MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid cp32-6

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000951	TAGAAA	2	12	598	609	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	11497225
2	NC_000951	AAATGG	2	12	2390	2401	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	11497227
3	NC_000951	CTGATA	2	12	2986	2997	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	11497228
4	NC_000951	ATCAAG	2	12	3232	3243	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	11497228
5	NC_000951	GAATTT	2	12	5210	5221	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	11497216
6	NC_000951	TGAACT	2	12	5248	5259	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	11497216
7	NC_000951	AGAGAT	2	12	8743	8754	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	11497233
8	NC_000951	AAAGAG	2	12	9539	9550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497234
9	NC_000951	TAGAAT	2	12	11920	11931	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	11497221
10	NC_000951	ACAGAA	2	12	13779	13790	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	11497196
11	NC_000951	AATGGT	2	12	15390	15401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497198
12	NC_000951	TAATGA	2	12	17306	17317	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	11497203
13	NC_000951	TTTTCG	2	12	18184	18195	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	11497204
14	NC_000951	ATAGAT	2	12	20838	20849	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	11497207
15	NC_000951	ATAATT	2	12	21467	21478	50 %	50 %	0 %	0 %	11497207
16	NC_000951	AATTTA	2	12	22312	22323	50 %	50 %	0 %	0 %	11497209
17	NC_000951	ATTGTT	2	12	27183	27194	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	11497223
18	NC_000951	AAAGCA	2	12	28449	28460	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	11497224

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.