	6	2021	2026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497361
23	NC_000955	AAT	2	6	2106	2111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497361
24	NC_000955	TAT	2	6	2313	2318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497361
25	NC_000955	AAC	2	6	2447	2452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497361
26	NC_000955	TAT	2	6	2487	2492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497361
27	NC_000955	ATT	2	6	2559	2564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497361
28	NC_000955	ATA	2	6	2569	2574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497361
29	NC_000955	ATT	2	6	2585	2590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497361
30	NC_000955	GAA	2	6	2598	2603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497361
31	NC_000955	CCT	2	6	2951	2956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	11497362
32	NC_000955	TAA	2	6	3089	3094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497362
33	NC_000955	TAT	2	6	3125	3130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497362
34	NC_000955	CTC	3	9	3253	3261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	11497362
35	NC_000955	GGT	2	6	3331	3336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497362
36	NC_000955	ATT	2	6	3384	3389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497362
37	NC_000955	GAA	2	6	3564	3569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497362
38	NC_000955	TAT	2	6	3573	3578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497362
39	NC_000955	ATA	2	6	14697	14702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365823331
40	NC_000955	GTA	2	6	14964	14969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365823331
41	NC_000955	TAA	5	15	15046	15060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365823331
42	NC_000955	ATA	2	6	15072	15077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365823331
43	NC_000955	TAT	2	6	15564	15569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497364
44	NC_000955	AAC	2	6	15698	15703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497364
45	NC_000955	ACA	2	6	15813	15818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497364
46	NC_000955	TTA	2	6	15852	15857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497370
47	NC_000955	GTT	2	6	15992	15997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497370
48	NC_000955	TAG	2	6	16005	16010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497370
49	NC_000955	TAA	2	6	16082	16087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497370
50	NC_000955	TAA	2	6	16260	16265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497365
51	NC_000955	AAC	2	6	16619	16624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497371
52	NC_000955	TAT	2	6	16659	16664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497371
53	NC_000955	ACA	2	6	16700	16705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497371
54	NC_000955	ATA	2	6	16741	16746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497371
55	NC_000955	GTT	2	6	16792	16797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497371
56	NC_000955	AAT	2	6	16900	16905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497366
57	NC_000955	ATT	2	6	16955	16960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497366
58	NC_000955	ATG	2	6	17004	17009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497366
59	NC_000955	TAA	3	9	17206	17214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497366
60	NC_000955	GTA	2	6	17291	17296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497366
61	NC_000955	TCA	2	6	17297	17302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497366
62	NC_000955	CAA	2	6	17328	17333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497366
63	NC_000955	AGG	2	6	17371	17376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497366
64	NC_000955	ATA	2	6	17378	17383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497366
65	NC_000955	TAT	2	6	17428	17433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497366
66	NC_000955	TAA	2	6	17457	17462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497366
67	NC_000955	TAT	2	6	17710	17715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497366
68	NC_000955	ATT	2	6	17716	17721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497366
69	NC_000955	GAA	2	6	17774	17779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497366
70	NC_000955	TTG	2	6	17796	17801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497366
71	NC_000955	TAG	2	6	17805	17810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497366
72	NC_000955	GAA	2	6	17816	17821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497366
73	NC_000955	ATA	2	6	17838	17843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497366
74	NC_000955	AAT	2	6	17864	17869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497366

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.