MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid cp32-6

Total Repeats: 86

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000951	ATTT	3	12	573	584	25 %	75 %	0 %	0 %	11497225
2	NC_000951	ATTA	2	8	944	951	50 %	50 %	0 %	0 %	11497225
3	NC_000951	GTTC	2	8	1677	1684	0 %	50 %	25 %	25 %	11497226
4	NC_000951	TGCT	2	8	2530	2537	0 %	50 %	25 %	25 %	11497227
5	NC_000951	ATGT	2	8	3016	3023	25 %	50 %	25 %	0 %	11497228
6	NC_000951	GTAT	2	8	3041	3048	25 %	50 %	25 %	0 %	11497228
7	NC_000951	ATAA	2	8	3123	3130	75 %	25 %	0 %	0 %	11497228
8	NC_000951	TAAT	2	8	3172	3179	50 %	50 %	0 %	0 %	11497228
9	NC_000951	CAAT	2	8	3205	3212	50 %	25 %	0 %	25 %	11497228
10	NC_000951	TTTA	2	8	3896	3903	25 %	75 %	0 %	0 %	364556497
11	NC_000951	GTAA	2	8	3934	3941	50 %	25 %	25 %	0 %	364556497
12	NC_000951	TCAT	2	8	4848	4855	25 %	50 %	0 %	25 %	364556495
13	NC_000951	TTAC	2	8	5156	5163	25 %	50 %	0 %	25 %	11497216
14	NC_000951	AATG	2	8	5403	5410	50 %	25 %	25 %	0 %	11497216
15	NC_000951	AAGT	2	8	6068	6075	50 %	25 %	25 %	0 %	11497218
16	NC_000951	TTTA	2	8	7005	7012	25 %	75 %	0 %	0 %	11497230
17	NC_000951	AGAA	2	8	7226	7233	75 %	0 %	25 %	0 %	11497230
18	NC_000951	GCTG	2	8	7340	7347	0 %	25 %	50 %	25 %	11497230
19	NC_000951	ATTT	2	8	8503	8510	25 %	75 %	0 %	0 %	11497232
20	NC_000951	TGAG	2	8	8607	8614	25 %	25 %	50 %	0 %	11497232
21	NC_000951	CTTG	2	8	8805	8812	0 %	50 %	25 %	25 %	11497233
22	NC_000951	AATT	2	8	8951	8958	50 %	50 %	0 %	0 %	11497233
23	NC_000951	CAAG	2	8	9620	9627	50 %	0 %	25 %	25 %	11497234
24	NC_000951	TAAT	2	8	10098	10105	50 %	50 %	0 %	0 %	11497234
25	NC_000951	TGGA	2	8	10165	10172	25 %	25 %	50 %	0 %	11497234
26	NC_000951	AGAA	2	8	10396	10403	75 %	0 %	25 %	0 %	11497235
27	NC_000951	GGCA	2	8	11372	11379	25 %	0 %	50 %	25 %	11497220
28	NC_000951	GAAT	2	8	11955	11962	50 %	25 %	25 %	0 %	11497221
29	NC_000951	TCAA	2	8	12178	12185	50 %	25 %	0 %	25 %	11497221
30	NC_000951	AATT	2	8	12451	12458	50 %	50 %	0 %	0 %	11497221
31	NC_000951	GTTT	2	8	12471	12478	0 %	75 %	25 %	0 %	11497221
32	NC_000951	TAAT	2	8	13012	13019	50 %	50 %	0 %	0 %	11497195
33	NC_000951	AGAT	2	8	13691	13698	50 %	25 %	25 %	0 %	11497195
34	NC_000951	TATC	2	8	13903	13910	25 %	50 %	0 %	25 %	11497196
35	NC_000951	AAAC	2	8	14095	14102	75 %	0 %	0 %	25 %	11497196
36	NC_000951	ATTT	2	8	14111	14118	25 %	75 %	0 %	0 %	11497196
37	NC_000951	TCAA	2	8	15667	15674	50 %	25 %	0 %	25 %	11497199
38	NC_000951	AGGA	2	8	15739	15746	50 %	0 %	50 %	0 %	11497199
39	NC_000951	CTAT	2	8	15751	15758	25 %	50 %	0 %	25 %	11497199
40	NC_000951	AATA	2	8	15767	15774	75 %	25 %	0 %	0 %	11497199
41	NC_000951	TAAC	2	8	15821	15828	50 %	25 %	0 %	25 %	11497200
42	NC_000951	TAAT	2	8	16590	16597	50 %	50 %	0 %	0 %	11497202
43	NC_000951	ATTT	2	8	16905	16912	25 %	75 %	0 %	0 %	11497202
