MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid cp32-8

Total Repeats: 405

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000953	AGA	2	6	164	169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497312
2	NC_000953	TGC	2	6	200	205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497312
3	NC_000953	TAT	2	6	272	277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497312
4	NC_000953	AAC	2	6	343	348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497312
5	NC_000953	CAA	2	6	449	454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497312
6	NC_000953	CAA	2	6	685	690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497312
7	NC_000953	CTT	2	6	691	696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497312
8	NC_000953	AAT	2	6	717	722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497312
9	NC_000953	TCT	2	6	744	749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497312
10	NC_000953	AAT	2	6	855	860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497312
11	NC_000953	TTA	2	6	904	909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497312
12	NC_000953	AGG	2	6	931	936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497312
13	NC_000953	ATG	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497312
14	NC_000953	ATT	2	6	1048	1053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497312
15	NC_000953	GAA	2	6	1161	1166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497312
16	NC_000953	TAA	2	6	1241	1246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497312
17	NC_000953	GAG	2	6	1248	1253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497312
18	NC_000953	ATT	2	6	1274	1279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497312
19	NC_000953	AGA	2	6	1317	1322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497313
20	NC_000953	AGA	2	6	1326	1331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497313
21	NC_000953	AGA	2	6	1350	1355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497313
22	NC_000953	GCA	2	6	1356	1361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497313
23	NC_000953	TTC	3	9	1809	1817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497313
24	NC_000953	AGA	2	6	1854	1859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497313
25	NC_000953	CAA	2	6	2086	2091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497314
26	NC_000953	TGG	2	6	2154	2159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497314
27	NC_000953	AAC	2	6	2250	2255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497314
28	NC_000953	TGG	3	9	2274	2282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497314
29	NC_000953	TAA	2	6	2566	2571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497314
30	NC_000953	GCT	2	6	2656	2661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497315
31	NC_000953	TGA	2	6	2739	2744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497315
32	NC_000953	TTA	2	6	3137	3142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497315
33	NC_000953	CCA	2	6	3160	3165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	11497315
34	NC_000953	TGG	2	6	3330	3335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497315
35	NC_000953	ATT	2	6	3968	3973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556524
36	NC_000953	TGA	2	6	3974	3979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	364556524
37	NC_000953	ATT	2	6	3982	3987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556524
38	NC_000953	TAT	2	6	4031	4036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556524
39	NC_000953	ACA	2	6	4134	4139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	364556524
40	NC_000953	ATT	2	6	4201	4206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556524
41	NC_000953	TAA	3	9	4286	4294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556524
42	NC_000953	AGT	2	6	4329	4334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	364556524
43	NC_000953	ATT	2	6	4338	4343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556524
44	NC_000953	TTA	2	6	4348	4353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556524
45	NC_000953	GCT	2	6	4433	4438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	364556524
46	NC_000953	AGA	2	6	4460	4465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	364556524
47	NC_000953	GTG	2	6	4474	4479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	364556524
48	NC_000953	CGA	2	6	4544	4549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	364556524
49	NC_000953	GAT	2	6	4562	4567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	364556524
50	NC_000953	GCA	3	9	4614	4622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	364556524
51	NC_000953	GCA	2	6	4629	4634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	364556524
52	NC_000953	AGT	2	6	4635	4640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	364556524
53	NC_000953	TAA	2	6	4685	4690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556524
54	NC_000953	AGA	2	6	4694	4699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	364556524
55	NC_000953	TTA	2	6	4765	4770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556524
56	NC_000953	CTA	2	6	4879	4884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	364556524
57	NC_000953	GAA	3	9	4981	4989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	364556525
58	NC_000953	GTT	2	6	5194	5199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	364556525
59	NC_000953	ATT	2	6	5255	5260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556525
60	NC_000953	TAG	2	6	5265	5270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	364556525
61	NC_000953	GAA	2	6	5281	5286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	364556525
62	NC_000953	GGC	2	6	5287	5292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	364556525
63	NC_000953	TGT	2	6	5489	5494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	364556526
64	NC_000953	TTC	2	6	5510	5515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	364556526
65	NC_000953	TTA	2	6	5563	5568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556526
66	NC_000953	TGG	2	6	5812	5817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497296
67	NC_000953	TAG	2	6	5893	5898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497296
68	NC_000953	AAT	2	6	5921	5926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497296
69	NC_000953	CTA	2	6	6014	6019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497296
70	NC_000953	GTA	2	6	6078	6083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497296
