MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid cp32-9

Total Repeats: 293

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000954	AGA	2	6	164	169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497348
2	NC_000954	TAT	2	6	272	277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497348
3	NC_000954	AAC	2	6	343	348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497348
4	NC_000954	CAA	2	6	449	454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497348
5	NC_000954	CAA	2	6	685	690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497348
6	NC_000954	CTT	2	6	691	696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497348
7	NC_000954	AGC	2	6	714	719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497348
8	NC_000954	AAT	2	6	720	725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497348
9	NC_000954	TCT	2	6	747	752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497348
10	NC_000954	AAT	2	6	858	863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497348
11	NC_000954	TTA	2	6	907	912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497348
12	NC_000954	TGG	2	6	1028	1033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497348
13	NC_000954	ATT	2	6	1051	1056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497348
14	NC_000954	GAA	2	6	1164	1169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497348
15	NC_000954	GAG	2	6	1251	1256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497348
16	NC_000954	ATT	2	6	1277	1282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497348
17	NC_000954	AGA	2	6	1320	1325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497349
18	NC_000954	AGA	2	6	1329	1334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497349
19	NC_000954	AGA	2	6	1353	1358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497349
20	NC_000954	GCA	2	6	1359	1364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497349
21	NC_000954	ATT	2	6	1533	1538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497349
22	NC_000954	AGG	2	6	1607	1612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497349
23	NC_000954	TCT	2	6	1816	1821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497349
24	NC_000954	TTG	2	6	1844	1849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497349
25	NC_000954	AGA	2	6	1857	1862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497349
26	NC_000954	AGA	2	6	2039	2044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497350
27	NC_000954	TAG	2	6	2174	2179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497350
28	NC_000954	ACA	2	6	2259	2264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497350
29	NC_000954	TGG	3	9	2282	2290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497350
30	NC_000954	GAA	2	6	2700	2705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497351
31	NC_000954	TAG	2	6	2813	2818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497351
32	NC_000954	GTT	2	6	2827	2832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497351
33	NC_000954	AGA	2	6	2897	2902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497351
34	NC_000954	TAG	2	6	3035	3040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497351
35	NC_000954	TTA	2	6	3145	3150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497351
36	NC_000954	TGG	3	9	3158	3166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497351
37	NC_000954	CCA	2	6	3168	3173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	11497351
38	NC_000954	TGG	2	6	3341	3346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497351
39	NC_000954	GAA	3	9	4997	5005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497326
40	NC_000954	GTT	2	6	5210	5215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497326
41	NC_000954	ATT	2	6	5271	5276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497326
42	NC_000954	TAG	2	6	5281	5286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497326
43	NC_000954	GAA	2	6	5297	5302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497326
44	NC_000954	TGT	2	6	5505	5510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	364556547
45	NC_000954	TTC	2	6	5526	5531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	364556547
46	NC_000954	TTA	2	6	5579	5584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556547
47	NC_000954	TGG	2	6	5828	5833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497328
48	NC_000954	TAG	2	6	5909	5914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497328
49	NC_000954	AAT	2	6	5937	5942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497328
50	NC_000954	CTA	2	6	6030	6035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497328
51	NC_000954	GCA	2	6	6105	6110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497328
52	NC_000954	TTG	2	6	6118	6123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497328
53	NC_000954	AAT	2	6	6245	6250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497329
54	NC_000954	ATC	2	6	6279	6284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497329
55	NC_000954	GCT	2	6	6305	6310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497329
56	NC_000954	ATA	2	6	6320	6325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497329
57	NC_000954	TAA	2	6	6562	6567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497329
58	NC_000954	AGG	2	6	6702	6707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497329
59	NC_000954	TGG	2	6	7883	7888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497353
60	NC_000954	ACA	2	6	7932	7937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497353
61	NC_000954	TAG	2	6	7949	7954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497353
62	NC_000954	TAA	2	6	7975	7980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497353
63	NC_000954	TGA	2	6	8069	8074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497353
64	NC_000954	ACA	2	6	8083	8088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497353
65	NC_000954	ATT	2	6	8151	8156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497353
66	NC_000954	AAG	2	6	8189	8194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497353
