MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid cp32-8

Total Repeats: 29

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000953	AAAAC	2	10	81	90	80 %	0 %	0 %	20 %	11497312
2	NC_000953	ATTAA	2	10	1780	1789	60 %	40 %	0 %	0 %	11497313
3	NC_000953	TAAAT	2	10	2415	2424	60 %	40 %	0 %	0 %	11497314
4	NC_000953	GAAAA	2	10	6915	6924	80 %	0 %	20 %	0 %	11497317
5	NC_000953	CACTT	2	10	8676	8685	20 %	40 %	0 %	40 %	11497319
6	NC_000953	CAAAA	2	10	9480	9489	80 %	0 %	0 %	20 %	11497321
7	NC_000953	GAAAA	2	10	10346	10355	80 %	0 %	20 %	0 %	11497322
8	NC_000953	AATCT	2	10	12262	12271	40 %	40 %	0 %	20 %	11497324
9	NC_000953	CAAAC	2	10	12314	12323	60 %	0 %	0 %	40 %	11497324
10	NC_000953	TACTT	2	10	13279	13288	20 %	60 %	0 %	20 %	11497299
11	NC_000953	GAAAA	2	10	13357	13366	80 %	0 %	20 %	0 %	11497299
12	NC_000953	AAAGT	2	10	13379	13388	60 %	20 %	20 %	0 %	11497299
13	NC_000953	ATTAA	2	10	15224	15233	60 %	40 %	0 %	0 %	11497302
14	NC_000953	AGTAA	2	10	15861	15870	60 %	20 %	20 %	0 %	11497304
15	NC_000953	TCACT	2	10	16018	16027	20 %	40 %	0 %	40 %	11497304
16	NC_000953	TTGTT	2	10	16115	16124	0 %	80 %	20 %	0 %	364556527
17	NC_000953	TATGT	2	10	16225	16234	20 %	60 %	20 %	0 %	364556527
18	NC_000953	ATAAA	2	10	17479	17488	80 %	20 %	0 %	0 %	11497307
19	NC_000953	GAAAA	2	10	17533	17542	80 %	0 %	20 %	0 %	11497307
20	NC_000953	CACTA	2	10	19264	19273	40 %	20 %	0 %	40 %	11497282
21	NC_000953	GAGTT	2	10	24309	24318	20 %	40 %	40 %	0 %	364556522
22	NC_000953	ATAAA	2	10	24754	24763	80 %	20 %	0 %	0 %	11497288
23	NC_000953	ACTTG	2	10	25103	25112	20 %	40 %	20 %	20 %	11497288
24	NC_000953	ATTTT	2	10	25854	25863	20 %	80 %	0 %	0 %	11497289
25	NC_000953	AGCAA	2	10	26464	26473	60 %	0 %	20 %	20 %	364556523
26	NC_000953	AAGAA	2	10	26576	26585	80 %	0 %	20 %	0 %	364556523
27	NC_000953	ATAAA	2	10	27130	27139	80 %	20 %	0 %	0 %	11497291
28	NC_000953	GAAAA	2	10	28469	28478	80 %	0 %	20 %	0 %	364556530
29	NC_000953	ATTTT	2	10	28674	28683	20 %	80 %	0 %	0 %	364556530

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.