MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid cp32-4

Total Repeats: 380

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000950	AGA	2	6	164	169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497179
2	NC_000950	TGC	2	6	200	205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497179
3	NC_000950	TAT	2	6	272	277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497179
4	NC_000950	AAC	2	6	343	348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497179
5	NC_000950	CAA	2	6	449	454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497179
6	NC_000950	CAA	2	6	685	690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497179
7	NC_000950	CTT	2	6	691	696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497179
8	NC_000950	TAA	2	6	716	721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497179
9	NC_000950	TCT	2	6	744	749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497179
10	NC_000950	AAT	2	6	855	860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497179
11	NC_000950	TTA	2	6	904	909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497179
12	NC_000950	AGG	2	6	931	936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497179
13	NC_000950	ATG	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497179
14	NC_000950	ATT	2	6	1048	1053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497179
15	NC_000950	GAG	2	6	1248	1253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497179
16	NC_000950	ATT	2	6	1274	1279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497179
17	NC_000950	AGA	2	6	2039	2044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497180
18	NC_000950	TAG	2	6	2174	2179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497180
19	NC_000950	TAC	2	6	2258	2263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497180
20	NC_000950	TGG	3	9	2282	2290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497180
21	NC_000950	TGA	2	6	2621	2626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497181
22	NC_000950	GAA	2	6	2697	2702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497181
23	NC_000950	TAG	2	6	2810	2815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497181
24	NC_000950	GTT	2	6	2824	2829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497181
25	NC_000950	AGA	2	6	2894	2899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497181
26	NC_000950	TAG	2	6	3032	3037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497181
27	NC_000950	TTA	2	6	3142	3147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497181
28	NC_000950	TGG	3	9	3155	3163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497181
29	NC_000950	CCA	2	6	3165	3170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	11497181
30	NC_000950	TGG	2	6	3338	3343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497181
31	NC_000950	ATT	2	6	3393	3398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556467
32	NC_000950	ATC	2	6	3557	3562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	364556467
33	NC_000950	TGG	2	6	3654	3659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	364556467
34	NC_000950	GAT	2	6	3664	3669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	364556467
35	NC_000950	AAT	2	6	3733	3738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556467
36	NC_000950	TAG	2	6	3752	3757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	364556467
37	NC_000950	TAA	2	6	3798	3803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556467
38	NC_000950	CAC	2	6	3833	3838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	364556467
39	NC_000950	ATT	2	6	3978	3983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556461
40	NC_000950	TGA	2	6	3984	3989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	364556461
41	NC_000950	ATT	2	6	3992	3997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556461
42	NC_000950	TAA	2	6	4296	4301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556461
43	NC_000950	ATT	2	6	4348	4353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556461
44	NC_000950	TTA	2	6	4358	4363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556461
45	NC_000950	CTT	2	6	4444	4449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	364556461
46	NC_000950	AGA	2	6	4470	4475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	364556461
47	NC_000950	TAA	2	6	4488	4493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556461
48	NC_000950	ATG	2	6	4573	4578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	364556461
49	NC_000950	GCA	3	9	4624	4632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	364556461
50	NC_000950	GCA	2	6	4639	4644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	364556461
51	NC_000950	GGA	2	6	4662	4667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	364556461
52	NC_000950	TAA	2	6	4695	4700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556461
53	NC_000950	AGA	2	6	4704	4709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	364556461
54	NC_000950	TTA	2	6	4775	4780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556461
55	NC_000950	AGG	2	6	4875	4880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	364556461
56	NC_000950	CTA	2	6	4889	4894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	364556461
57	NC_000950	GAA	3	9	4991	4999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497154
58	NC_000950	GTT	2	6	5204	5209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497154
59	NC_000950	ATT	2	6	5265	5270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497154
60	NC_000950	TAG	2	6	5275	5280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497154
61	NC_000950	GAA	2	6	5291	5296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497154
62	NC_000950	TGT	2	6	5499	5504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	364556462
63	NC_000950	TTC	2	6	5520	5525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	364556462
64	NC_000950	TTA	2	6	5573	5578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556462
65	NC_000950	TGG	2	6	5822	5827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497156
66	NC_000950	TAG	2	6	5903	5908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497156
67	NC_000950	AAT	2	6	5931	5936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497156
68	NC_000950	CTA	2	6	6024	6029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497156
69	NC_000950	GTA	2	6	6088	6093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497156
70	NC_000950	GCA	2	6	6099	6104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497156
71	NC_000950	TTG	2	6	6112	6117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497156
72	NC_000950	AAT	2	6	6239	6244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497157
73	NC_000950	ATC	2	6	6273	6278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497157
74	NC_000950	GCT	2	6	6299	6304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497157
75	NC_000950	ATA	2	6	6314	6319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497157
76	NC_000950	TAA	2	6	6556	6561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497157