71	NC_000953	GCA	2	6	6089	6094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497296
72	NC_000953	TTG	2	6	6102	6107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497296
73	NC_000953	AAT	2	6	6229	6234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497297
74	NC_000953	ATC	2	6	6263	6268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497297
75	NC_000953	GCT	2	6	6289	6294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497297
76	NC_000953	ATA	2	6	6304	6309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497297
77	NC_000953	TAA	2	6	6546	6551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497297
78	NC_000953	AGG	2	6	6686	6691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497297
79	NC_000953	TAG	2	6	6751	6756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497317
80	NC_000953	ATT	2	6	6762	6767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497317
81	NC_000953	TAA	2	6	6808	6813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497317
82	NC_000953	TGC	2	6	6817	6822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497317
83	NC_000953	TAA	2	6	6850	6855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497317
84	NC_000953	GAA	2	6	6968	6973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497317
85	NC_000953	TGT	2	6	7057	7062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497317
86	NC_000953	TTA	2	6	7065	7070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497317
87	NC_000953	GAT	2	6	7091	7096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497317
88	NC_000953	TAA	2	6	7123	7128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497317
89	NC_000953	CAA	2	6	7240	7245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497317
90	NC_000953	TTG	2	6	7347	7352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497317
91	NC_000953	CTT	2	6	7403	7408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497317
92	NC_000953	AAG	2	6	7443	7448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497317
93	NC_000953	ATT	2	6	7514	7519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497317
94	NC_000953	TTA	2	6	7524	7529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497317
95	NC_000953	ATA	2	6	7655	7660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497317
96	NC_000953	TAC	2	6	7768	7773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497317
97	NC_000953	TGG	2	6	7866	7871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497318
98	NC_000953	ACA	2	6	7915	7920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497318
99	NC_000953	TAG	2	6	7932	7937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497318
100	NC_000953	TAA	2	6	7958	7963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497318
101	NC_000953	TGA	2	6	8052	8057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497318
102	NC_000953	ACA	2	6	8066	8071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497318
103	NC_000953	ATT	2	6	8134	8139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497318
104	NC_000953	AAG	2	6	8172	8177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497318
105	NC_000953	CTG	2	6	8183	8188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497318
106	NC_000953	AAC	2	6	8245	8250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497318
107	NC_000953	TTA	2	6	8267	8272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497319
108	NC_000953	TTA	2	6	8502	8507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497319
109	NC_000953	TTG	2	6	8519	8524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497319
110	NC_000953	AAT	2	6	8526	8531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497319
111	NC_000953	AAT	2	6	8611	8616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497319
112	NC_000953	TTG	2	6	8627	8632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497319
113	NC_000953	TCA	2	6	8686	8691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497319
114	NC_000953	TGA	2	6	8768	8773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497320
115	NC_000953	TGC	2	6	9012	9017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497321
116	NC_000953	TAG	2	6	9141	9146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497321
117	NC_000953	AGA	2	6	9259	9264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497321
118	NC_000953	TTG	2	6	9368	9373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497321
119	NC_000953	GGA	2	6	9433	9438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497321
120	NC_000953	GAA	2	6	9469	9474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497321
121	NC_000953	ATT	2	6	9553	9558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497321
122	NC_000953	AGA	2	6	9594	9599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497321
123	NC_000953	GTG	2	6	9707	9712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497321
124	NC_000953	AGC	2	6	9718	9723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497321
125	NC_000953	AAG	2	6	9790	9795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497321
126	NC_000953	AGA	2	6	9819	9824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497321
127	NC_000953	GAT	2	6	9882	9887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497321
128	NC_000953	AAT	2	6	9934	9939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497321
129	NC_000953	ACT	2	6	9997	10002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497321
130	NC_000953	TAA	2	6	10029	10034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497321
131	NC_000953	ATT	2	6	10075	10080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497321
132	NC_000953	ATT	2	6	10121	10126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497321
133	NC_000953	AAG	2	6	10199	10204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497321
134	NC_000953	TAA	3	9	10315	10323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497322
135	NC_000953	AAT	2	6	10411	10416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497322
136	NC_000953	TAA	2	6	10425	10430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497322
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387	NC_000953	GGA	2	6	29977	29982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497292
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391	NC_000953	CAT	2	6	30272	30277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497292
392	NC_000953	TGA	2	6	30348	30353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497292
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.