MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid cp32-9

Total Repeats: 17

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000954	TAGAAA	2	12	598	609	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	11497348
2	NC_000954	CTGATA	2	12	2992	3003	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	11497351
3	NC_000954	ATCAAG	2	12	3238	3249	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	11497351
4	NC_000954	GAATTT	2	12	5219	5230	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	11497326
5	NC_000954	TGAACT	2	12	5257	5268	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	11497326
6	NC_000954	TAGAAT	2	12	11999	12010	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_000954	ACAGAA	2	12	13858	13869	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_000954	AGTTAA	2	12	16360	16371	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	364556548
9	NC_000954	ATACTA	2	12	17366	17377	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	11497337
10	NC_000954	ATATGT	2	12	23007	23018	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_000954	AGTGTC	2	12	24499	24510	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	11497343
12	NC_000954	AAGTAA	2	12	25814	25825	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_000954	GAAAAT	2	12	26218	26229	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	11497345
14	NC_000954	AAAGAA	2	12	27203	27214	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	11497346
15	NC_000954	AGCTAA	2	12	27244	27255	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	11497346
16	NC_000954	AGAAAA	2	12	27319	27330	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	11497346
17	NC_000954	AAGAGA	2	12	27331	27342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497346

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.