77	NC_000950	AGG	2	6	6696	6701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497157
78	NC_000950	TAG	2	6	6761	6766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497183
79	NC_000950	ATT	2	6	6772	6777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497183
80	NC_000950	TAA	2	6	6860	6865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497183
81	NC_000950	GAA	2	6	6978	6983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497183
82	NC_000950	TGT	2	6	7067	7072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497183
83	NC_000950	TTA	2	6	7075	7080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497183
84	NC_000950	GAT	2	6	7101	7106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497183
85	NC_000950	TAA	2	6	7133	7138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497183
86	NC_000950	TTG	2	6	7357	7362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497183
87	NC_000950	CTT	2	6	7413	7418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497183
88	NC_000950	AAG	2	6	7453	7458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497183
89	NC_000950	ATT	2	6	7524	7529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497183
90	NC_000950	TTA	2	6	7534	7539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497183
91	NC_000950	ATA	2	6	7665	7670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497183
92	NC_000950	TAC	2	6	7778	7783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497183
93	NC_000950	TGG	2	6	7876	7881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497184
94	NC_000950	ACA	2	6	7925	7930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497184
95	NC_000950	TAG	2	6	7942	7947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497184
96	NC_000950	TAA	2	6	7968	7973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497184
97	NC_000950	TGA	2	6	8062	8067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497184
98	NC_000950	ATT	2	6	8144	8149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497184
99	NC_000950	AAG	2	6	8182	8187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497184
100	NC_000950	CTG	2	6	8193	8198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497184
101	NC_000950	ACA	2	6	8256	8261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497184
102	NC_000950	TTA	2	6	8277	8282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497185
103	NC_000950	TTA	2	6	8512	8517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497185
104	NC_000950	TTG	2	6	8529	8534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497185
105	NC_000950	AAT	2	6	8536	8541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497185
106	NC_000950	AAT	2	6	8621	8626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497185
107	NC_000950	TTG	2	6	8637	8642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497185
108	NC_000950	TCA	2	6	8696	8701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497185
109	NC_000950	TGA	2	6	8778	8783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497186
110	NC_000950	TAC	2	6	8866	8871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497186
111	NC_000950	TGC	2	6	9022	9027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497187
112	NC_000950	TAG	2	6	9151	9156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497187
113	NC_000950	AGA	2	6	9269	9274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497187
114	NC_000950	TTG	2	6	9378	9383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497187
115	NC_000950	GGA	2	6	9443	9448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497187
116	NC_000950	GAA	2	6	9479	9484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497187
117	NC_000950	AGA	2	6	9625	9630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497187
118	NC_000950	GTG	2	6	9738	9743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497187
119	NC_000950	AGC	2	6	9749	9754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497187
120	NC_000950	AAG	2	6	9821	9826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497187
121	NC_000950	AGA	2	6	9850	9855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497187
122	NC_000950	GAT	2	6	9913	9918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497187
123	NC_000950	AAT	2	6	9965	9970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497187
124	NC_000950	ACC	2	6	10025	10030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	11497187
125	NC_000950	TAA	2	6	10060	10065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497187
126	NC_000950	ATT	2	6	10106	10111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497187
127	NC_000950	ATT	2	6	10152	10157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497187
128	NC_000950	AAG	3	9	10230	10238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497187
129	NC_000950	AAC	2	6	10259	10264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497187
130	NC_000950	ATA	2	6	10356	10361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497188
131	NC_000950	TAA	2	6	10369	10374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497188
132	NC_000950	GTT	2	6	10513	10518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497188
133	NC_000950	TCA	2	6	10531	10536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497188
134	NC_000950	ATT	2	6	10537	10542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497188
135	NC_000950	AAC	2	6	10708	10713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497188
136	NC_000950	TAC	2	6	10903	10908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497189
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138	NC_000950	ATC	2	6	10998	11003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497189
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141	NC_000950	TTA	2	6	11271	11276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497189
142	NC_000950	CTT	2	6	11288	11293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497189
143	NC_000950	AAG	2	6	11314	11319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497189
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150	NC_000950	AAG	2	6	12006	12011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497190
151	NC_000950	TAC	2	6	12105	12110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497190
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153	NC_000950	AAC	2	6	12265	12270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497190
154	NC_000950	AGG	2	6	12337	12342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497190
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156	NC_000950	TAA	2	6	12486	12491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497158
157	NC_000950	TTG	2	6	12503	12508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497158
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160	NC_000950	TAA	2	6	12689	12694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497158
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164	NC_000950	ATT	2	6	12909	12914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497159
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.