MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid cp32-3

Total Repeats: 92

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000949	ATTT	3	12	573	584	25 %	75 %	0 %	0 %	11497136
2	NC_000949	ATTA	2	8	944	951	50 %	50 %	0 %	0 %	11497136
3	NC_000949	GTTC	2	8	1677	1684	0 %	50 %	25 %	25 %	11497137
4	NC_000949	ATAC	2	8	1928	1935	50 %	25 %	0 %	25 %	11497137
5	NC_000949	AAGA	2	8	2380	2387	75 %	0 %	25 %	0 %	11497138
6	NC_000949	ATTT	2	8	2516	2523	25 %	75 %	0 %	0 %	11497138
7	NC_000949	TGCT	2	8	2528	2535	0 %	50 %	25 %	25 %	11497138
8	NC_000949	GCAA	2	8	2676	2683	50 %	0 %	25 %	25 %	11497139
9	NC_000949	ATGT	2	8	3014	3021	25 %	50 %	25 %	0 %	11497139
10	NC_000949	GTAT	2	8	3039	3046	25 %	50 %	25 %	0 %	11497139
11	NC_000949	ATAA	2	8	3121	3128	75 %	25 %	0 %	0 %	11497139
12	NC_000949	CAAT	2	8	3203	3210	50 %	25 %	0 %	25 %	11497139
13	NC_000949	TAAA	2	8	3362	3369	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_000949	TTTA	2	8	3889	3896	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_000949	CTAC	2	8	4794	4801	25 %	25 %	0 %	50 %	11497125
16	NC_000949	TCAT	2	8	4841	4848	25 %	50 %	0 %	25 %	11497125
17	NC_000949	TACT	2	8	5150	5157	25 %	50 %	0 %	25 %	365257007
18	NC_000949	AATG	2	8	5396	5403	50 %	25 %	25 %	0 %	365257007
19	NC_000949	AAGT	2	8	6061	6068	50 %	25 %	25 %	0 %	11497128
20	NC_000949	AGAA	2	8	7216	7223	75 %	0 %	25 %	0 %	11497141
21	NC_000949	GCTG	2	8	7330	7337	0 %	25 %	50 %	25 %	11497141
22	NC_000949	ATTT	2	8	8493	8500	25 %	75 %	0 %	0 %	11497143
23	NC_000949	TGAG	2	8	8597	8604	25 %	25 %	50 %	0 %	11497143
24	NC_000949	CTTG	2	8	8795	8802	0 %	50 %	25 %	25 %	11497144
25	NC_000949	AATT	2	8	8941	8948	50 %	50 %	0 %	0 %	11497144
26	NC_000949	CAAG	2	8	9610	9617	50 %	0 %	25 %	25 %	11497145
27	NC_000949	TAAT	2	8	10088	10095	50 %	50 %	0 %	0 %	11497145
28	NC_000949	CTAC	2	8	10150	10157	25 %	25 %	0 %	50 %	11497145
29	NC_000949	AGAA	2	8	10386	10393	75 %	0 %	25 %	0 %	11497146
30	NC_000949	CTTT	2	8	10697	10704	0 %	75 %	0 %	25 %	11497146
31	NC_000949	GGCA	2	8	11362	11369	25 %	0 %	50 %	25 %	11497147
32	NC_000949	GAAT	2	8	11945	11952	50 %	25 %	25 %	0 %	11497148
33	NC_000949	TCAA	2	8	12168	12175	50 %	25 %	0 %	25 %	11497148
34	NC_000949	AATT	2	8	12432	12439	50 %	50 %	0 %	0 %	11497148
35	NC_000949	GTTT	2	8	12452	12459	0 %	75 %	25 %	0 %	11497148
36	NC_000949	TAAT	2	8	12993	13000	50 %	50 %	0 %	0 %	11497131
37	NC_000949	AGAT	2	8	13672	13679	50 %	25 %	25 %	0 %	11497131
38	NC_000949	TATC	2	8	13884	13891	25 %	50 %	0 %	25 %	365257002
39	NC_000949	AAAC	2	8	14076	14083	75 %	0 %	0 %	25 %	365257002
40	NC_000949	ATTT	2	8	14092	14099	25 %	75 %	0 %	0 %	365257002
41	NC_000949	ATTA	2	8	14611	14618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_000949	TACA	2	8	15004	15011	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_000949	AATA	2	8	15613	15620	75 %	25 %	0 %	0 %	11497107
44	NC_000949	TCAA	2	8	15648	15655	50 %	25 %	0 %	25 %	11497107
45	NC_000949	AGGA	2	8	15720	15727	50 %	0 %	50 %	0 %	11497107
46	NC_000949	CTAT	2	8	15732	15739	25 %	50 %	0 %	25 %	11497107
47	NC_000949	TAAC	2	8	15802	15809	50 %	25 %	0 %	25 %	11497108
