MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid cp32-9

Total Repeats: 98

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000954	ATTT	3	12	573	584	25 %	75 %	0 %	0 %	11497348
2	NC_000954	ATTA	2	8	947	954	50 %	50 %	0 %	0 %	11497348
3	NC_000954	AGCA	2	8	1427	1434	50 %	0 %	25 %	25 %	11497349
4	NC_000954	TTGC	2	8	1615	1622	0 %	50 %	25 %	25 %	11497349
5	NC_000954	GTTC	2	8	1680	1687	0 %	50 %	25 %	25 %	11497349
6	NC_000954	TGCT	2	8	2536	2543	0 %	50 %	25 %	25 %	11497350
7	NC_000954	CAAG	2	8	2685	2692	50 %	0 %	25 %	25 %	11497351
8	NC_000954	ATGT	2	8	3022	3029	25 %	50 %	25 %	0 %	11497351
9	NC_000954	GTAT	2	8	3047	3054	25 %	50 %	25 %	0 %	11497351
10	NC_000954	ATAA	2	8	3129	3136	75 %	25 %	0 %	0 %	11497351
11	NC_000954	CAAT	2	8	3211	3218	50 %	25 %	0 %	25 %	11497351
12	NC_000954	TTTA	2	8	3901	3908	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_000954	GTAA	2	8	3939	3946	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_000954	ATCA	2	8	4462	4469	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_000954	TCAT	2	8	4857	4864	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_000954	TTAC	2	8	5165	5172	25 %	50 %	0 %	25 %	11497326
17	NC_000954	AATG	2	8	5412	5419	50 %	25 %	25 %	0 %	11497326
18	NC_000954	AAGT	2	8	6077	6084	50 %	25 %	25 %	0 %	11497328
19	NC_000954	AGAA	2	8	7232	7239	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_000954	GCTG	2	8	7346	7353	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_000954	ATTT	2	8	8511	8518	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_000954	TGAG	2	8	8615	8622	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_000954	CTTG	2	8	8813	8820	0 %	50 %	25 %	25 %	11497354
24	NC_000954	AATT	2	8	8959	8966	50 %	50 %	0 %	0 %	11497354
25	NC_000954	CAAG	2	8	9628	9635	50 %	0 %	25 %	25 %	11497355
26	NC_000954	TAAT	2	8	10106	10113	50 %	50 %	0 %	0 %	11497355
27	NC_000954	TGGA	2	8	10173	10180	25 %	25 %	50 %	0 %	11497355
28	NC_000954	AGAA	2	8	10475	10482	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_000954	CTTT	2	8	10786	10793	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_000954	GGCA	2	8	11451	11458	25 %	0 %	50 %	25 %	11497356
31	NC_000954	GAAT	2	8	12034	12041	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_000954	TCAA	2	8	12257	12264	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_000954	ATTA	2	8	12531	12538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_000954	TAAT	2	8	12582	12589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_000954	TAAT	2	8	13091	13098	50 %	50 %	0 %	0 %	11497331
36	NC_000954	AGAT	2	8	13770	13777	50 %	25 %	25 %	0 %	11497331
37	NC_000954	TATC	2	8	13982	13989	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_000954	AAAC	2	8	14174	14181	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_000954	ATTT	2	8	14190	14197	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_000954	ATTA	2	8	14710	14717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_000954	CCTA	2	8	15196	15203	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_000954	TCAA	2	8	15748	15755	50 %	25 %	0 %	25 %	11497333
43	NC_000954	AGGA	2	8	15820	15827	50 %	0 %	50 %	0 %	11497333
44	NC_000954	CTAT	2	8	15832	15839	25 %	50 %	0 %	25 %	11497333
45	NC_000954	TAAC	2	8	15902	15909	50 %	25 %	0 %	25 %	11497334
46	NC_000954	ATAG	2	8	16834	16841	50 %	25 %	25 %	0 %	364556549
47	NC_000954	AGAT	2	8	16919	16926	50 %	25 %	25 %	0 %	364556549
48	NC_000954	AGAT	2	8	16973	16980	50 %	25 %	25 %	0 %	364556549
