MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid cp32-8

Total Repeats: 94

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000953	ATTT	3	12	573	584	25 %	75 %	0 %	0 %	11497312
2	NC_000953	ATTA	2	8	944	951	50 %	50 %	0 %	0 %	11497312
3	NC_000953	GTTC	2	8	1677	1684	0 %	50 %	25 %	25 %	11497313
4	NC_000953	ATAC	2	8	1928	1935	50 %	25 %	0 %	25 %	11497313
5	NC_000953	AAAG	2	8	2379	2386	75 %	0 %	25 %	0 %	11497314
6	NC_000953	ATTT	2	8	2516	2523	25 %	75 %	0 %	0 %	11497314
7	NC_000953	TGCT	2	8	2528	2535	0 %	50 %	25 %	25 %	11497314
8	NC_000953	GCAA	2	8	2676	2683	50 %	0 %	25 %	25 %	11497315
9	NC_000953	ATGT	2	8	3014	3021	25 %	50 %	25 %	0 %	11497315
10	NC_000953	ATAA	2	8	3121	3128	75 %	25 %	0 %	0 %	11497315
11	NC_000953	CAAT	2	8	3203	3210	50 %	25 %	0 %	25 %	11497315
12	NC_000953	TAAA	2	8	3362	3369	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_000953	TTTA	2	8	3889	3896	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_000953	CTAC	2	8	4794	4801	25 %	25 %	0 %	50 %	364556524
15	NC_000953	TCAT	2	8	4841	4848	25 %	50 %	0 %	25 %	364556524
16	NC_000953	TACT	2	8	5150	5157	25 %	50 %	0 %	25 %	364556525
17	NC_000953	AATG	2	8	5396	5403	50 %	25 %	25 %	0 %	364556525
18	NC_000953	AAGT	2	8	6061	6068	50 %	25 %	25 %	0 %	11497296
19	NC_000953	AGAA	2	8	7216	7223	75 %	0 %	25 %	0 %	11497317
20	NC_000953	GCTG	2	8	7330	7337	0 %	25 %	50 %	25 %	11497317
21	NC_000953	ATTT	2	8	8493	8500	25 %	75 %	0 %	0 %	11497319
22	NC_000953	TGAG	2	8	8597	8604	25 %	25 %	50 %	0 %	11497319
23	NC_000953	CTTG	2	8	8795	8802	0 %	50 %	25 %	25 %	11497320
24	NC_000953	AATT	2	8	8941	8948	50 %	50 %	0 %	0 %	11497320
25	NC_000953	CAAG	2	8	9610	9617	50 %	0 %	25 %	25 %	11497321
26	NC_000953	TAAT	2	8	10088	10095	50 %	50 %	0 %	0 %	11497321
27	NC_000953	TGGA	2	8	10155	10162	25 %	25 %	50 %	0 %	11497321
28	NC_000953	AGAA	2	8	10386	10393	75 %	0 %	25 %	0 %	11497322
29	NC_000953	GGCA	2	8	11362	11369	25 %	0 %	50 %	25 %	11497323
30	NC_000953	GAAT	2	8	11945	11952	50 %	25 %	25 %	0 %	11497324
31	NC_000953	TCAA	2	8	12168	12175	50 %	25 %	0 %	25 %	11497324
32	NC_000953	AATT	2	8	12432	12439	50 %	50 %	0 %	0 %	11497324
33	NC_000953	GTTT	2	8	12452	12459	0 %	75 %	25 %	0 %	11497324
34	NC_000953	AGAT	2	8	13672	13679	50 %	25 %	25 %	0 %	11497299
35	NC_000953	TATC	2	8	13884	13891	25 %	50 %	0 %	25 %	11497300
36	NC_000953	AAAC	2	8	14076	14083	75 %	0 %	0 %	25 %	11497300
37	NC_000953	ATTT	2	8	14092	14099	25 %	75 %	0 %	0 %	11497300
38	NC_000953	ATTA	2	8	14611	14618	50 %	50 %	0 %	0 %	11497301
39	NC_000953	TACA	2	8	15007	15014	50 %	25 %	0 %	25 %	11497301
40	NC_000953	TCAA	2	8	15651	15658	50 %	25 %	0 %	25 %	11497303
41	NC_000953	AGGA	2	8	15723	15730	50 %	0 %	50 %	0 %	11497303
42	NC_000953	CTAT	2	8	15735	15742	25 %	50 %	0 %	25 %	11497303
43	NC_000953	TAAC	2	8	15805	15812	50 %	25 %	0 %	25 %	11497304
44	NC_000953	AGAT	2	8	16822	16829	50 %	25 %	25 %	0 %	364556528
45	NC_000953	ATAG	2	8	16944	16951	50 %	25 %	25 %	0 %	364556528
46	NC_000953	GCAA	2	8	17616	17623	50 %	0 %	25 %	25 %	11497307
47	NC_000953	CTTG	2	8	18188	18195	0 %	50 %	25 %	25 %	364556529
48	NC_000953	TTGT	2	8	18713	18720	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_000953	AAGA	3	12	19545	19556	75 %	0 %	25 %	0 %	11497282
