MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid cp32-1

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000948	TAGAAA	2	12	598	609	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	11497090
2	NC_000948	CTGATA	2	12	2984	2995	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	11497093
3	NC_000948	GAATTT	2	12	5203	5214	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	364556428
4	NC_000948	TGAACT	2	12	5241	5252	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	364556428
5	NC_000948	AATGGA	2	12	6890	6901	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	11497095
6	NC_000948	AAAGAG	2	12	9529	9540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497099
7	NC_000948	TAGAAT	2	12	11910	11921	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	11497102
8	NC_000948	ACAGAA	2	12	13760	13771	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	11497071
9	NC_000948	TAAAAA	2	12	15182	15193	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_000948	AATGGT	2	12	15374	15385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497073
11	NC_000948	TAATGA	2	12	17291	17302	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	11497078
12	NC_000948	TTTTCG	2	12	18235	18246	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	11497079
13	NC_000948	AATAAA	2	12	21572	21583	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	364556431
14	NC_000948	ATATGT	2	12	23044	23055	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_000948	TAGTGT	2	12	24535	24546	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	11497085
16	NC_000948	AAGTAA	2	12	25851	25862	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_000948	GAAAAT	2	12	26255	26266	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	364556426
18	NC_000948	AAGATA	2	12	27859	27870	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	11497062

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.