MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid cp32-7

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000952	AGATA	2	10	94	103	60 %	20 %	20 %	0 %	11497267
2	NC_000952	ATTAA	2	10	1779	1788	60 %	40 %	0 %	0 %	11497268
3	NC_000952	TAAAT	2	10	2414	2423	60 %	40 %	0 %	0 %	11497269
4	NC_000952	ATTTA	2	10	5694	5703	40 %	60 %	0 %	0 %	11497250
5	NC_000952	GAAAA	2	10	6917	6926	80 %	0 %	20 %	0 %	11497272
6	NC_000952	AAGAA	2	10	9245	9254	80 %	0 %	20 %	0 %	11497276
7	NC_000952	GAAAA	2	10	10356	10365	80 %	0 %	20 %	0 %	11497277
8	NC_000952	TTAAA	2	10	11869	11878	60 %	40 %	0 %	0 %	11497278
9	NC_000952	TAAAG	2	10	11909	11918	60 %	20 %	20 %	0 %	11497279
10	NC_000952	TACTT	2	10	13287	13296	20 %	60 %	0 %	20 %	11497254
11	NC_000952	AAAGT	2	10	13387	13396	60 %	20 %	20 %	0 %	11497254
12	NC_000952	ATTAA	2	10	15231	15240	60 %	40 %	0 %	0 %	11497257
13	NC_000952	AGTAA	2	10	15868	15877	60 %	20 %	20 %	0 %	11497259
14	NC_000952	TCACT	2	10	16025	16034	20 %	40 %	0 %	40 %	11497259
15	NC_000952	TTGTT	2	10	16122	16131	0 %	80 %	20 %	0 %	11497260
16	NC_000952	TATGT	2	10	16232	16241	20 %	60 %	20 %	0 %	11497260
17	NC_000952	ATTTA	2	10	21437	21446	40 %	60 %	0 %	0 %	11497239
18	NC_000952	TCTAT	2	10	22626	22635	20 %	60 %	0 %	20 %	11497241
19	NC_000952	ATTTT	2	10	22754	22763	20 %	80 %	0 %	0 %	11497263
20	NC_000952	GAGTT	2	10	24078	24087	20 %	40 %	40 %	0 %	11497242
21	NC_000952	ATAAA	2	10	24523	24532	80 %	20 %	0 %	0 %	11497243
22	NC_000952	ACTTG	2	10	24872	24881	20 %	40 %	20 %	20 %	11497243
23	NC_000952	ATTTT	2	10	25623	25632	20 %	80 %	0 %	0 %	11497244
24	NC_000952	ATTAT	2	10	28357	28366	40 %	60 %	0 %	0 %	11497265
25	NC_000952	TTACA	2	10	30632	30641	40 %	40 %	0 %	20 %	11497247

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.