48	NC_000949	TATT	2	8	16566	16573	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_000949	TTAT	2	8	16610	16617	25 %	75 %	0 %	0 %	11497132
50	NC_000949	AGAT	2	8	17345	17352	50 %	25 %	25 %	0 %	365257004
51	NC_000949	TCTT	2	8	18314	18321	0 %	75 %	0 %	25 %	365257005
52	NC_000949	CTTG	2	8	18718	18725	0 %	50 %	25 %	25 %	365257005
53	NC_000949	AAGA	3	12	20059	20070	75 %	0 %	25 %	0 %	11497114
54	NC_000949	AAAT	2	8	20213	20220	75 %	25 %	0 %	0 %	11497114
55	NC_000949	TAAA	2	8	20239	20246	75 %	25 %	0 %	0 %	11497114
56	NC_000949	AGAA	2	8	20299	20306	75 %	0 %	25 %	0 %	11497114
57	NC_000949	AACA	2	8	21149	21156	75 %	0 %	0 %	25 %	11497115
58	NC_000949	GAAA	2	8	21472	21479	75 %	0 %	25 %	0 %	11497116
59	NC_000949	ATTT	2	8	21747	21754	25 %	75 %	0 %	0 %	11497116
60	NC_000949	ATTT	2	8	21777	21784	25 %	75 %	0 %	0 %	11497116
61	NC_000949	AGAT	2	8	21862	21869	50 %	25 %	25 %	0 %	11497116
62	NC_000949	TAAA	2	8	21936	21943	75 %	25 %	0 %	0 %	11497116
63	NC_000949	AATT	2	8	22139	22146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_000949	ATGG	2	8	23025	23032	25 %	25 %	50 %	0 %	11497118
65	NC_000949	TAAA	2	8	23585	23592	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_000949	AAAT	2	8	24131	24138	75 %	25 %	0 %	0 %	365257006
67	NC_000949	AATC	2	8	24702	24709	50 %	25 %	0 %	25 %	365257006
68	NC_000949	AGAT	2	8	24926	24933	50 %	25 %	25 %	0 %	365257006
69	NC_000949	ATTA	2	8	25061	25068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_000949	AAAT	2	8	25196	25203	75 %	25 %	0 %	0 %	11497120
71	NC_000949	AAAT	3	12	25649	25660	75 %	25 %	0 %	0 %	11497121
72	NC_000949	TTTA	2	8	25680	25687	25 %	75 %	0 %	0 %	11497121
73	NC_000949	ACCA	2	8	26033	26040	50 %	0 %	0 %	50 %	11497121
74	NC_000949	AATT	2	8	26082	26089	50 %	50 %	0 %	0 %	11497121
75	NC_000949	TAAA	2	8	26106	26113	75 %	25 %	0 %	0 %	11497121
76	NC_000949	TGCA	2	8	26397	26404	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_000949	AAGA	2	8	26465	26472	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_000949	TGTA	2	8	26518	26525	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_000949	GCAA	2	8	26935	26942	50 %	0 %	25 %	25 %	11497122
80	NC_000949	GAAA	2	8	26974	26981	75 %	0 %	25 %	0 %	11497122
81	NC_000949	AGAA	2	8	27041	27048	75 %	0 %	25 %	0 %	11497122
82	NC_000949	ATAA	2	8	28070	28077	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_000949	AGAT	2	8	28194	28201	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_000949	TAAA	2	8	28678	28685	75 %	25 %	0 %	0 %	11497135
85	NC_000949	AATT	2	8	28724	28731	50 %	50 %	0 %	0 %	11497135
86	NC_000949	CAAA	2	8	28883	28890	75 %	0 %	0 %	25 %	11497124
87	NC_000949	AAAT	2	8	28921	28928	75 %	25 %	0 %	0 %	11497124
88	NC_000949	AATT	2	8	28972	28979	50 %	50 %	0 %	0 %	11497124
89	NC_000949	TAGC	2	8	29079	29086	25 %	25 %	25 %	25 %	11497124
90	NC_000949	TGAT	2	8	29286	29293	25 %	50 %	25 %	0 %	11497124
91	NC_000949	AGCA	2	8	29647	29654	50 %	0 %	25 %	25 %	11497124
92	NC_000949	AAAT	2	8	29673	29680	75 %	25 %	0 %	0 %	11497124

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.