MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid cp32-8

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000953	GT	3	6	66	71	0 %	50 %	50 %	0 %	11497312
2	NC_000953	AT	3	6	504	509	50 %	50 %	0 %	0 %	11497312
3	NC_000953	CT	3	6	675	680	0 %	50 %	0 %	50 %	11497312
4	NC_000953	GA	3	6	1739	1744	50 %	0 %	50 %	0 %	11497313
5	NC_000953	GT	3	6	2299	2304	0 %	50 %	50 %	0 %	11497314
6	NC_000953	CA	3	6	2498	2503	50 %	0 %	0 %	50 %	11497314
7	NC_000953	TA	3	6	2964	2969	50 %	50 %	0 %	0 %	11497315
8	NC_000953	AT	3	6	3178	3183	50 %	50 %	0 %	0 %	11497315
9	NC_000953	AT	3	6	4271	4276	50 %	50 %	0 %	0 %	364556524
10	NC_000953	TG	3	6	5380	5385	0 %	50 %	50 %	0 %	364556525
11	NC_000953	AG	3	6	5521	5526	50 %	0 %	50 %	0 %	364556526
12	NC_000953	AT	3	6	5914	5919	50 %	50 %	0 %	0 %	11497296
13	NC_000953	TA	3	6	5930	5935	50 %	50 %	0 %	0 %	11497296
14	NC_000953	AT	4	8	6406	6413	50 %	50 %	0 %	0 %	11497297
15	NC_000953	AC	3	6	7048	7053	50 %	0 %	0 %	50 %	11497317
16	NC_000953	TA	3	6	7496	7501	50 %	50 %	0 %	0 %	11497317
17	NC_000953	AG	3	6	9169	9174	50 %	0 %	50 %	0 %	11497321
18	NC_000953	AT	3	6	9813	9818	50 %	50 %	0 %	0 %	11497321
19	NC_000953	AC	3	6	10069	10074	50 %	0 %	0 %	50 %	11497321
20	NC_000953	AT	3	6	10504	10509	50 %	50 %	0 %	0 %	11497322
21	NC_000953	AT	3	6	10650	10655	50 %	50 %	0 %	0 %	11497322
22	NC_000953	TA	3	6	10683	10688	50 %	50 %	0 %	0 %	11497322
23	NC_000953	TA	4	8	10804	10811	50 %	50 %	0 %	0 %	11497322
24	NC_000953	AT	3	6	11207	11212	50 %	50 %	0 %	0 %	11497323
25	NC_000953	TA	3	6	11606	11611	50 %	50 %	0 %	0 %	11497323
26	NC_000953	CA	3	6	11740	11745	50 %	0 %	0 %	50 %	11497323
27	NC_000953	CA	3	6	12106	12111	50 %	0 %	0 %	50 %	11497324
28	NC_000953	TA	3	6	12229	12234	50 %	50 %	0 %	0 %	11497324
29	NC_000953	AT	3	6	12775	12780	50 %	50 %	0 %	0 %	11497298
30	NC_000953	AT	3	6	13169	13174	50 %	50 %	0 %	0 %	11497299
31	NC_000953	AT	3	6	13855	13860	50 %	50 %	0 %	0 %	11497300
32	NC_000953	AT	3	6	15480	15485	50 %	50 %	0 %	0 %	11497303
33	NC_000953	AT	3	6	15890	15895	50 %	50 %	0 %	0 %	11497304
34	NC_000953	AT	3	6	16058	16063	50 %	50 %	0 %	0 %	11497304
35	NC_000953	AT	3	6	16363	16368	50 %	50 %	0 %	0 %	364556527
36	NC_000953	AT	3	6	16590	16595	50 %	50 %	0 %	0 %	364556528
37	NC_000953	AT	3	6	16801	16806	50 %	50 %	0 %	0 %	364556528
38	NC_000953	TA	3	6	20691	20696	50 %	50 %	0 %	0 %	11497283
39	NC_000953	AT	3	6	21472	21477	50 %	50 %	0 %	0 %	11497284
40	NC_000953	AT	3	6	22282	22287	50 %	50 %	0 %	0 %	11497286
41	NC_000953	AT	3	6	22369	22374	50 %	50 %	0 %	0 %	11497286
42	NC_000953	AT	3	6	22423	22428	50 %	50 %	0 %	0 %	11497286
43	NC_000953	AT	3	6	22477	22482	50 %	50 %	0 %	0 %	11497286
44	NC_000953	AT	3	6	22531	22536	50 %	50 %	0 %	0 %	11497286
45	NC_000953	TA	3	6	23718	23723	50 %	50 %	0 %	0 %	364556522
46	NC_000953	AG	3	6	23759	23764	50 %	0 %	50 %	0 %	364556522
47	NC_000953	TA	3	6	23799	23804	50 %	50 %	0 %	0 %	364556522
48	NC_000953	AG	3	6	24215	24220	50 %	0 %	50 %	0 %	364556522
49	NC_000953	AG	3	6	25229	25234	50 %	0 %	50 %	0 %	11497289
50	NC_000953	GA	3	6	25349	25354	50 %	0 %	50 %	0 %	11497289
51	NC_000953	AT	3	6	26801	26806	50 %	50 %	0 %	0 %	364556523
52	NC_000953	TA	3	6	27755	27760	50 %	50 %	0 %	0 %	11497291
53	NC_000953	AT	3	6	27875	27880	50 %	50 %	0 %	0 %	11497291
54	NC_000953	TA	3	6	28288	28293	50 %	50 %	0 %	0 %	364556530
55	NC_000953	TG	3	6	29074	29079	0 %	50 %	50 %	0 %	11497311
56	NC_000953	AT	3	6	29416	29421	50 %	50 %	0 %	0 %	11497311
57	NC_000953	AT	3	6	29600	29605	50 %	50 %	0 %	0 %	11497292
58	NC_000953	AT	3	6	29940	29945	50 %	50 %	0 %	0 %	11497292
59	NC_000953	TA	3	6	30257	30262	50 %	50 %	0 %	0 %	11497292
60	NC_000953	AG	3	6	30844	30849	50 %	0 %	50 %	0 %	11497292

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.