MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid cp32-7

Total Repeats: 98

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000952	ATTT	3	12	572	583	25 %	75 %	0 %	0 %	11497267
2	NC_000952	ATTA	2	8	943	950	50 %	50 %	0 %	0 %	11497267
3	NC_000952	GTTC	2	8	1676	1683	0 %	50 %	25 %	25 %	11497268
4	NC_000952	ATAC	2	8	1927	1934	50 %	25 %	0 %	25 %	11497268
5	NC_000952	AAGA	2	8	2379	2386	75 %	0 %	25 %	0 %	11497269
6	NC_000952	ATTT	2	8	2515	2522	25 %	75 %	0 %	0 %	11497269
7	NC_000952	TGCT	2	8	2527	2534	0 %	50 %	25 %	25 %	11497269
8	NC_000952	GCAA	2	8	2675	2682	50 %	0 %	25 %	25 %	11497270
9	NC_000952	ATGT	2	8	3013	3020	25 %	50 %	25 %	0 %	11497270
10	NC_000952	GTAT	2	8	3038	3045	25 %	50 %	25 %	0 %	11497270
11	NC_000952	ATAA	2	8	3120	3127	75 %	25 %	0 %	0 %	11497270
12	NC_000952	CAAT	2	8	3202	3209	50 %	25 %	0 %	25 %	11497270
13	NC_000952	TAAA	2	8	3361	3368	75 %	25 %	0 %	0 %	11497271
14	NC_000952	TTTA	2	8	3888	3895	25 %	75 %	0 %	0 %	11497271
15	NC_000952	AGTA	2	8	4781	4788	50 %	25 %	25 %	0 %	11497248
16	NC_000952	CTAC	2	8	4793	4800	25 %	25 %	0 %	50 %	11497248
17	NC_000952	TCAT	2	8	4840	4847	25 %	50 %	0 %	25 %	11497248
18	NC_000952	AATG	2	8	5395	5402	50 %	25 %	25 %	0 %	11497249
19	NC_000952	AAGT	2	8	6060	6067	50 %	25 %	25 %	0 %	11497251
20	NC_000952	TTTA	2	8	6997	7004	25 %	75 %	0 %	0 %	11497272
21	NC_000952	AGAA	2	8	7218	7225	75 %	0 %	25 %	0 %	11497272
22	NC_000952	GCTG	2	8	7332	7339	0 %	25 %	50 %	25 %	11497272
23	NC_000952	ATTT	2	8	8495	8502	25 %	75 %	0 %	0 %	11497274
24	NC_000952	TGAG	2	8	8599	8606	25 %	25 %	50 %	0 %	11497274
25	NC_000952	CTTG	2	8	8797	8804	0 %	50 %	25 %	25 %	11497275
26	NC_000952	AATT	2	8	8943	8950	50 %	50 %	0 %	0 %	11497275
27	NC_000952	GTAA	2	8	9423	9430	50 %	25 %	25 %	0 %	11497276
28	NC_000952	TATG	2	8	9455	9462	25 %	50 %	25 %	0 %	11497276
29	NC_000952	AAAT	2	8	9485	9492	75 %	25 %	0 %	0 %	11497276
30	NC_000952	AGGG	2	8	9880	9887	25 %	0 %	75 %	0 %	11497276
31	NC_000952	AGAA	2	8	10396	10403	75 %	0 %	25 %	0 %	11497277
32	NC_000952	GCAC	2	8	10560	10567	25 %	0 %	25 %	50 %	11497277
33	NC_000952	CTTT	2	8	10707	10714	0 %	75 %	0 %	25 %	11497277
34	NC_000952	TAAT	2	8	10956	10963	50 %	50 %	0 %	0 %	11497277
35	NC_000952	ATTC	2	8	11669	11676	25 %	50 %	0 %	25 %	11497278
36	NC_000952	TCAA	2	8	12176	12183	50 %	25 %	0 %	25 %	11497279
37	NC_000952	GTTT	2	8	12460	12467	0 %	75 %	25 %	0 %	11497279
38	NC_000952	TAAT	2	8	13001	13008	50 %	50 %	0 %	0 %	11497254
39	NC_000952	AGAT	2	8	13680	13687	50 %	25 %	25 %	0 %	11497254
40	NC_000952	TATC	2	8	13891	13898	25 %	50 %	0 %	25 %	11497255
41	NC_000952	AAAC	2	8	14083	14090	75 %	0 %	0 %	25 %	11497255
42	NC_000952	ATTT	2	8	14099	14106	25 %	75 %	0 %	0 %	11497255
43	NC_000952	ATTA	2	8	14618	14625	50 %	50 %	0 %	0 %	11497256
44	NC_000952	TACA	2	8	15014	15021	50 %	25 %	0 %	25 %	11497256
45	NC_000952	TAAC	2	8	15812	15819	50 %	25 %	0 %	25 %	11497259
46	NC_000952	CAAT	2	8	16506	16513	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_000952	ATAG	2	8	16744	16751	50 %	25 %	25 %	0 %	11497261
48	NC_000952	ATAG	2	8	16810	16817	50 %	25 %	25 %	0 %	11497261
49	NC_000952	AGAT	2	8	16829	16836	50 %	25 %	25 %	0 %	11497261
50	NC_000952	TTGT	2	8	17268	17275	0 %	75 %	25 %	0 %	11497262
