MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid cp32-7

Total Repeats: 420

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000952	AGA	2	6	163	168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497267
2	NC_000952	TAT	2	6	271	276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497267
3	NC_000952	AAC	2	6	342	347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497267
4	NC_000952	CAA	2	6	448	453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497267
5	NC_000952	CAA	2	6	684	689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497267
6	NC_000952	CTT	2	6	690	695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497267
7	NC_000952	AAT	2	6	716	721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497267
8	NC_000952	TCT	2	6	743	748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497267
9	NC_000952	AAT	2	6	854	859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497267
10	NC_000952	TTA	2	6	903	908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497267
11	NC_000952	AGG	2	6	930	935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497267
12	NC_000952	ATG	2	6	1023	1028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497267
13	NC_000952	ATT	2	6	1047	1052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497267
14	NC_000952	GAA	2	6	1160	1165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497267
15	NC_000952	GAG	2	6	1247	1252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497267
16	NC_000952	ATT	2	6	1273	1278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497267
17	NC_000952	AGA	2	6	1316	1321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497268
18	NC_000952	AGA	2	6	1325	1330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497268
19	NC_000952	AGA	2	6	1349	1354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497268
20	NC_000952	GCA	2	6	1355	1360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497268
21	NC_000952	TTC	3	9	1808	1816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497268
22	NC_000952	AGA	2	6	1853	1858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497268
23	NC_000952	CAA	2	6	2085	2090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497269
24	NC_000952	TGG	2	6	2153	2158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497269
25	NC_000952	AAC	2	6	2249	2254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497269
26	NC_000952	TGG	3	9	2273	2281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497269
27	NC_000952	TAA	2	6	2565	2570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497269
28	NC_000952	GCT	2	6	2655	2660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497270
29	NC_000952	TGA	2	6	2738	2743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497270
30	NC_000952	AGT	2	6	2814	2819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497270
31	NC_000952	TTA	2	6	3136	3141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497270
32	NC_000952	CCA	2	6	3159	3164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	11497270
33	NC_000952	TGG	2	6	3329	3334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497270
34	NC_000952	AAG	2	6	3409	3414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497271
35	NC_000952	ATC	2	6	3549	3554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497271
36	NC_000952	TGG	2	6	3646	3651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497271
37	NC_000952	CTA	2	6	3705	3710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497271
38	NC_000952	AAT	2	6	3725	3730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497271
39	NC_000952	TAA	2	6	3790	3795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497271
40	NC_000952	TAA	2	6	3938	3943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497271
41	NC_000952	ATT	2	6	3967	3972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497248
42	NC_000952	TGA	2	6	3973	3978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497248
43	NC_000952	ATT	2	6	3981	3986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497248
44	NC_000952	TAT	2	6	4030	4035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497248
45	NC_000952	ACA	2	6	4133	4138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497248
46	NC_000952	ATT	2	6	4200	4205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497248
47	NC_000952	TAA	3	9	4285	4293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497248
48	NC_000952	AGT	2	6	4328	4333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497248
49	NC_000952	ATT	2	6	4337	4342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497248
50	NC_000952	TTA	2	6	4347	4352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497248
51	NC_000952	GCT	2	6	4432	4437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497248
52	NC_000952	AGA	2	6	4459	4464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497248
53	NC_000952	GTG	2	6	4473	4478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497248
54	NC_000952	CGA	2	6	4543	4548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497248
55	NC_000952	GAT	2	6	4561	4566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497248
56	NC_000952	GCA	3	9	4613	4621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497248
57	NC_000952	GCA	2	6	4628	4633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497248
58	NC_000952	AGT	2	6	4634	4639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497248
59	NC_000952	TAA	2	6	4684	4689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497248
60	NC_000952	AGA	2	6	4693	4698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497248
61	NC_000952	TTA	2	6	4764	4769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497248
62	NC_000952	CTA	2	6	4878	4883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497248
63	NC_000952	GAA	3	9	4980	4988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497249
64	NC_000952	GTT	2	6	5193	5198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497249
65	NC_000952	ATT	2	6	5254	5259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497249
66	NC_000952	TAG	2	6	5264	5269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497249
67	NC_000952	GAA	2	6	5280	5285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497249
68	NC_000952	GGC	2	6	5286	5291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	11497249
69	NC_000952	TGT	2	6	5488	5493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497250
70	NC_000952	TTC	2	6	5509	5514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497250
71	NC_000952	TTA	2	6	5562	5567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497250
72	NC_000952	TGG	2	6	5811	5816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497251
73	NC_000952	AAT	2	6	5920	5925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497251
