MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid cp32-1

Total Repeats: 443

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000948	TAA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000948	AGA	2	6	164	169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497090
3	NC_000948	TGC	2	6	200	205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497090
4	NC_000948	TAT	2	6	272	277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497090
5	NC_000948	AAC	2	6	343	348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497090
6	NC_000948	CAA	2	6	449	454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497090
7	NC_000948	CAA	2	6	685	690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497090
8	NC_000948	CTT	2	6	691	696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497090
9	NC_000948	AAT	2	6	717	722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497090
10	NC_000948	TCT	2	6	744	749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497090
11	NC_000948	AAT	2	6	855	860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497090
12	NC_000948	TTA	2	6	904	909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497090
13	NC_000948	AGG	2	6	931	936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497090
14	NC_000948	ATG	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497090
15	NC_000948	ATT	2	6	1048	1053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497090
16	NC_000948	GAA	2	6	1161	1166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497090
17	NC_000948	TAA	2	6	1241	1246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497090
18	NC_000948	GAG	2	6	1248	1253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497090
19	NC_000948	ATT	2	6	1274	1279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497090
20	NC_000948	AGA	2	6	1317	1322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497091
21	NC_000948	AGA	2	6	1326	1331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497091
22	NC_000948	AGA	2	6	1350	1355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497091
23	NC_000948	GCA	2	6	1356	1361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497091
24	NC_000948	TTC	3	9	1809	1817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497091
25	NC_000948	AGA	2	6	1854	1859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497091
26	NC_000948	CAA	2	6	2086	2091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497092
27	NC_000948	TGG	2	6	2154	2159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497092
28	NC_000948	AAC	2	6	2250	2255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497092
29	NC_000948	TGG	3	9	2274	2282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497092
30	NC_000948	TAA	2	6	2566	2571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497092
31	NC_000948	GCT	2	6	2656	2661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497093
32	NC_000948	TGA	2	6	2739	2744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497093
33	NC_000948	TTA	2	6	3137	3142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497093
34	NC_000948	CCA	2	6	3160	3165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	11497093
35	NC_000948	TGG	2	6	3330	3335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497093
36	NC_000948	AGG	2	6	3356	3361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_000948	AAG	2	6	3410	3415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_000948	ATC	2	6	3550	3555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_000948	TGG	2	6	3647	3652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_000948	CTA	2	6	3706	3711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_000948	AAT	2	6	3726	3731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_000948	TAA	2	6	3791	3796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_000948	TAA	2	6	3939	3944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000948	GGA	2	6	3951	3956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_000948	ATT	2	6	3968	3973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556427
46	NC_000948	TGA	2	6	3974	3979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	364556427
47	NC_000948	ATT	2	6	3982	3987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556427
48	NC_000948	TAT	2	6	4031	4036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556427
49	NC_000948	ACA	2	6	4134	4139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	364556427
50	NC_000948	ATT	2	6	4201	4206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556427
51	NC_000948	TAA	3	9	4286	4294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556427
52	NC_000948	AGT	2	6	4329	4334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	364556427
53	NC_000948	ATT	2	6	4338	4343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556427
54	NC_000948	TTA	2	6	4348	4353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556427
55	NC_000948	GCT	2	6	4433	4438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	364556427
56	NC_000948	AGA	2	6	4460	4465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	364556427
57	NC_000948	GTG	2	6	4474	4479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	364556427
58	NC_000948	CGA	2	6	4544	4549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	364556427
59	NC_000948	GAT	2	6	4562	4567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	364556427
60	NC_000948	GCA	3	9	4614	4622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	364556427
61	NC_000948	GCA	2	6	4629	4634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	364556427
62	NC_000948	AGT	2	6	4635	4640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	364556427
63	NC_000948	TAA	2	6	4685	4690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556427
64	NC_000948	AGA	2	6	4694	4699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	364556427
65	NC_000948	TTA	2	6	4765	4770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556427
66	NC_000948	CTA	2	6	4879	4884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	364556427
67	NC_000948	GAA	3	9	4981	4989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	364556428
68	NC_000948	GTT	2	6	5194	5199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	364556428
69	NC_000948	ATT	2	6	5255	5260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556428