51	NC_000952	AAGA	3	12	19571	19582	75 %	0 %	25 %	0 %	11497237
52	NC_000952	AATA	2	8	19698	19705	75 %	25 %	0 %	0 %	11497237
53	NC_000952	GAAA	2	8	19764	19771	75 %	0 %	25 %	0 %	11497237
54	NC_000952	AAAT	2	8	19850	19857	75 %	25 %	0 %	0 %	11497237
55	NC_000952	GAAA	2	8	19963	19970	75 %	0 %	25 %	0 %	11497237
56	NC_000952	TTTA	2	8	20682	20689	25 %	75 %	0 %	0 %	11497238
57	NC_000952	TAAA	2	8	21409	21416	75 %	25 %	0 %	0 %	11497239
58	NC_000952	ATAG	2	8	22379	22386	50 %	25 %	25 %	0 %	11497241
59	NC_000952	ATAA	2	8	22400	22407	75 %	25 %	0 %	0 %	11497241
60	NC_000952	ATAG	2	8	22454	22461	50 %	25 %	25 %	0 %	11497241
61	NC_000952	ATAG	2	8	22487	22494	50 %	25 %	25 %	0 %	11497241
62	NC_000952	GCAA	2	8	22568	22575	50 %	0 %	25 %	25 %	11497241
63	NC_000952	CTTT	2	8	22766	22773	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_000952	TTTA	2	8	22890	22897	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_000952	TATT	2	8	23107	23114	25 %	75 %	0 %	0 %	11497242
66	NC_000952	TAAG	2	8	23274	23281	50 %	25 %	25 %	0 %	11497242
67	NC_000952	AAAT	2	8	23575	23582	75 %	25 %	0 %	0 %	11497242
68	NC_000952	AATC	2	8	24146	24153	50 %	25 %	0 %	25 %	11497242
69	NC_000952	AGAT	2	8	24370	24377	50 %	25 %	25 %	0 %	11497242
70	NC_000952	ATTA	2	8	24505	24512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_000952	AAAT	3	12	25093	25104	75 %	25 %	0 %	0 %	11497244
72	NC_000952	TAAA	2	8	25108	25115	75 %	25 %	0 %	0 %	11497244
73	NC_000952	AGGT	2	8	25230	25237	25 %	25 %	50 %	0 %	11497244
74	NC_000952	ACCA	2	8	25477	25484	50 %	0 %	0 %	50 %	11497244
75	NC_000952	GTTT	2	8	25497	25504	0 %	75 %	25 %	0 %	11497244
76	NC_000952	TAAA	2	8	25550	25557	75 %	25 %	0 %	0 %	11497244
77	NC_000952	AAGA	2	8	25909	25916	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_000952	TATT	2	8	26106	26113	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_000952	CAAA	2	8	26765	26772	75 %	0 %	0 %	25 %	11497245
80	NC_000952	AAGA	2	8	27500	27507	75 %	0 %	25 %	0 %	11497246
81	NC_000952	AAAG	2	8	27534	27541	75 %	0 %	25 %	0 %	11497246
82	NC_000952	AAAT	2	8	27581	27588	75 %	25 %	0 %	0 %	11497246
83	NC_000952	TTCA	2	8	28109	28116	25 %	50 %	0 %	25 %	11497264
84	NC_000952	TTTA	2	8	28149	28156	25 %	75 %	0 %	0 %	11497265
85	NC_000952	AATA	2	8	28763	28770	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_000952	ACTG	2	8	29202	29209	25 %	25 %	25 %	25 %	11497266
87	NC_000952	TAAA	2	8	29255	29262	75 %	25 %	0 %	0 %	11497266
88	NC_000952	CAAG	2	8	29280	29287	50 %	0 %	25 %	25 %	11497266
89	NC_000952	AATT	2	8	29301	29308	50 %	50 %	0 %	0 %	11497266
90	NC_000952	CAAA	2	8	29460	29467	75 %	0 %	0 %	25 %	11497247
91	NC_000952	AAAT	2	8	29498	29505	75 %	25 %	0 %	0 %	11497247
92	NC_000952	AATT	2	8	29549	29556	50 %	50 %	0 %	0 %	11497247
93	NC_000952	TAGC	2	8	29656	29663	25 %	25 %	25 %	25 %	11497247
94	NC_000952	TGAT	2	8	29863	29870	25 %	50 %	25 %	0 %	11497247
95	NC_000952	AGCA	2	8	30224	30231	50 %	0 %	25 %	25 %	11497247
96	NC_000952	AAAT	2	8	30250	30257	75 %	25 %	0 %	0 %	11497247
97	NC_000952	TACA	2	8	30454	30461	50 %	25 %	0 %	25 %	11497247
98	NC_000952	TTTA	2	8	30463	30470	25 %	75 %	0 %	0 %	11497247

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.