44	NC_000951	TTTC	2	8	16988	16995	0 %	75 %	0 %	25 %	11497202
45	NC_000951	CAAA	2	8	17606	17613	75 %	0 %	0 %	25 %	11497203
46	NC_000951	TCTT	2	8	17760	17767	0 %	75 %	0 %	25 %	11497204
47	NC_000951	CTTG	2	8	18164	18171	0 %	50 %	25 %	25 %	11497204
48	NC_000951	AAGA	3	12	19523	19534	75 %	0 %	25 %	0 %	11497205
49	NC_000951	AAAT	2	8	19677	19684	75 %	25 %	0 %	0 %	11497205
50	NC_000951	TAAA	2	8	19703	19710	75 %	25 %	0 %	0 %	11497205
51	NC_000951	AGAA	2	8	19763	19770	75 %	0 %	25 %	0 %	11497205
52	NC_000951	CAAA	2	8	19773	19780	75 %	0 %	0 %	25 %	11497205
53	NC_000951	GAAA	2	8	19918	19925	75 %	0 %	25 %	0 %	11497205
54	NC_000951	TTTA	2	8	20637	20644	25 %	75 %	0 %	0 %	11497206
55	NC_000951	TCAA	2	8	20757	20764	50 %	25 %	0 %	25 %	11497207
56	NC_000951	TGTA	2	8	21653	21660	25 %	50 %	25 %	0 %	11497208
57	NC_000951	AAAG	2	8	21904	21911	75 %	0 %	25 %	0 %	11497208
58	NC_000951	ATAG	2	8	22381	22388	50 %	25 %	25 %	0 %	11497209
59	NC_000951	AGAT	2	8	22400	22407	50 %	25 %	25 %	0 %	11497209
60	NC_000951	ATAG	2	8	22435	22442	50 %	25 %	25 %	0 %	11497209
61	NC_000951	ATAG	2	8	22468	22475	50 %	25 %	25 %	0 %	11497209
62	NC_000951	ATAG	2	8	22522	22529	50 %	25 %	25 %	0 %	11497209
63	NC_000951	AGAT	2	8	22541	22548	50 %	25 %	25 %	0 %	11497209
64	NC_000951	ATAG	2	8	22597	22604	50 %	25 %	25 %	0 %	11497209
65	NC_000951	AAAT	2	8	22649	22656	75 %	25 %	0 %	0 %	11497209
66	NC_000951	TAAG	2	8	23380	23387	50 %	25 %	25 %	0 %	11497210
67	NC_000951	AAAT	2	8	23681	23688	75 %	25 %	0 %	0 %	11497210
68	NC_000951	AATC	2	8	24252	24259	50 %	25 %	0 %	25 %	11497210
69	NC_000951	AGAT	2	8	24476	24483	50 %	25 %	25 %	0 %	11497210
70	NC_000951	AAAT	3	12	25199	25210	75 %	25 %	0 %	0 %	11497212
71	NC_000951	TAAA	2	8	25214	25221	75 %	25 %	0 %	0 %	11497212
72	NC_000951	AGGT	2	8	25336	25343	25 %	25 %	50 %	0 %	11497212
73	NC_000951	ACCA	2	8	25583	25590	50 %	0 %	0 %	50 %	11497212
74	NC_000951	GTTT	2	8	25603	25610	0 %	75 %	25 %	0 %	11497212
75	NC_000951	TAAA	2	8	25656	25663	75 %	25 %	0 %	0 %	11497212
76	NC_000951	AGAA	2	8	26981	26988	75 %	0 %	25 %	0 %	364556494
77	NC_000951	TAAA	2	8	28293	28300	75 %	25 %	0 %	0 %	11497224
78	NC_000951	CAAG	2	8	28318	28325	50 %	0 %	25 %	25 %	11497224
79	NC_000951	AATT	2	8	28339	28346	50 %	50 %	0 %	0 %	11497224
80	NC_000951	CAAA	2	8	28498	28505	75 %	0 %	0 %	25 %	11497214
81	NC_000951	AAAT	2	8	28536	28543	75 %	25 %	0 %	0 %	11497214
82	NC_000951	AATT	2	8	28587	28594	50 %	50 %	0 %	0 %	11497214
83	NC_000951	TAGC	2	8	28694	28701	25 %	25 %	25 %	25 %	11497214
84	NC_000951	TGAT	2	8	28901	28908	25 %	50 %	25 %	0 %	11497214
85	NC_000951	AGCA	2	8	29262	29269	50 %	0 %	25 %	25 %	11497214
86	NC_000951	AAAT	2	8	29288	29295	75 %	25 %	0 %	0 %	11497214

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.