70	NC_000948	TAG	2	6	5265	5270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	364556428
71	NC_000948	GAA	2	6	5281	5286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	364556428
72	NC_000948	GGC	2	6	5287	5292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	364556428
73	NC_000948	TGT	2	6	5489	5494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	364556429
74	NC_000948	TTC	2	6	5510	5515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	364556429
75	NC_000948	TTA	2	6	5563	5568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556429
76	NC_000948	TGG	2	6	5812	5817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497067
77	NC_000948	TAG	2	6	5893	5898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497067
78	NC_000948	AAT	2	6	5921	5926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497067
79	NC_000948	CTA	2	6	6014	6019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497067
80	NC_000948	GTA	2	6	6078	6083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497067
81	NC_000948	GCA	2	6	6089	6094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497067
82	NC_000948	TTG	2	6	6102	6107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497067
83	NC_000948	AAT	2	6	6229	6234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497068
84	NC_000948	ATC	2	6	6263	6268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497068
85	NC_000948	GCT	2	6	6289	6294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497068
86	NC_000948	ATA	2	6	6304	6309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497068
87	NC_000948	TAA	2	6	6546	6551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497068
88	NC_000948	AGG	2	6	6686	6691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497068
89	NC_000948	TAG	2	6	6751	6756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497095
90	NC_000948	ATT	2	6	6762	6767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497095
91	NC_000948	TAA	2	6	6808	6813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497095
92	NC_000948	TGC	2	6	6817	6822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497095
93	NC_000948	TAA	2	6	6850	6855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497095
94	NC_000948	GAA	2	6	6968	6973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497095
95	NC_000948	TGT	2	6	7057	7062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497095
96	NC_000948	TTA	2	6	7065	7070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497095
97	NC_000948	GAT	2	6	7091	7096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497095
98	NC_000948	TAA	2	6	7123	7128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497095
99	NC_000948	CAA	2	6	7240	7245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497095
100	NC_000948	TTG	2	6	7347	7352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497095
101	NC_000948	CTT	2	6	7403	7408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497095
102	NC_000948	AAG	2	6	7443	7448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497095
103	NC_000948	ATT	2	6	7514	7519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497095
104	NC_000948	TTA	2	6	7524	7529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497095
105	NC_000948	ATA	2	6	7655	7660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497095
106	NC_000948	TAC	2	6	7768	7773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497095
107	NC_000948	TGG	2	6	7866	7871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497096
108	NC_000948	ACA	2	6	7915	7920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497096
109	NC_000948	TAG	2	6	7932	7937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497096
110	NC_000948	TAA	2	6	7958	7963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497096
111	NC_000948	TGA	2	6	8052	8057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497096
112	NC_000948	ACA	2	6	8066	8071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497096
113	NC_000948	ATT	2	6	8134	8139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497096
114	NC_000948	AAG	2	6	8172	8177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497096
115	NC_000948	CTG	2	6	8183	8188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497096
116	NC_000948	AAC	2	6	8245	8250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497096
117	NC_000948	TTA	2	6	8267	8272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497097
118	NC_000948	TTA	2	6	8502	8507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497097
119	NC_000948	TTG	2	6	8519	8524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497097
120	NC_000948	AAT	2	6	8526	8531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497097
121	NC_000948	AAT	2	6	8611	8616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497097
122	NC_000948	TTG	2	6	8627	8632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497097
123	NC_000948	TCA	2	6	8686	8691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497097
124	NC_000948	TGA	2	6	8768	8773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497098
125	NC_000948	TGC	2	6	9012	9017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497099
126	NC_000948	TAG	2	6	9141	9146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497099
127	NC_000948	AGA	2	6	9259	9264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497099
128	NC_000948	TTG	2	6	9368	9373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497099
129	NC_000948	GGA	2	6	9433	9438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497099
130	NC_000948	GAA	2	6	9469	9474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497099
131	NC_000948	ATT	2	6	9553	9558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497099
132	NC_000948	AGA	2	6	9594	9599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497099
133	NC_000948	GTG	2	6	9707	9712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497099
134	NC_000948	AGC	2	6	9718	9723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497099
135	NC_000948	AAG	2	6	9790	9795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497099
136	NC_000948	AGA	2	6	9819	9824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497099
137	NC_000948	GAT	2	6	9882	9887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497099