50	NC_000953	AATA	2	8	19672	19679	75 %	25 %	0 %	0 %	11497282
51	NC_000953	GAAA	2	8	19738	19745	75 %	0 %	25 %	0 %	11497282
52	NC_000953	AAAT	2	8	19824	19831	75 %	25 %	0 %	0 %	11497282
53	NC_000953	TTGA	2	8	20279	20286	25 %	50 %	25 %	0 %	11497283
54	NC_000953	TTTA	2	8	20656	20663	25 %	75 %	0 %	0 %	11497283
55	NC_000953	TCAA	2	8	20776	20783	50 %	25 %	0 %	25 %	11497284
56	NC_000953	TAAA	2	8	21553	21560	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_000953	AGAT	2	8	21647	21654	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_000953	GAAA	2	8	21710	21717	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_000953	AAAG	2	8	21906	21913	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_000953	ATAA	2	8	22305	22312	75 %	25 %	0 %	0 %	11497286
61	NC_000953	ATAG	2	8	22338	22345	50 %	25 %	25 %	0 %	11497286
62	NC_000953	ATAG	2	8	22392	22399	50 %	25 %	25 %	0 %	11497286
63	NC_000953	ATAG	2	8	22446	22453	50 %	25 %	25 %	0 %	11497286
64	NC_000953	ATAG	2	8	22500	22507	50 %	25 %	25 %	0 %	11497286
65	NC_000953	ATAG	2	8	22554	22561	50 %	25 %	25 %	0 %	11497286
66	NC_000953	ATTA	2	8	22978	22985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_000953	TTTG	2	8	23096	23103	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_000953	TATT	2	8	23336	23343	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_000953	ACAA	2	8	23347	23354	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_000953	TAAG	2	8	23505	23512	50 %	25 %	25 %	0 %	364556522
71	NC_000953	AAAT	2	8	23806	23813	75 %	25 %	0 %	0 %	364556522
72	NC_000953	AATC	2	8	24377	24384	50 %	25 %	0 %	25 %	364556522
73	NC_000953	AGAT	2	8	24601	24608	50 %	25 %	25 %	0 %	364556522
74	NC_000953	ATTA	2	8	24736	24743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_000953	TAAA	2	8	25339	25346	75 %	25 %	0 %	0 %	11497289
76	NC_000953	ACCA	2	8	25708	25715	50 %	0 %	0 %	50 %	11497289
77	NC_000953	AAGA	2	8	26140	26147	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_000953	AAAC	2	8	27365	27372	75 %	0 %	0 %	25 %	11497291
79	NC_000953	AAGA	2	8	27448	27455	75 %	0 %	25 %	0 %	11497291
80	NC_000953	AAGA	2	8	27475	27482	75 %	0 %	25 %	0 %	11497291
81	NC_000953	TAGA	2	8	27703	27710	50 %	25 %	25 %	0 %	11497291
82	NC_000953	TTTA	2	8	28224	28231	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_000953	AAGG	2	8	28524	28531	50 %	0 %	50 %	0 %	364556530
84	NC_000953	TTTG	2	8	28590	28597	0 %	75 %	25 %	0 %	364556530
85	NC_000953	ATGA	2	8	28731	28738	50 %	25 %	25 %	0 %	364556530
86	NC_000953	TAAA	2	8	29340	29347	75 %	25 %	0 %	0 %	11497311
87	NC_000953	CAAG	2	8	29365	29372	50 %	0 %	25 %	25 %	11497311
88	NC_000953	AATT	2	8	29386	29393	50 %	50 %	0 %	0 %	11497311
89	NC_000953	CAAA	2	8	29545	29552	75 %	0 %	0 %	25 %	11497292
90	NC_000953	AAAT	2	8	29583	29590	75 %	25 %	0 %	0 %	11497292
91	NC_000953	AATT	2	8	29634	29641	50 %	50 %	0 %	0 %	11497292
92	NC_000953	TGAT	2	8	29948	29955	25 %	50 %	25 %	0 %	11497292
93	NC_000953	AGCA	2	8	30309	30316	50 %	0 %	25 %	25 %	11497292
94	NC_000953	AAAT	2	8	30335	30342	75 %	25 %	0 %	0 %	11497292

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.