49	NC_000954	ATAG	2	8	17008	17015	50 %	25 %	25 %	0 %	364556549
50	NC_000954	CAAA	2	8	17380	17387	75 %	0 %	0 %	25 %	11497337
51	NC_000954	TTGT	2	8	18274	18281	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_000954	AAGA	3	12	19621	19632	75 %	0 %	25 %	0 %	11497338
53	NC_000954	AATA	2	8	19748	19755	75 %	25 %	0 %	0 %	11497338
54	NC_000954	GAAA	2	8	19814	19821	75 %	0 %	25 %	0 %	11497338
55	NC_000954	AAAT	2	8	19900	19907	75 %	25 %	0 %	0 %	11497338
56	NC_000954	GAAA	2	8	20013	20020	75 %	0 %	25 %	0 %	11497338
57	NC_000954	AAAT	2	8	20588	20595	75 %	25 %	0 %	0 %	11497339
58	NC_000954	TTTA	2	8	20733	20740	25 %	75 %	0 %	0 %	11497339
59	NC_000954	TCAA	2	8	20853	20860	50 %	25 %	0 %	25 %	11497340
60	NC_000954	AAAG	2	8	20913	20920	75 %	0 %	25 %	0 %	11497340
61	NC_000954	AATT	2	8	21275	21282	50 %	50 %	0 %	0 %	11497340
62	NC_000954	AATA	2	8	21326	21333	75 %	25 %	0 %	0 %	11497340
63	NC_000954	AGAT	2	8	22374	22381	50 %	25 %	25 %	0 %	11497342
64	NC_000954	AGAT	2	8	22407	22414	50 %	25 %	25 %	0 %	11497342
65	NC_000954	ATAG	2	8	22442	22449	50 %	25 %	25 %	0 %	11497342
66	NC_000954	ATAG	2	8	22475	22482	50 %	25 %	25 %	0 %	11497342
67	NC_000954	AGAT	2	8	22494	22501	50 %	25 %	25 %	0 %	11497342
68	NC_000954	ATAG	2	8	22550	22557	50 %	25 %	25 %	0 %	11497342
69	NC_000954	AAAT	2	8	22602	22609	75 %	25 %	0 %	0 %	11497342
70	NC_000954	AAAT	2	8	22889	22896	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_000954	TATT	2	8	22953	22960	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_000954	TAAG	2	8	23333	23340	50 %	25 %	25 %	0 %	11497343
73	NC_000954	AAAT	2	8	23634	23641	75 %	25 %	0 %	0 %	11497343
74	NC_000954	AGAT	2	8	24429	24436	50 %	25 %	25 %	0 %	11497343
75	NC_000954	ATTA	2	8	24564	24571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_000954	TGCA	2	8	25022	25029	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_000954	TAAA	2	8	25167	25174	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_000954	ACCA	2	8	25536	25543	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_000954	ATTT	2	8	25556	25563	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_000954	AAGA	2	8	25968	25975	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_000954	TTGT	2	8	26235	26242	0 %	75 %	25 %	0 %	11497345
82	NC_000954	TAGA	2	8	27492	27499	50 %	25 %	25 %	0 %	11497346
83	NC_000954	AAAG	2	8	27695	27702	75 %	0 %	25 %	0 %	11497346
84	NC_000954	CAGT	2	8	27820	27827	25 %	25 %	25 %	25 %	11497346
85	NC_000954	TTTA	2	8	27999	28006	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_000954	CTAT	2	8	28011	28018	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_000954	AATA	2	8	28085	28092	75 %	25 %	0 %	0 %	364556550
88	NC_000954	AAAT	2	8	28253	28260	75 %	25 %	0 %	0 %	364556550
89	NC_000954	AATT	2	8	28432	28439	50 %	50 %	0 %	0 %	364556550
90	NC_000954	TAAA	2	8	29106	29113	75 %	25 %	0 %	0 %	364556551
91	NC_000954	CAAG	2	8	29131	29138	50 %	0 %	25 %	25 %	364556551
92	NC_000954	AATT	2	8	29152	29159	50 %	50 %	0 %	0 %	364556551
93	NC_000954	CAAA	2	8	29311	29318	75 %	0 %	0 %	25 %	11497347
94	NC_000954	AAAT	2	8	29349	29356	75 %	25 %	0 %	0 %	11497347
95	NC_000954	AATT	2	8	29400	29407	50 %	50 %	0 %	0 %	11497347
96	NC_000954	TGAT	2	8	29714	29721	25 %	50 %	25 %	0 %	11497347
97	NC_000954	AGCA	2	8	30075	30082	50 %	0 %	25 %	25 %	11497347
98	NC_000954	AAAT	2	8	30101	30108	75 %	25 %	0 %	0 %	11497347

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.