74	NC_000952	TAT	2	6	6014	6019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497251
75	NC_000952	GTA	2	6	6077	6082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497251
76	NC_000952	GCA	2	6	6088	6093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497251
77	NC_000952	TTG	2	6	6101	6106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497251
78	NC_000952	AAT	2	6	6228	6233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497252
79	NC_000952	ATC	2	6	6262	6267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497252
80	NC_000952	GCT	2	6	6288	6293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497252
81	NC_000952	ATA	2	6	6303	6308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497252
82	NC_000952	TTA	2	6	6601	6606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497252
83	NC_000952	AGG	2	6	6688	6693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497252
84	NC_000952	TAG	2	6	6753	6758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497272
85	NC_000952	ATT	2	6	6764	6769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497272
86	NC_000952	TAA	2	6	6810	6815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497272
87	NC_000952	TGC	2	6	6819	6824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497272
88	NC_000952	TAA	2	6	6852	6857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497272
89	NC_000952	GAA	2	6	6970	6975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497272
90	NC_000952	TGT	2	6	7059	7064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497272
91	NC_000952	TTA	2	6	7067	7072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497272
92	NC_000952	GAT	2	6	7093	7098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497272
93	NC_000952	GAT	2	6	7117	7122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497272
94	NC_000952	AAT	2	6	7243	7248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497272
95	NC_000952	TTG	2	6	7349	7354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497272
96	NC_000952	CTT	2	6	7405	7410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497272
97	NC_000952	AAG	2	6	7445	7450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497272
98	NC_000952	ATT	2	6	7516	7521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497272
99	NC_000952	TTA	2	6	7526	7531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497272
100	NC_000952	TTA	2	6	7655	7660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497272
101	NC_000952	TAC	2	6	7770	7775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497272
102	NC_000952	TGG	2	6	7868	7873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497273
103	NC_000952	CAA	2	6	7918	7923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497273
104	NC_000952	TAG	2	6	7934	7939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497273
105	NC_000952	TAA	2	6	7960	7965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497273
106	NC_000952	TGA	2	6	8054	8059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497273
107	NC_000952	ACA	2	6	8068	8073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497273
108	NC_000952	ATT	2	6	8136	8141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497273
109	NC_000952	AAG	2	6	8174	8179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497273
110	NC_000952	CTG	2	6	8185	8190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497273
111	NC_000952	AAC	2	6	8247	8252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497273
112	NC_000952	TTA	2	6	8269	8274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497274
113	NC_000952	TTA	2	6	8504	8509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497274
114	NC_000952	TTG	2	6	8521	8526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497274
115	NC_000952	AAT	2	6	8528	8533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497274
116	NC_000952	AAT	2	6	8613	8618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497274
117	NC_000952	TCA	2	6	8688	8693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497274
118	NC_000952	TGC	2	6	9014	9019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497276
119	NC_000952	TTG	2	6	9370	9375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497276
120	NC_000952	TGG	2	6	9434	9439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497276
121	NC_000952	AGA	2	6	9497	9502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497276
122	NC_000952	TAA	2	6	9518	9523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497276
123	NC_000952	AAC	2	6	9601	9606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497276
124	NC_000952	ATG	2	6	9664	9669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497276
125	NC_000952	CAA	2	6	9694	9699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497276
126	NC_000952	AGC	2	6	9704	9709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497276
127	NC_000952	TTG	2	6	9730	9735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497276
128	NC_000952	GTT	2	6	9759	9764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497276
129	NC_000952	TAA	2	6	9922	9927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497276
130	NC_000952	TGA	2	6	9962	9967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497276
131	NC_000952	TAA	2	6	10025	10030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497276
132	NC_000952	TGT	2	6	10199	10204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497276
133	NC_000952	TAA	2	6	10238	10243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497276
134	NC_000952	AAC	2	6	10260	10265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497276
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390	NC_000952	TAT	2	6	28632	28637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497265
391	NC_000952	TCT	2	6	28664	28669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497265
392	NC_000952	TGA	2	6	28908	28913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497266
393	NC_000952	TGT	2	6	28917	28922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497266
394	NC_000952	GTT	2	6	29029	29034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497266
395	NC_000952	AGT	2	6	29266	29271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497266
396	NC_000952	TGA	2	6	29325	29330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497266
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407	NC_000952	ATA	2	6	30085	30090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497247
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412	NC_000952	TGG	2	6	30497	30502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497247
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420	NC_000952	TGT	2	6	30742	30747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497247

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.