MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid cp32-4

Total Repeats: 27

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000950	AAAAC	2	10	81	90	80 %	0 %	0 %	20 %	11497179
2	NC_000950	TGGCA	2	10	2333	2342	20 %	20 %	40 %	20 %	11497180
3	NC_000950	AATTA	2	10	2571	2580	60 %	40 %	0 %	0 %	11497180
4	NC_000950	AAGAG	2	10	3410	3419	60 %	0 %	40 %	0 %	364556467
5	NC_000950	TTCAA	2	10	4389	4398	40 %	40 %	0 %	20 %	364556461
6	NC_000950	GAAAA	2	10	6925	6934	80 %	0 %	20 %	0 %	11497183
7	NC_000950	CTGCA	2	10	7579	7588	20 %	20 %	20 %	40 %	11497183
8	NC_000950	CAAAA	2	10	9490	9499	80 %	0 %	0 %	20 %	11497187
9	NC_000950	AATCT	2	10	12206	12215	40 %	40 %	0 %	20 %	11497190
10	NC_000950	GGACT	2	10	12589	12598	20 %	20 %	40 %	20 %	11497158
11	NC_000950	AACTT	2	10	12674	12683	40 %	40 %	0 %	20 %	11497158
12	NC_000950	GAAAA	2	10	13310	13319	80 %	0 %	20 %	0 %	11497159
13	NC_000950	AAAGT	2	10	13332	13341	60 %	20 %	20 %	0 %	11497159
14	NC_000950	AAATC	2	10	14608	14617	60 %	20 %	0 %	20 %	11497161
15	NC_000950	ATTAA	2	10	15176	15185	60 %	40 %	0 %	0 %	11497162
16	NC_000950	AGTAA	2	10	15813	15822	60 %	20 %	20 %	0 %	11497164
17	NC_000950	TCACT	2	10	15970	15979	20 %	40 %	0 %	40 %	11497164
18	NC_000950	TTGCT	2	10	16067	16076	0 %	60 %	20 %	20 %	364556463
19	NC_000950	AAAAT	2	10	17364	17373	80 %	20 %	0 %	0 %	11497167
20	NC_000950	AATTT	2	10	18525	18534	40 %	60 %	0 %	0 %	364556465
21	NC_000950	ATTGA	2	10	20786	20795	40 %	40 %	20 %	0 %	11497171
22	NC_000950	GAGTT	2	10	23774	23783	20 %	40 %	40 %	0 %	11497173
23	NC_000950	ATAAA	2	10	24220	24229	80 %	20 %	0 %	0 %	11497174
24	NC_000950	ACTTG	2	10	24569	24578	20 %	40 %	20 %	20 %	11497174
25	NC_000950	ATTTT	2	10	25317	25326	20 %	80 %	0 %	0 %	11497175
26	NC_000950	TAAAT	2	10	27209	27218	60 %	40 %	0 %	0 %	11497151
27	NC_000950	TTACA	2	10	30131	30140	40 %	40 %	0 %	20 %	11497152

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.