MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid cp32-4

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000950	GT	3	6	66	71	0 %	50 %	50 %	0 %	11497179
2	NC_000950	AT	3	6	504	509	50 %	50 %	0 %	0 %	11497179
3	NC_000950	AG	3	6	2960	2965	50 %	0 %	50 %	0 %	11497181
4	NC_000950	TA	3	6	2969	2974	50 %	50 %	0 %	0 %	11497181
5	NC_000950	CT	3	6	3192	3197	0 %	50 %	0 %	50 %	11497181
6	NC_000950	TC	3	6	4316	4321	0 %	50 %	0 %	50 %	364556461
7	NC_000950	TG	3	6	5390	5395	0 %	50 %	50 %	0 %	11497154
8	NC_000950	AG	3	6	5531	5536	50 %	0 %	50 %	0 %	364556462
9	NC_000950	AT	3	6	5924	5929	50 %	50 %	0 %	0 %	11497156
10	NC_000950	TA	3	6	5940	5945	50 %	50 %	0 %	0 %	11497156
11	NC_000950	AT	4	8	6416	6423	50 %	50 %	0 %	0 %	11497157
12	NC_000950	AT	3	6	6550	6555	50 %	50 %	0 %	0 %	11497157
13	NC_000950	AC	3	6	7058	7063	50 %	0 %	0 %	50 %	11497183
14	NC_000950	TA	3	6	7506	7511	50 %	50 %	0 %	0 %	11497183
15	NC_000950	AG	3	6	9179	9184	50 %	0 %	50 %	0 %	11497187
16	NC_000950	AT	3	6	9844	9849	50 %	50 %	0 %	0 %	11497187
17	NC_000950	AC	3	6	10100	10105	50 %	0 %	0 %	50 %	11497187
18	NC_000950	AT	3	6	10594	10599	50 %	50 %	0 %	0 %	11497188
19	NC_000950	TA	3	6	10627	10632	50 %	50 %	0 %	0 %	11497188
20	NC_000950	TA	4	8	10748	10755	50 %	50 %	0 %	0 %	11497188
21	NC_000950	AT	3	6	11151	11156	50 %	50 %	0 %	0 %	11497189
22	NC_000950	TA	3	6	11550	11555	50 %	50 %	0 %	0 %	11497189
23	NC_000950	CA	3	6	11684	11689	50 %	0 %	0 %	50 %	11497189
24	NC_000950	CA	3	6	12050	12055	50 %	0 %	0 %	50 %	11497190
25	NC_000950	TA	3	6	12173	12178	50 %	50 %	0 %	0 %	11497190
26	NC_000950	CA	3	6	12725	12730	50 %	0 %	0 %	50 %	11497158
27	NC_000950	AT	3	6	13122	13127	50 %	50 %	0 %	0 %	11497159
28	NC_000950	AT	4	8	13396	13403	50 %	50 %	0 %	0 %	11497159
29	NC_000950	AT	3	6	13808	13813	50 %	50 %	0 %	0 %	11497160
30	NC_000950	AT	3	6	15432	15437	50 %	50 %	0 %	0 %	11497163
31	NC_000950	AT	3	6	15842	15847	50 %	50 %	0 %	0 %	11497164
32	NC_000950	AT	3	6	16010	16015	50 %	50 %	0 %	0 %	11497164
33	NC_000950	AT	3	6	16315	16320	50 %	50 %	0 %	0 %	364556463
34	NC_000950	AT	3	6	16542	16547	50 %	50 %	0 %	0 %	364556464
35	NC_000950	CT	3	6	18038	18043	0 %	50 %	0 %	50 %	364556465
36	NC_000950	AT	3	6	19023	19028	50 %	50 %	0 %	0 %	11497169
37	NC_000950	TA	3	6	19973	19978	50 %	50 %	0 %	0 %	11497169
38	NC_000950	TA	3	6	20560	20565	50 %	50 %	0 %	0 %	11497170
39	NC_000950	AT	3	6	20692	20697	50 %	50 %	0 %	0 %	11497171
40	NC_000950	AT	3	6	20773	20778	50 %	50 %	0 %	0 %	11497171
41	NC_000950	AT	3	6	20845	20850	50 %	50 %	0 %	0 %	11497171
42	NC_000950	AT	3	6	20949	20954	50 %	50 %	0 %	0 %	11497171
43	NC_000950	TA	3	6	21572	21577	50 %	50 %	0 %	0 %	11497172
44	NC_000950	TA	3	6	21749	21754	50 %	50 %	0 %	0 %	11497172
45	NC_000950	AT	3	6	21758	21763	50 %	50 %	0 %	0 %	11497172
46	NC_000950	TA	3	6	23183	23188	50 %	50 %	0 %	0 %	11497173
47	NC_000950	AT	3	6	24374	24379	50 %	50 %	0 %	0 %	11497174
48	NC_000950	GA	3	6	24815	24820	50 %	0 %	50 %	0 %	11497175
49	NC_000950	TA	3	6	25069	25074	50 %	50 %	0 %	0 %	11497175
50	NC_000950	TA	3	6	26471	26476	50 %	50 %	0 %	0 %	364556460
51	NC_000950	AG	3	6	27227	27232	50 %	0 %	50 %	0 %	11497151
52	NC_000950	TA	3	6	27679	27684	50 %	50 %	0 %	0 %	364556466
53	NC_000950	GA	3	6	28001	28006	50 %	0 %	50 %	0 %	364556466
54	NC_000950	AT	3	6	28109	28114	50 %	50 %	0 %	0 %	364556466
55	NC_000950	TG	3	6	28488	28493	0 %	50 %	50 %	0 %	11497178
56	NC_000950	AT	4	8	29354	29361	50 %	50 %	0 %	0 %	11497152
57	NC_000950	AG	3	6	30258	30263	50 %	0 %	50 %	0 %	11497152

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.