MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid cp32-6

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000951	AAAAC	2	10	81	90	80 %	0 %	0 %	20 %	11497225
2	NC_000951	ATTAA	2	10	1780	1789	60 %	40 %	0 %	0 %	11497226
3	NC_000951	TGGCA	2	10	2330	2339	20 %	20 %	40 %	20 %	11497227
4	NC_000951	AATTA	2	10	2568	2577	60 %	40 %	0 %	0 %	11497227
5	NC_000951	AAGAG	2	10	3407	3416	60 %	0 %	40 %	0 %	364556497
6	NC_000951	TTCAA	2	10	4386	4395	40 %	40 %	0 %	20 %	364556495
7	NC_000951	ATTTA	2	10	5702	5711	40 %	60 %	0 %	0 %	364556496
8	NC_000951	GAAAA	2	10	6925	6934	80 %	0 %	20 %	0 %	11497230
9	NC_000951	CACTT	2	10	8686	8695	20 %	40 %	0 %	40 %	11497232
10	NC_000951	GAAAA	2	10	10356	10365	80 %	0 %	20 %	0 %	11497235
11	NC_000951	CATAA	2	10	11550	11559	60 %	20 %	0 %	20 %	11497220
12	NC_000951	AATCT	2	10	12272	12281	40 %	40 %	0 %	20 %	11497221
13	NC_000951	GGACT	2	10	12655	12664	20 %	20 %	40 %	20 %	11497194
14	NC_000951	AACTT	2	10	12740	12749	40 %	40 %	0 %	20 %	11497194
15	NC_000951	GAAAA	2	10	13376	13385	80 %	0 %	20 %	0 %	11497195
16	NC_000951	AAAGT	2	10	13398	13407	60 %	20 %	20 %	0 %	11497195
17	NC_000951	ATTAA	2	10	15240	15249	60 %	40 %	0 %	0 %	11497198
18	NC_000951	AGTAA	2	10	15877	15886	60 %	20 %	20 %	0 %	11497200
19	NC_000951	TCACT	2	10	16034	16043	20 %	40 %	0 %	40 %	11497200
20	NC_000951	TTGCT	2	10	16131	16140	0 %	60 %	20 %	20 %	364556493
21	NC_000951	TATGT	2	10	16241	16250	20 %	60 %	20 %	0 %	364556493
22	NC_000951	ATTTT	2	10	17196	17205	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_000951	AAGGA	2	10	17230	17239	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_000951	AAAAT	2	10	17523	17532	80 %	20 %	0 %	0 %	11497203
25	NC_000951	TGTAG	2	10	18888	18897	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_000951	ATTAT	2	10	19025	19034	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_000951	TTTTA	2	10	22863	22872	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_000951	GAGTT	2	10	24184	24193	20 %	40 %	40 %	0 %	11497210
29	NC_000951	ATAAA	2	10	24629	24638	80 %	20 %	0 %	0 %	11497211
30	NC_000951	ACTTG	2	10	24978	24987	20 %	40 %	20 %	20 %	11497211
31	NC_000951	ATTTT	2	10	25729	25738	20 %	80 %	0 %	0 %	11497212
32	NC_000951	AGAAA	2	10	26723	26732	80 %	0 %	20 %	0 %	364556494
33	NC_000951	TATAA	2	10	27041	27050	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_000951	CTTTG	2	10	27446	27455	0 %	60 %	20 %	20 %	11497223
35	NC_000951	TTACA	2	10	29670	29679	40 %	40 %	0 %	20 %	11497214

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.