MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid cp32-6

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000951	GT	3	6	66	71	0 %	50 %	50 %	0 %	11497225
2	NC_000951	AT	3	6	504	509	50 %	50 %	0 %	0 %	11497225
3	NC_000951	AG	4	8	1175	1182	50 %	0 %	50 %	0 %	11497225
4	NC_000951	TA	3	6	2966	2971	50 %	50 %	0 %	0 %	11497228
5	NC_000951	CT	3	6	3189	3194	0 %	50 %	0 %	50 %	11497228
6	NC_000951	TC	3	6	4313	4318	0 %	50 %	0 %	50 %	364556495
7	NC_000951	TG	3	6	5387	5392	0 %	50 %	50 %	0 %	11497216
8	NC_000951	AG	3	6	5528	5533	50 %	0 %	50 %	0 %	364556496
9	NC_000951	AT	3	6	5921	5926	50 %	50 %	0 %	0 %	11497218
10	NC_000951	TA	3	6	5937	5942	50 %	50 %	0 %	0 %	11497218
11	NC_000951	TC	3	6	6037	6042	0 %	50 %	0 %	50 %	11497218
12	NC_000951	AT	4	8	6413	6420	50 %	50 %	0 %	0 %	11497219
13	NC_000951	AT	3	6	6550	6555	50 %	50 %	0 %	0 %	11497219
14	NC_000951	AC	3	6	7058	7063	50 %	0 %	0 %	50 %	11497230
15	NC_000951	TA	3	6	7506	7511	50 %	50 %	0 %	0 %	11497230
16	NC_000951	AG	3	6	9179	9184	50 %	0 %	50 %	0 %	11497234
17	NC_000951	AT	3	6	9823	9828	50 %	50 %	0 %	0 %	11497234
18	NC_000951	AC	3	6	10079	10084	50 %	0 %	0 %	50 %	11497234
19	NC_000951	AT	3	6	10514	10519	50 %	50 %	0 %	0 %	11497235
20	NC_000951	TA	3	6	10693	10698	50 %	50 %	0 %	0 %	11497235
21	NC_000951	TA	4	8	10814	10821	50 %	50 %	0 %	0 %	11497235
22	NC_000951	AT	3	6	11217	11222	50 %	50 %	0 %	0 %	11497220
23	NC_000951	TA	3	6	11616	11621	50 %	50 %	0 %	0 %	11497220
24	NC_000951	CA	3	6	11750	11755	50 %	0 %	0 %	50 %	11497220
25	NC_000951	CA	3	6	12116	12121	50 %	0 %	0 %	50 %	11497221
26	NC_000951	TA	3	6	12239	12244	50 %	50 %	0 %	0 %	11497221
27	NC_000951	CA	3	6	12791	12796	50 %	0 %	0 %	50 %	11497194
28	NC_000951	AT	3	6	13188	13193	50 %	50 %	0 %	0 %	11497195
29	NC_000951	AT	4	8	13462	13469	50 %	50 %	0 %	0 %	11497195
30	NC_000951	AT	3	6	13874	13879	50 %	50 %	0 %	0 %	11497196
31	NC_000951	AT	3	6	15496	15501	50 %	50 %	0 %	0 %	11497199
32	NC_000951	AT	3	6	15906	15911	50 %	50 %	0 %	0 %	11497200
33	NC_000951	AT	3	6	16074	16079	50 %	50 %	0 %	0 %	11497200
34	NC_000951	AT	3	6	16379	16384	50 %	50 %	0 %	0 %	364556493
35	NC_000951	AC	3	6	17448	17453	50 %	0 %	0 %	50 %	11497203
36	NC_000951	AT	3	6	17744	17749	50 %	50 %	0 %	0 %	11497204
37	NC_000951	AT	4	8	20920	20927	50 %	50 %	0 %	0 %	11497207
38	NC_000951	TA	3	6	21417	21422	50 %	50 %	0 %	0 %	11497207
39	NC_000951	AT	3	6	22574	22579	50 %	50 %	0 %	0 %	11497209
40	NC_000951	AT	3	6	22628	22633	50 %	50 %	0 %	0 %	11497209
41	NC_000951	TA	3	6	23593	23598	50 %	50 %	0 %	0 %	11497210
42	NC_000951	AG	3	6	23634	23639	50 %	0 %	50 %	0 %	11497210
43	NC_000951	TA	3	6	23674	23679	50 %	50 %	0 %	0 %	11497210
44	NC_000951	AG	3	6	24090	24095	50 %	0 %	50 %	0 %	11497210
45	NC_000951	AT	3	6	24783	24788	50 %	50 %	0 %	0 %	11497211
46	NC_000951	AG	3	6	25104	25109	50 %	0 %	50 %	0 %	11497212
47	NC_000951	AT	3	6	27267	27272	50 %	50 %	0 %	0 %	11497223
48	NC_000951	AT	3	6	27654	27659	50 %	50 %	0 %	0 %	11497223
49	NC_000951	TG	3	6	28027	28032	0 %	50 %	50 %	0 %	11497224
50	NC_000951	AT	3	6	28369	28374	50 %	50 %	0 %	0 %	11497224
51	NC_000951	AT	3	6	28553	28558	50 %	50 %	0 %	0 %	11497214
52	NC_000951	AT	3	6	28893	28898	50 %	50 %	0 %	0 %	11497214
53	NC_000951	TA	3	6	29210	29215	50 %	50 %	0 %	0 %	11497214
54	NC_000951	AG	3	6	29797	29802	50 %	0 %	50 %	0 %	11497214

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.