67	NC_000954	CTG	2	6	8200	8205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497353
68	NC_000954	ACA	2	6	8263	8268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497353
69	NC_000954	TGA	2	6	8786	8791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497354
70	NC_000954	TAC	2	6	8874	8879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497354
71	NC_000954	TGC	2	6	9030	9035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497355
72	NC_000954	TAG	2	6	9159	9164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497355
73	NC_000954	AGA	2	6	9277	9282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497355
74	NC_000954	TTG	2	6	9386	9391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497355
75	NC_000954	GGA	2	6	9451	9456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497355
76	NC_000954	GAA	2	6	9487	9492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497355
77	NC_000954	ATT	2	6	9571	9576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497355
78	NC_000954	AGA	2	6	9612	9617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497355
79	NC_000954	GTG	2	6	9725	9730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497355
80	NC_000954	AGC	2	6	9736	9741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497355
81	NC_000954	CTA	2	6	9802	9807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497355
82	NC_000954	AGA	2	6	9837	9842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497355
83	NC_000954	GAT	2	6	9900	9905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497355
84	NC_000954	CTG	2	6	9956	9961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497355
85	NC_000954	ATT	2	6	9964	9969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497355
86	NC_000954	ACT	2	6	10015	10020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497355
87	NC_000954	TAA	2	6	10047	10052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497355
88	NC_000954	ATT	2	6	10093	10098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497355
89	NC_000954	ATT	2	6	10139	10144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497355
90	NC_000954	AAG	2	6	10217	10222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497355
91	NC_000954	TAC	2	6	11048	11053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497356
92	NC_000954	GAA	2	6	11125	11130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497356
93	NC_000954	ATC	2	6	11143	11148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497356
94	NC_000954	CGA	2	6	11265	11270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497356
95	NC_000954	CCT	2	6	11359	11364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	11497356
96	NC_000954	TTA	2	6	11416	11421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497356
97	NC_000954	TTC	2	6	11434	11439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497356
98	NC_000954	AAG	2	6	11459	11464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497356
99	NC_000954	AGG	2	6	11492	11497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497356
100	NC_000954	ATT	2	6	11560	11565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497356
101	NC_000954	AGA	2	6	11733	11738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497356
102	NC_000954	CAA	2	6	11761	11766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497356
103	NC_000954	AGA	2	6	11958	11963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497356
104	NC_000954	AAT	2	6	12611	12616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497330
105	NC_000954	TAA	2	6	12631	12636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497330
106	NC_000954	TTG	2	6	12648	12653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497330
107	NC_000954	GAA	2	6	12662	12667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497330
108	NC_000954	CTC	2	6	12723	12728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	11497330
109	NC_000954	TAA	2	6	12834	12839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497330
110	NC_000954	ACT	2	6	12848	12853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497330
111	NC_000954	TGA	2	6	13026	13031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497331
112	NC_000954	ATT	2	6	13054	13059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497331
113	NC_000954	TCT	2	6	13063	13068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497331
114	NC_000954	GAA	3	9	13081	13089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497331
115	NC_000954	GCT	2	6	13147	13152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497331
116	NC_000954	GAA	2	6	13156	13161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497331
117	NC_000954	TTC	2	6	13167	13172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497331
118	NC_000954	TGA	2	6	13218	13223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497331
119	NC_000954	AAC	2	6	13362	13367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497331
120	NC_000954	ATT	2	6	13555	13560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497331
121	NC_000954	ATG	2	6	13739	13744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497331
122	NC_000954	CTT	2	6	15336	15341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497332
123	NC_000954	TTC	2	6	15412	15417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497332
124	NC_000954	TTA	2	6	15426	15431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497332
125	NC_000954	TGA	2	6	15605	15610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497333
126	NC_000954	TGA	2	6	15776	15781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497333
127	NC_000954	AAT	2	6	15852	15857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497333
128	NC_000954	GAA	2	6	16039	16044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497334
129	NC_000954	ATA	2	6	16075	16080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497334
130	NC_000954	CTA	2	6	16205	16210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	364556548
131	NC_000954	CAC	2	6	16231	16236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	364556548
132	NC_000954	AGA	2	6	16252	16257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	364556548
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.