138	NC_000948	AAT	2	6	9934	9939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497099
139	NC_000948	ACT	2	6	9997	10002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497099
140	NC_000948	TAA	2	6	10029	10034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497099
141	NC_000948	ATT	2	6	10075	10080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497099
142	NC_000948	ATT	2	6	10121	10126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497099
143	NC_000948	AAG	2	6	10199	10204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497099
144	NC_000948	TAA	3	9	10315	10323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497100
145	NC_000948	AAT	2	6	10411	10416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497100
146	NC_000948	TAA	2	6	10425	10430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497100
147	NC_000948	GTT	2	6	10569	10574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497100
148	NC_000948	ATT	2	6	10593	10598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497100
149	NC_000948	AAC	2	6	10764	10769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497100
150	NC_000948	TAC	2	6	10959	10964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497101
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152	NC_000948	ATC	2	6	11054	11059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497101
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155	NC_000948	TTA	2	6	11327	11332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497101
156	NC_000948	TTC	2	6	11345	11350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497101
157	NC_000948	AAG	2	6	11370	11375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497101
158	NC_000948	AGG	2	6	11403	11408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497101
159	NC_000948	ATT	2	6	11471	11476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497101
160	NC_000948	AGA	2	6	11644	11649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497101
161	NC_000948	CAA	2	6	11672	11677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497101
162	NC_000948	AGA	2	6	11869	11874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497101
163	NC_000948	AAG	2	6	11981	11986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497102
164	NC_000948	AAG	2	6	12062	12067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497102
165	NC_000948	TAC	2	6	12161	12166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497102
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167	NC_000948	AAT	2	6	12295	12300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497102
168	NC_000948	ATA	2	6	12347	12352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497102
169	NC_000948	AAT	2	6	12513	12518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497069
170	NC_000948	TAA	2	6	12533	12538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497069
171	NC_000948	TTG	2	6	12550	12555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497069
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174	NC_000948	TAA	2	6	12736	12741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497069
175	NC_000948	ACT	2	6	12750	12755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497069
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179	NC_000948	TCT	2	6	12965	12970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497070
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186	NC_000948	ATT	2	6	13457	13462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497070
187	NC_000948	ATG	2	6	13641	13646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497070
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194	NC_000948	ATT	2	6	14243	14248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497071
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220	NC_000948	ATA	2	6	15978	15983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497075
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222	NC_000948	CAC	2	6	16134	16139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	364556430
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225	NC_000948	ATC	2	6	16412	16417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	364556430
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236	NC_000948	ATC	2	6	17238	17243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497078
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241	NC_000948	AGA	2	6	17393	17398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497078
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244	NC_000948	ATG	2	6	17467	17472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497078
245	NC_000948	ATG	2	6	17497	17502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497078
246	NC_000948	ATG	2	6	17563	17568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497078
247	NC_000948	CAA	2	6	17574	17579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497078
248	NC_000948	AAT	2	6	17643	17648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497078
249	NC_000948	TAC	2	6	17654	17659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497078
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252	NC_000948	TAT	2	6	17843	17848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497079
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255	NC_000948	AAT	2	6	18000	18005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497079
256	NC_000948	TAT	2	6	18014	18019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497079
257	NC_000948	TGT	2	6	18024	18029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497079
258	NC_000948	CTT	2	6	18065	18070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497079
259	NC_000948	TAA	3	9	18082	18090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497079
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392	NC_000948	GAA	2	6	27303	27308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497062
393	NC_000948	GAA	2	6	27330	27335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497062
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395	NC_000948	AAG	2	6	27397	27402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497062
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.